基于串线的3-维蛋白结构预测的新技术研究

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AI项目解读

基本信息

  • 批准号：
    60873207
  • 项目类别：
    面上项目
  • 资助金额：
    35.0万
  • 负责人：
    李国君
  • 依托单位：
    山东大学
  • 学科分类：
    F0213.生物信息计算与数字健康
  • 结题年份：
    2011
  • 批准年份：
    2008
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2009-01-01 至2011-12-31

项目摘要

本项目计划研制一种新的基于串线技术的3-维蛋白结构预测的计算方案。传统的基于串线的蛋白结构计算技术只能利用碱基(residue)水平的信息，而忽略了原子（侧连）水平的信息。虽然在过去的十年里基于碱基水平的结构预测在计算方面取得了较大进步，但在预测精度方面给我们提出了新的挑战。为了跟上结构和功能基因组研究的快速发展，迫切需要新的更高精度的结构预测技术。为此，我们正在研究一种新的串线技术以充分利用原子水平的信息来提高预测精度，最终实现碱基和侧连同时地被准确定位。着重考虑如下几个方面：1、研究适合碱基和侧连同时定位的更有效的能量函数；2、研究新的计算策略以最小化上述能量函数，并实现碱基和侧连同时定位，即确定被测氨基酸序列和蛋白结构平台间的最优有序配对，以及每个碱基的侧连和平台可达构型位置间的最优定位；3、评估新的能量函数和算法来证实侧连在结构预测中的有威力；4、设计编辑软件，搭建网络服务平台。

结项摘要

项目成果

期刊论文数量（1）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（0）
专利数量（0）

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其他文献

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  • 作者：
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  • 通讯作者：
    高云澍
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  • 发表时间：
    2013
  • 期刊：
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  • 影响因子：
    --
  • 作者：
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  • 通讯作者：
    李国君
透平级内动静干涉对凝结特性影响
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    工程热物理学报, 28(suppl.1): 89-92, 2007
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    李 亮;丰镇平;李国君
  • 通讯作者：
    李国君

其他文献

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AI项目解读示例

课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
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