DNA数据挖掘中的组合理论与算法设计

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号：
    60673059
  • 项目类别：
    面上项目
  • 资助金额：
    27.0万
  • 负责人：
    李国君
  • 依托单位：
    山东大学
  • 学科分类：
    F0201.计算机科学的基础理论
  • 结题年份：
    2009
  • 批准年份：
    2006
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2007-01-01 至2009-12-31

项目摘要

各领域科学技术的进步极大地促进了生命科学的发展. 同时,也产生了大量的生物学数据. 如何从这浩如烟海的数据中发掘生命的信息,已成为未来科学研究的主攻方向. 并由此诞生了研究生命的新的学科- - 生物信息学. 它正在以生物学实验室研究的数据为材料，利用网络和计算机技术，实现对生命本质的研究探索。由此产生的一系列的组合问题和计算问题给数学家和计算机科学家提出了一系列的挑战。DNA数据挖掘中的组合理论与算法设计是近年来生物信息研究领域的主攻方向之一。本项目研究在对海量生物信息处理过程中遇到的各类组合问题。力图用组合数学的方法去解决生物信息学中的离散问题，反过来通过研究生物信息学推动组合数学和理论计算机科学的发展。针对生物信息学中的实际问题，运用组合理论、最优化理论、复杂性理论和算法理论对其进行深入的探索。研究设计并实现全新的有自主知识产权的新算法以及相应的软件，建立有自主知识产权的处理软件平台。

结项摘要

项目成果

期刊论文数量（15）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（0）
专利数量（0）
Sorting signed permutations by fixed-length reversals
通过固定长度反转对有符号排列进行排序
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    International Journal of Foundations of Computer Science
  • 影响因子：
    0.8
  • 作者：
    Qi, Xingqin;Li, Guojun;Liu, Bingqiang;Wu, Jichang
  • 通讯作者：
    Wu, Jichang
二分图中含有大圈的2-因子
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    山东大学学报(理学版)
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    李国君;高云澍
  • 通讯作者：
    高云澍
正则多部竞赛图中的分量共轭圈
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    计算机工程与应用42(17):7-8,2006
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    何志红;李国君
  • 通讯作者：
    李国君
极小化加权完工时间和的无界批量机器并行调度问题(英文)
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    软件学报
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    李国君;王秀红;李曙光
  • 通讯作者：
    李曙光
瓶颈Steiner网络设计问题的算法研究
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    计算机工程
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    李国君;王继强
  • 通讯作者：
    王继强

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其他文献

A vertex cover with chorded 4-cycles
带弦 4 周期的顶点覆盖
  • DOI：
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  • 发表时间：
    2011-11
  • 期刊：
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  • 影响因子：
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  • 作者：
    高云澍;李国君;颜谨
  • 通讯作者：
    颜谨
基于光学遥感卫星影像的南极冰流速产品和方法研究综述
  • DOI：
    10.11947/j.agcs.2022.20220168
  • 发表时间：
    2022
  • 期刊：
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  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    李荣兴;李国君;冯甜甜;沈强;乔刚;叶真;夏梦莲
  • 通讯作者：
    夏梦莲
Every cycle-connected multipartite tournament with $\delta\geq 2$contains at least two universal arcs
每个具有 $\delta\geq 2$ 的循环连接的多方锦标赛包含至少两个通用弧
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2013
  • 期刊：
    Graphs and Combinatorics
  • 影响因子：
    0.7
  • 作者：
    邹青松;李国君;高云澍
  • 通讯作者：
    高云澍
格子-Boltzmann方法模拟霜结晶生长
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2013
  • 期刊：
    低温工程
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    龚建英;孙金绢;李国君
  • 通讯作者：
    李国君
透平级内动静干涉对凝结特性影响
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    工程热物理学报, 28(suppl.1): 89-92, 2007
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    李 亮;丰镇平;李国君
  • 通讯作者：
    李国君

其他文献

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AI技术路线图

李国君的其他基金

基于图与组合优化的生物数据和网络数据挖掘算法研究
  • 批准号：
  • 批准年份：
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原核生物转录因子结合位点的算法预测及应用
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    面上项目
基于串线的3-维蛋白结构预测的新技术研究
  • 批准号：
    60873207
  • 批准年份：
    2008
  • 资助金额：
    35.0 万元
  • 项目类别：
    面上项目
近似算法的设计与分析
  • 批准号：
    60373025
  • 批准年份：
    2003
  • 资助金额：
    18.0 万元
  • 项目类别：
    面上项目
图论与组合技术在理论计算机科学中的应用
  • 批准号：
    10271065
  • 批准年份：
    2002
  • 资助金额：
    10.5 万元
  • 项目类别：
    面上项目
图的连通因子与正交因子分解问题及其算法研究
  • 批准号：
    19971053
  • 批准年份：
    1999
  • 资助金额：
    8.0 万元
  • 项目类别：
    面上项目

相似国自然基金

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  • 批准号：
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  • 批准年份：
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相似海外基金

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知道了

AI项目解读示例

课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
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