应用残差网络识别新型持久性有机污染物与持久性可生物累积毒性化学品

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    42007313
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    16.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    D0707.环境地球化学
  • 结题年份:
    2022
  • 批准年份:
    2020
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2021-01-01 至2022-12-31

项目摘要

Identify potential persistent organic pollutants (POPs) and persistent bioaccumulative toxic substances (PBTs) from mainstream industrial chemicals is essential for chemical risk assessment, management, and pollutant control. With the domestic industry moving towards the upstream of the industrial chain, China will gradually become the center of R&D, production, and usage of newly synthetic chemicals. However, most current researches in the field of environmental chemistry are focused on known POPs / PBTs, and the identification and recognition of new POPs / PBTs are still in the state of following the western countries. Thus, it is necessary to develop new identification methods for POPs / PBTs control in order to fulfill the international management and control commitment of POPs / PBTs and protect the domestic ecological environment and public health. In the proposed study, a deep residual network is introduced to develop an 'in-silico' modeling method for POPs/PBTs identification. By using QSAR/QSPR theory, complex chemical spatial structure and element composition information is transformed into quantitative data information through molecular descriptors, and the combination and functional relationship of different molecular descriptors are examined through deep residual neural network to find structural characteristics related to POPs / PBTs attributes, and then utilizes these learned features identify potential new POPs / PBTs in the domestic industrial chemical inventory.
识别主流工业化学品中的潜在持久性有机污染物(POPs)和持久性可生物累积毒性化学品(PBTs),对化学品风险评估、管理和污染控制有着至关重要的意义。随着国内工业体系不断向产业链上游移动,中国逐渐成为新型化学品的研发、生产与使用中心。然而,目前国内环境化学领域绝大部分研究均围绕已知的POPs/PBTs展开,对于新型POPs/PBTs的鉴定和识别研究尚处于跟随欧美发达国家的状态。为了更有效的履行我国对POPs/PBTs的国际管控承诺,保护国内生态环境及人口健康,有必要开发新型POPs/PBTs的鉴定与识别方法。本研究依据定量-构效理论,将复杂的化学品空间及元素组成信息通过分子描述符转化为量化数据信息,运用深度残差神经网络对不同的分子描述符的组合与函数关系进行深度数据挖掘,寻找与POPs/PBTs属性相关的化学品结构特征,进而鉴定和识别潜在的新型POPs/PBTs。

结项摘要

识别主流工业化学品中的潜在持久性有机污染物(POPs)和持久性可生物累积毒性化学品(PBTs),对化学品风险评估、管理和污染控制有着至关重要的意义。然而,目前国内环境化学领域绝大部分研究均围绕已知的POPs/PBTs展开,对于新型POPs/PBTs的鉴定和识别研究尚处于跟随欧美发达国家的状态。为了更有效的履行我国对POPs/PBTs的国际管控承诺,保护国内生态环境及人口健康,本研究依据定量-构效理论,将复杂的化学品空间及元素组成信息通过分子描述符转化为量化数据信息,运用深度残差神经网络对不同的分子描述符的组合与函数关系进行深度数据挖掘,寻找与POPs/PBTs属性相关的化学品结构特征,进而鉴定和识别潜在的新型POPs/PBTs。本研究首先构建了包含111852种有机化合物的数据库。参考斯德哥尔摩公约、欧盟PBTs清单,以及相关文献研究成果,对其中11299种化合物进行了辨识和标记。其中包含1309种POPs/PBTs及9990种非POPs/PBTs类化合物。运用化学品结构特征运算软件,分析量化化学品的分子结构特征,最终选定2424个有效分子描述符用于组成供神经网络模型学习的数字化分子结构特征。通过引入残差神经网络这一深度学习中的最新科研成果,开发了全新的识别持久性有机污染物及持久性可生物富集有毒化学品(POPs/PBTs)的快速识别模型。该模型对于有机化合物中POPs/PBTs的识别准确率超过95%,其整体鉴定精度、适用范围、以及可靠性均远高于同类研究模型。从上述数据库中初步筛选出了4011种疑似POPs/PBTs类化合物。与此同时,我们通过引入梯度加权类激活映射技术以及导向-反向传播(Grad-CAM)技术,建立了分子空间结构特征与持久性、毒性、以及生物富集能力等化合物特定物理化学性质之间的非线性关系,为潜在新型环境污染物的快速筛查和鉴定提供了全新的思路和途径。

项目成果

期刊论文数量(3)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(2)
Towards a better understanding of deep convolutional neural network processes for recognizing organic chemicals of environmental concern
更好地理解深度卷积神经网络过程,以识别与环境有关的有机化学品
  • DOI:
    10.1016/j.jhazmat.2021.126746
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
    Journal of Hazardous Materials
  • 影响因子:
    13.6
  • 作者:
    Xiangfei Sun;Xianming Zhang;Luyao Wang;Yuanxin Li;Derek C.G. Muir;Eddy Y. Zeng
  • 通讯作者:
    Eddy Y. Zeng
Predicted health and environmental hazards of liquid crystal materials via quantitative structure-property relationship modeling
通过定量结构-性能关系建模预测液晶材料的健康和环境危害
  • DOI:
    10.1016/j.jhazmat.2022.130592
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
    Journal of Hazardous Materials
  • 影响因子:
    13.6
  • 作者:
    Jingjing Feng;Xiangfei Sun;Eddy Zeng
  • 通讯作者:
    Eddy Zeng
Biobased plastic: A plausible solution toward carbon neutrality in plastic industry?
生物基塑料:塑料行业碳中和的可行解决方案?
  • DOI:
    10.1016/j.jhazmat.2022.129037
  • 发表时间:
    2022-04
  • 期刊:
    Journal of Hazardous Materials
  • 影响因子:
    13.6
  • 作者:
    Xiangfei Sun;Meng-Yi Xie;Lei Mai;Eddy Y. Zeng
  • 通讯作者:
    Eddy Y. Zeng

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其他文献

谷子2个试点农艺性状和食味品质的变异研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    种子
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    邵松青;徐文俊;孙翔飞;郭世华
  • 通讯作者:
    郭世华

其他文献

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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