桃垂枝性状的精细定位及关键基因的解析

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31901979
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    25.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C1502.果树种质资源与遗传育种学
  • 结题年份:
    2022
  • 批准年份:
    2019
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2020-01-01 至2022-12-31

项目摘要

Peach is facing the challenges of labor shortage. One of the world's breeding objectives was to breed reasonable structure trees which could meet various cultivation modes, simplify pruning methods and reduce labor costs. Although physiological, biochemical and related genes of different tree structure of peach have been studied,the progress of genetic improvement and utilization in weeping peach was slow. Weeping peach was difficult to identify at seedling stage. To establish molecular assisted selection system for target traits and genetic improvement exactly, we need to find the genetic mechanism of the formation of weeping traits and fine map the weeping gene of peach. In this study, F2 population with well-separated traits with 163 seedlings was used as experimental material and pl was located in LG4 by BSA-seq.Bioinformatics analysis in the pl region predicted a novel mechanism underling weeping traits comparing to the known report.Molecular markers were developed on a large scale on the basis of preliminary location. After screening and fine mapping, candidate genes for weeping branch traits were obtained. Effective markers for marker assisted selection (MAS) and the key gene of weeping branch will be discovered. The moleculer mechanism of weeping traits was analyzed for targeted breeding of weeping ornamental peach and rootstock.
随着劳动力匮乏,选育结构合理、满足各种栽培模式的树型,简化修剪方式,减少人工成本是世界桃育种目标之一。桃树型虽然开展了生理生化和相关基因的研究,但垂枝桃的遗传改良和利用进展缓慢。桃的垂枝性状很难实现早期表型鉴定,明确垂枝性状形成的遗传机制并对桃垂枝基因进行精细定位,是建立垂枝性状分子辅助选种体系和遗传改良的前提。为了挖掘控制桃垂枝性状的关键基因,本研究前期利用163株性状分离良好的F2群体为试验材料,通过BSA重测序将pl初定位于第4连锁群。生物信息学预测桃垂枝的分子机制可能有别于已经报道的果树。本项目继续立足于隐性遗传的桃垂枝性状,大规模分子标记开发筛选后进行精细定位,对垂枝性状进行候选基因的挖掘。预期结果是开发有效的MAS标记,明确垂枝性状的关键基因,为有目标的选育垂枝观赏桃和砧木品种奠定基础。

结项摘要

垂枝桃作为桃的一个变种,枝条下垂不仅具有观赏价值,且其基因的挖掘和机理的发现为开发特异的树型,研究植物生长内在规律打下基础。垂枝桃虽然机理方面开展了生理生化和相关基因的研究,但垂枝桃的遗传改良和利用进展缓慢。桃的垂枝性状很难实现早期表型鉴定,明确垂枝性状形成的遗传机制并对桃垂枝基因进行精细定位,是建立垂枝性状分子辅助选种体系和遗传改良的前提。本研究前期利用F2群体为试验材料,通过BSA重测序将pl初定位于第4连锁群。通过本项目实施,对pl位点进行了精细定位,将其缩小到1M以内,并且筛选出10个候选基因,获得一个KASP分子标记,且认为生长素在垂枝性状发育过程中起重要作用,为后期进一步有目标的开展选育垂枝观赏桃和砧木品种奠定基础。

项目成果

期刊论文数量(2)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Genome-Wide Identification and Expression Analysis of the PpYUCCA Gene Family in Weeping Peach Trees (Prunus persica 'Pendula')
垂桃(Prunus persica var. Pendula)PpYUCCA 基因家族的全基因组鉴定和表达分析
  • DOI:
    10.3390/horticulturae8100878
  • 发表时间:
    2022-10-01
  • 期刊:
    HORTICULTURAE
  • 影响因子:
    3.1
  • 作者:
    Zhang,Yuyan;Mao,Qinsi;Yu,Mingliang
  • 通讯作者:
    Yu,Mingliang
白花水蜜桃在我国桃育种中的应用
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    特种经济动植物
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    张妤艳
  • 通讯作者:
    张妤艳

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其他文献

梨SRAP-PCR反应体系的建立与优化
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  • 发表时间:
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  • 期刊:
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  • 作者:
    吴俊;张妤艳;张绍铃
  • 通讯作者:
    张绍铃
八月酥等14个梨品种自交不亲和基因(S基因)型的鉴定
  • DOI:
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  • 发表时间:
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  • 期刊:
    果树学报
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  • 作者:
    张绍铃;张妤艳;张瑞萍;吴俊;李秀根
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    李秀根
12个梨品种S基因型的鉴定
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  • 通讯作者:
    张妤艳
基于SSR标记的梨资源遗传多样性分析
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  • 发表时间:
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  • 期刊:
    农业生物技术学报
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  • 作者:
    张妤艳;张绍铃;吴俊
  • 通讯作者:
    吴俊

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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