RNA甲基化修饰对体细胞重编程的调控作用及机制研究

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AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31471395
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    90.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C1201.干细胞基础研究
  • 结题年份:
    2018
  • 批准年份:
    2014
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2015-01-01 至2018-12-31

项目摘要

Technique of somatic reprogramming, especially induced pluripotent stem (iPS), play an important role in the stem cell research and regeneration medicine. But the epigenetic mechanism and pathway of the action to reprogram somatic cells are even dimness. N6-methyladenosine (m6A) is a commonly existed epitranscriptomic marker on RNAs in eukaryotes, yet its features, regulatory mechanisms and biological functions are largely unknown. Our prvious work showed that inhibition of m6A formation impedes the reprogramming process of mouse embryonic fibroblasts (MEFs), indicating that m6A may play important roles in cell fate determination. In this project, we will compare RNA methylation as well as gene expression status of several time points in the reprogramming process, to identify key regulatory factors involved in the regulation of the efficiency of iPS through RNA methylation, to decipher the regulatory mechanisms of these key factors, to develop new methods that can increase the efficiency of iPS and establish high efficient method for cell reprogramming.
体细胞编程与重编程机制研究是干细胞研究领域最重要的科学问题之一,在相应的调控中,表观遗传修饰发挥着关键的作用。近一两年,随着对真核生物中RNA甲基化修饰6-甲基腺嘌呤(m6A)的调节功能的发现,RNA 修饰也受到越来越多研究人员的关注,成为表观遗传研究领域新的热点。然而目前RNA 甲基化修饰与体细胞重编程的关系的研究领域还是空白。我们的前期工作发现抑制m6A甲基化转移酶会明显抑制重编程效率,且发现在ES细胞和iPS细胞普遍存在多能性因子的m6A修饰现象。本项目拟以m6A甲基化修饰对iPS的调控为研究对象,通过改变m6A修饰影响iPS效率,同时检测iPS过程中多能性因子的m6A修饰的动态变化,阐明m6A修饰对iPS效率影响的机制。开发通过m6A修饰调控iPS效率的新方法,从而推动重编程和干细胞应用等研究领域的进展。

结项摘要

细胞编程与重编程机制研究是干细胞研究领域最重要的科学问题之一,在相应的调控中,表观遗传修饰发挥着关键的作用。近年来,随着对真核生物中RNA甲基化修饰6-甲基腺嘌呤(m6A)的调节功能的发现,RNA修饰也受到越来越多研究人员的关注,成为表观遗传研究领域新的热点。然而目前RNA 甲基化修饰在体细胞重编程中的作用及其机制还不清楚。我们的前期工作发现抑制m6A甲基化转移酶会明显抑制重编程效率,且发现在胚胎干细胞(ES细胞)和诱导多能干细胞(iPS细胞)普遍存在多能性因子的m6A修饰现象。本项目主要研究并取得了以下结果:1)按照序列匹配找到了可能调控多能因子m6A 修饰的miRNA;2)可能调控多能因子m6A修饰的miRNA可以提高细胞重编程效率;3)可能调控多能因子m6A修饰的miRNA诱导得到的iPS细胞具有多能性;4)敲除甲基化结合蛋白MeCP2可以显著提高细胞重编程效率及其机制研究;5)m6A RNA甲基化转移酶Mettl3条件敲除导致小鼠生殖及神经发育障碍。我们的工作阐明了RNA甲基化修饰对iPS效率的影响及潜在的分子机制,开发了提高iPS效率的新方法,推动了重编程和干细胞应用等研究领域的进展。

项目成果

期刊论文数量(16)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Human embryonic stem cells contribute to embryonic and extraembryonic lineages in mouse embryos upon inhibition of apoptosis.
人胚胎干细胞通过抑制细胞凋亡促进小鼠胚胎中的胚胎和胚胎外谱系
  • DOI:
    10.1038/cr.2017.138
  • 发表时间:
    2018-01
  • 期刊:
    Cell research
  • 影响因子:
    44.1
  • 作者:
    Wang X;Li T;Cui T;Yu D;Liu C;Jiang L;Feng G;Wang L;Fu R;Zhang X;Hao J;Wang Y;Wang L;Zhou Q;Li W;Hu B
  • 通讯作者:
    Hu B
Lower genomic stability of induced pluripotent stem cells reflects increased non-homologous end joining.
诱导多能干细胞的基因组稳定性较低反映了非同源末端连接的增加
  • DOI:
    10.1186/s40880-018-0313-0
  • 发表时间:
    2018-07-25
  • 期刊:
    Cancer communications (London, England)
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Zhang M;Wang L;An K;Cai J;Li G;Yang C;Liu H;Du F;Han X;Zhang Z;Zhao Z;Pei D;Long Y;Xie X;Zhou Q;Sun Y
  • 通讯作者:
    Sun Y
Overexpression of Stella improves the efficiency of nuclear transfer reprogramming
Stella 的过度表达提高了核转移重编程的效率
  • DOI:
    10.1016/j.jgg.2017.06.001
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    Journal of Genetics and Genomics
  • 影响因子:
    5.9
  • 作者:
    Wang Leyun;Teng Fei;Yuan Xuewei;Liu Chao;Wang Jiaqiang;Li Yufei;Cui Tongtong;Li Ti;a;Liu Zhonghua;Zhou Qi
  • 通讯作者:
    Zhou Qi
Generation of Bimaternal and Bipaternal Mice from Hypomethylated Haploid ESCs with Imprinting Region Deletions
从印记区域缺失的低甲基化单倍体 ESC 产生双母和双父小鼠
  • DOI:
    10.1016/j.stem.2018.09.004
  • 发表时间:
    2018-11-01
  • 期刊:
    CELL STEM CELL
  • 影响因子:
    23.9
  • 作者:
    Li, Zhi-Kun;Wang, Le-Yun;Hu, Bao-Yang
  • 通讯作者:
    Hu, Bao-Yang
New stem cell types for versatile applications
适用于多种应用的新型干细胞
  • DOI:
    10.1093/nsr/nwx054
  • 发表时间:
    2017-07
  • 期刊:
    National Science Review
  • 影响因子:
    20.6
  • 作者:
    Li W;Zhou Q
  • 通讯作者:
    Zhou Q

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再生生物医学发展战略研究(2021-2035)
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AI项目解读示例

课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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