鲍曼不动杆菌表面多糖抗原变异机制的研究及分子血清学分型体系的建立

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31371259
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    110.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0602.基因表达及非编码序列调控
  • 结题年份:
    2017
  • 批准年份:
    2013
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2014-01-01 至2017-12-31

项目摘要

Surface polysaccharide antigen (an important virulence factor), presents as a major part of the outer membrane of bacteria and exhibits one of the richest diversities in nature due to long-term selection pressures from host immune systems. It is also the basis for bacterial serotyping. The gene cluster responsible for the synthesis of surface polysaccharide antigen is one of the most variable regions in bacterial chromosome, and is one of the most suitable materials for studying the laws of evolutionary routes that are relevant in pathogenic bacteria.Bacteria belonging to the species Acinetobacter baumannii are among the most problematic nosocomial pathogens. However, there is no systematic study on the A. baumannii surface polysaccharide antigen diversity. There is also no reliable serotyping system for A. baumannii. In this project, we will localize the surface polysaccharide antigen gene cluster on the genome of A. baumannii for the first time, and sequence and analyze all surface polysaccharide antigen gene clusters (>50). We will also identify the function of several sugar synthesis genes in biochemical level, and the result will be useful to understand the synthesis process of A. baumannii surface polysaccharide antigen. We will comprehensively analyze the evolutionary mechanism of all surface polysaccharide antigens in A. baumannii, especially which are closely related with pathogenic strains. The data obtained in this project will provide a basis for understanding the evolution and variation of bacterial pathogens. We will also develop a molecular serotyping system for A. baumannii, which will be very useful for rapid detection of the clinical pathogenic bacteria and epidemiological survey.
细菌表面多糖抗原是细菌的主要表面成分和重要致病因子,其在宿主免疫系统的长期选择压力下形成了生物界最丰富的多样性之一,该多样性是细菌血清学分型的基础。负责多糖抗原合成的基因簇是细菌染色体上最具多变性的区域,也是研究致病菌进化规律的良好材料。鲍曼不动杆菌是重要的院内感染致病菌,但尚缺乏对该菌表面多糖抗原多样性的系统研究,也无相应的成熟血清学分型体系。本项目将首次定位鲍曼不动杆菌的表面多糖抗原基因簇位点;破译并分析该菌中存在的所有表面多糖抗原基因簇(50种以上);功能鉴定新发现的糖合成基因,以认识该菌表面多糖抗原的合成机制。将整体性解析鲍曼不动杆菌表面多糖抗原的多样性进化机制,重点研究其中与致病性密切相关的多糖抗原的形成机理,并以此为基础认识该菌的变异机制。将首次建立鲍曼不动杆菌分子血清学分型系统和快速检测方法,可为鲍曼不动杆菌的检测、流行病学调查、溯源等提供技术保障。

结项摘要

细菌表面多糖抗原是细菌的主要表面成分和重要致病因子,其在宿主免疫系统的长期选择压力下形成了生物界最丰富的多样性之一,该多样性是细菌血清学分型的基础。负责多糖抗原合成的基因簇是细菌染色体上最具多变性的区域,也是研究致病菌进化规律的良好材料。鲍曼不动杆菌是重要的院内感染致病菌,但尚缺乏对该菌表面多糖抗原多样性的系统研究,也无相应的成熟血清学分型体系。.本项目顺利完成了全部研究任务。我们首次定位了鲍曼不动杆菌的表面多糖抗原基因簇在基因组上的位置,发现基因簇位于2个持家基因fkpA和lldP之间,全面分析了25个血清型鲍曼不动杆菌表面多糖抗原基因簇;解析了基因簇的组成和结构特征:两端具有多个保守基因,而中间负责罕见糖合成和连接的区域则具有高度多样性。解析了8个血清型鲍曼不动杆菌表面多糖抗原的化学结构,这些化学结构均与各自的表面多糖抗原基因簇较好对应,进一步证明了我们发现的鲍曼不动杆菌表面多糖抗原基因簇位点的正确性。此外,我们还生化鉴定了鲍曼不动杆菌中2种罕见单糖的合成途径,并完成了3个糖基转移酶的生化功能鉴定,为开发针对鲍曼不动杆菌的特异性疫苗和抗菌素提供了基础。上述发现对认识鲍曼不动杆菌表面多糖抗原多样性扩散的方式具有重要意义。通过对Genbank上190株鲍曼不动杆菌的基因组数据进行分析,新发现了52种表面多糖抗原基因簇形式,将鲍曼不动杆菌表面多糖抗原基因簇的形式扩展至77个,进一步扩展了我们对于鲍曼不动杆菌多样性的认识。基于表面多糖抗原基因簇中的特异基因,开发了基于luminex 200平台的鲍曼不动杆菌血清学分型液相芯片检测体系,并完成了特异性、灵敏度、双盲实验等性能评价,为鲍曼不动杆菌的检测、流行病学调查、溯源等奠定了技术基础。研究成果发表SCI收录论文10篇。

