基于生物芯片表达谱数据的水稻磷响应关键功能基因的生物信息学挖掘

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AI项目解读

基本信息

  • 批准号：
    30771326
  • 项目类别：
    面上项目
  • 资助金额：
    30.0万
  • 负责人：
    陈铭
  • 依托单位：
    浙江大学
  • 学科分类：
    C1307.作物基因组及遗传学
  • 结题年份：
    2010
  • 批准年份：
    2007
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2008-01-01 至2010-12-31

项目摘要

水稻对磷的高效吸收利用的研究是水稻生长、发育生物学的重要命题；同时对基因工程改良植物对养分水分的高效吸收具有重要的理论指导意义。本项目研究利用生物信息学技术，基于大规模基因芯片表达谱数据的分析，通过对水稻芯片基因的多功能注释，对基因芯片基因调控网络的构建和分析，实现了水稻磷响应关键功能基因的生物信息学挖掘和系统分析。为揭示水稻遗传型到表型的过程机理，尤其是水稻如何响应磷信号而影响其生长和代谢的机制打下基础。

结项摘要

项目成果

期刊论文数量（17）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（0）
专利数量（0）
RNA editing of nuclear transcripts in Arabidopsis thaliana.
拟南芥核转录本的 RNA 编辑
  • DOI：
    10.1186/1471-2164-11-s4-s12
  • 发表时间：
    2010-12-02
  • 期刊：
    BMC genomics
  • 影响因子：
    4.4
  • 作者：
    Meng Y;Chen D;Jin Y;Mao C;Wu P;Chen M
  • 通讯作者：
    Chen M
VIRS: A Visual Tool for Identifying Restriction Sites in Multiple DNA Sequences
VIRS：用于识别多个 DNA 序列中限制性位点的可视化工具
  • DOI：
    10.1002/btpr.259
  • 发表时间：
    2009-09-01
  • 期刊：
    BIOTECHNOLOGY PROGRESS
  • 影响因子：
    2.9
  • 作者：
    Chen，Xiang;Luo，Cong;Chen，Ming
  • 通讯作者：
    Chen，Ming
Epigenetic performers in plants
植物中的表观遗传表演者
  • DOI：
    10.1111/j.1440-169x.2010.01192.x
  • 发表时间：
    2010-08-01
  • 期刊：
    DEVELOPMENT GROWTH & DIFFERENTIATION
  • 影响因子：
    2.5
  • 作者：
    Chen, Ming;Lv, Shaolei;Meng, Yijun
  • 通讯作者：
    Meng, Yijun
Mechanisms of microRNA-mediated auxin signaling inferred from the rice mutant osaxr
从水稻突变体 osaxr 推断 microRNA 介导的生长素信号传导机制
  • DOI：
    10.4161/psb.5.3.10549
  • 发表时间：
    2010-03
  • 期刊：
    Plant Signal Behav
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    D. Chen;C. Mao;J. Cao;X. Ma;Y. Meng;M. Chen;P. Wu
  • 通讯作者：
    P. Wu
OsCAS: a comprehensive web-based annotation platform for rice microarray data
OsCAS：基于网络的水稻微阵列数据综合注释平台
  • DOI：
    10.1007/s13206-010-4102-3
  • 发表时间：
    2010-03-20
  • 期刊：
    BIOCHIP JOURNAL
  • 影响因子：
    4.3
  • 作者：
    Shi，Qingyun;Meng，Yijun;Chen，Ming
  • 通讯作者：
    Chen，Ming

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  • 作者：
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  • 通讯作者：
    许金森

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  • 项目类别：
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课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
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