LncRNA-MEG3对猪骨骼肌细胞增殖的作用及调控机制

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AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31372295
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    80.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C1702.家畜种质资源与遗传育种学
  • 结题年份:
    2017
  • 批准年份:
    2013
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2014-01-01 至2017-12-31

项目摘要

Cell proliferation is genetic basis for growth and development of animal and plant organism.Previous studies documented that there were significantly different proliferation activity of myoblast between pig breeds with variant phenotype, long no-coding RNA materally expressed gene 3 (lncRNA-MEG3) can inhibit cell proliferation in tumorigenesis. We firstly found that MEG3 was differently expressed during skeletal muscle development, and exhibited variant expression pattern between different breed pigs. Based on above facts, we supposed that lncRNA-MEG3 play an important role in skeletal muscle development, and maybe contribute to difference in cell proliferation activity and growth of skeletal muscle between pig breeds with different phenotype. In this study, we will analyze dynamic expression pattern of MEG3 during skeletal muscle development and its correlation with myoblast proliferation at molecular, cellular and animal level. Subsequently, the proliferation activity and cell cycle will be measured under over- and down-expression. Combining bioinformatics and experiment methods, we test regulation role of microRNA, transcript factor and DNA methylation in the expression of MEG3, and identify its interaction with target gene. These results will help us to explain the biological role in swine myoblast proliferation and skeletal muscle development for lncRNA-MEG3. Molecular marker and association analysis with meat production traits will be analyzed. This study provide candidate genes in molecular improvement of pigs.
细胞增殖是动植物机体生长发育的基础。研究表明不同类型猪骨骼肌细胞具有不同增殖能力,长链非编码RNA-MEG3(lncRNA-MEG3)在肿瘤细胞中具有抑制细胞增殖的作用。申请者首次发现MEG3在骨骼肌生长发育过程中差异表达,且在不同类型猪中具有不同表达模式。基于此,申请者推测lncRNA-MEG3参与骨骼肌的生长发育,可能对不同类型猪骨骼肌细胞的增殖能力和生长发育差异起重要调控作用。项目将在分子、细胞和个体水平分析MEG3在不同类型猪骨骼肌生长发育中的动态表达模式及其与猪肌细胞增殖的关系,研究过表达和敲低MEG3对肌细胞增殖能力和细胞周期的影响,结合生物信息学和c-KLAN等实验学方法,分析microRNA、转录因子及DNA甲基化对其表达的调控,并鉴定出MEG3的作用靶标,阐明其对猪肌细胞增殖和骨骼肌生长发育的调控机制。通过标记关联分析明确其与猪产肉性状的相关,将为猪分子育种提供候选基因。

结项摘要

细胞增殖是动植物机体生长发育的基础。研究表明不同类型猪骨骼肌细胞具有不同的增殖能力,长链非编码RNA-meg3(lncRNA-Meg3)在肿瘤细胞中具有抑制细胞增殖的作用。申请者首次发现Meg3在骨骼肌生长发育过程中差异表达,且在不同类型猪中具有不同表达模式。基于此,申请推测LncRNA-Meg参与骨骼肌的生长发育,可能对不同类型猪骨骼肌细胞的增殖能力和生长发育差异起重要调控作用。本项目中,申请者利用FISH和核质分离技术,发现lncRNA-Meg3主要在细胞质中表达并发挥功能,其特异性地在猪和小鼠的骨骼肌中高表达,在小鼠和猪骨骼肌发育过程中都表现在胚胎或出生早期高表达,CTX损伤模型分析结果表明Meg3与骨骼肌的损伤重建有关。在C2C12成肌细胞中敲低和过表达Meg3,发现过表达抑制成肌细胞增殖,而敲低则促进成肌细胞增殖,其表达受miRNA-378等调控。利用microarray分析敲低和过表达Meg3的基因表达表明,细胞增殖相关的基因在过表达条件显著下调,进一步证明Meg3对肌细胞的增殖起调控作用。在群体中进行SNP的扫描和基因分型,关联分析表明Meg3与达100公斤体重日龄显著相关。综上所述,lncRNA-Meg3主要通过调控胚胎和出生后早期骨骼肌细胞的增殖来影响骨骼肌的生长发育和肌肉表型,是猪产肉性状的一个候选基因。

项目成果

期刊论文数量(8)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(2)
Comparison analysis ofmiRNA and mRNA profiling of skeletal muscle among three pig breeds
三个猪品种骨骼肌miRNA和mRNA谱的比较分析
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    Mol Genet Genomics
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Xinhua Hou;Yalan Yang;Shiyun Zhu;Chaoju Hua;Rong Zhou;Yulian Mu;Zhonglin Tang;Kui Li
  • 通讯作者:
    Kui Li
Wnt antagonist, secretedfrizzled-related protein is involved in prenatal skeletal muscledevelopment and is a target ofmiRNA-1/206 in pigs
Wnt 拮抗剂、分泌型卷曲相关蛋白参与产前骨骼肌发育,是猪 miRNA-1/206 的靶标
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    BMC Molecular Biology
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Ruiqi Wang;Chuzhao Lei;Rong Zhou;Kui Li
  • 通讯作者:
    Kui Li
SMAD7, antagonist of TGF-beta signaling, is a candidate of prenatal skeletal muscle development and weaning weight in pigs
SMAD7 是 TGF-β 信号传导的拮抗剂,是猪产前骨骼肌发育和断奶体重的候选者
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    Mol Biol Rep
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Chaoju Hua;Zishuai Wang;Jianbing Zhang;Xing Peng;Xinhua Hou;Yalan Yang;Kui Li;Zhonglin Tang
  • 通讯作者:
    Zhonglin Tang
Genome-wide analysis of DNA methylation in obese, lean, and miniature pig breeds.
肥胖猪、瘦猪和小型猪品种 DNA 甲基化的全基因组分析
  • DOI:
    10.1038/srep30160
  • 发表时间:
    2016-07-22
  • 期刊:
    Scientific reports
  • 影响因子:
    4.6
  • 作者:
    Yang Y;Zhou R;Mu Y;Hou X;Tang Z;Li K
  • 通讯作者:
    Li K
Identifying suitable reference genes for expression analysis of developmental skeletal muscle in pigs.
确定用于猪发育骨骼肌表达分析的合适参考基因。
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    Peer J,
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Guanglin Niu;Yalan Yang;YuanYuan Zhang;Chaoju Hua;Zishuai Wang;Zhonglin Tang;Kui Li
  • 通讯作者:
    Kui Li

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其他文献

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microRNA-378的细胞间通讯及其对猪生前骨骼肌生长波的调控
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    2011
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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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