项目成果

期刊论文数量(10)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Signal transduction pathway mediated by the novel regulator LoiA for low oxygen tension induced Salmonella Typhimurium invasion.
新型调节剂LoiA介导的低氧张力诱导鼠伤寒沙门氏菌侵袭的信号转导通路
  • DOI:
    10.1371/journal.ppat.1006429
  • 发表时间:
    2017-06
  • 期刊:
    PLoS pathogens
  • 影响因子:
    6.7
  • 作者:
    Jiang L;Feng L;Yang B;Zhang W;Wang P;Jiang X;Wang L
  • 通讯作者:
    Wang L
Structures of the K35 and K15 capsular polysaccharides of Acinetobacter baumannii LUH5535 and LUH5554 containing amino and diamino uronic acids
含有氨基和二氨基糖醛酸的鲍曼不动杆菌LUH5535和LUH5554的K35和K15荚膜多糖的结构
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    Carbohydrate Research
  • 影响因子:
    3.1
  • 作者:
    Alex;er S.Shashkov;Bin Liu;Johanna J.Kenyon;Anastasiya V.Popova;Mikhail M.Shneider;Sof'ya N.Senchenkova;Nikolay P.Arbatsky;Konstantin A.Miroshnikov;Lei Wang;Yuriy A.Knirel
  • 通讯作者:
    Yuriy A.Knirel
Genetic Diversity of O-Antigens in Hafnia alvei and the Development of a Suspension Array for Serotype Detection.
蜂房哈夫尼亚 O 抗原的遗传多样性及用于血清型检测的悬浮芯片的开发
  • DOI:
    10.1371/journal.pone.0155115
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    PloS one
  • 影响因子:
    3.7
  • 作者:
    Duan Z;Niedziela T;Lugowski C;Cao B;Wang T;Xu L;Yang B;Liu B;Wang L
  • 通讯作者:
    Wang L
Transcriptional adaptation of Shigella flexneri during adherence to epithelial cells
福氏志贺氏菌在粘附上皮细胞过程中的转录适应
  • DOI:
    10.1002/jobm.201400414
  • 发表时间:
    2015-02
  • 期刊:
    Journal of Basic Microbiology
  • 影响因子:
    3.1
  • 作者:
    Zhiwei Ni;Lingyan Jiang;Lu Feng;Lei Wang;Bin Liu
  • 通讯作者:
    Bin Liu
Acinetobacter baumannii K11 and K83 capsular polysaccharides have the same 6-deoxy-L-talose-containing pentasaccharide K units but different linkages between the K units
鲍曼不动杆菌K11和K83荚膜多糖具有相同的含6-脱氧-L-塔罗糖的五糖K单元,但K单元之间的连接不同
  • DOI:
    10.1016/j.ijbiomac.2017.05.082
  • 发表时间:
    2017-10-01
  • 期刊:
    INTERNATIONAL JOURNAL OF BIOLOGICAL MACROMOLECULES
  • 影响因子:
    8.2
  • 作者:
    Kenyon, Johanna J.;Shashkov, Alexander S.;Hall, Ruth M.
  • 通讯作者:
    Hall, Ruth M.

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  • 作者:
    王亚凤;何瑞杰;颜小捷;王磊;李典鹏;黄永林
  • 通讯作者:
    黄永林

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

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AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
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          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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