金属蛋白酶ADMATS-13水解酶切血管性血友病因子vWF的力学调控机制

结题报告
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AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    11072080
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    46.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    A1002.多尺度力学生物学
  • 结题年份:
    2013
  • 批准年份:
    2010
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2011-01-01 至2013-12-31

项目摘要

在循环的血液中,血小板的黏附和聚集,不但受到血管性血友病因子vWF与血小板表面受体GPIb相互作用的调控,还受到金属蛋白酶ADAMTS-13的调节,并依赖于血流动力学环境,它涉及力-化学耦合相互作用这一细胞分子生物力学中的前沿科学问题。本项目,我们将结合细胞分子力学建模、数值模拟、定点突变和流动腔实验技术,利用流动腔实验,系统测量高剪应力环境中,血管性血友病因子vWF与金属蛋白酶ADAMTS-13间的反应速率常数、ADAMTS-13的酶切活性和酶切动力学速率,阐明循环的血流中vWF和ADAMTS-13间相互作用的力依赖型反应与酶切动力学机制,旨在揭示出血与血栓形成过程的力-生化协同调控机制及其分子结构基础,以深化相关血管生理学和病理学的理解,进而为相关抗血栓创新药物的开发、血栓性和出血性疾病的新干预疗法提供有用信息和新的思路。

结项摘要

作为血管壁破损后的止血和血栓形成过程中的关键事件,循环血小板的黏附和聚集,不但受到血管性血友病因子vWF与血小板表面受体GPIba相互作用的调控,还受到金属蛋白酶ADAMTS-13的调节,并依赖于血流动力学环境。本项目研究了这一分子间的力-化学耦合相互作用过程,主要关注vWF与GPIba和ADAMTS-13的反应动力学及ADAMTS-13的酶切活性的力学调控机制和分子结构基础。结合生物力学建模、原子力显微镜和流动腔实验,我们在测定ADAMTS-13的粘附和酶切动力学参数的基础上,我们发现:循环的血流中,无论是ADAMTS-13粘附到还是随后水解酶切vWF的过程,均受到双向的力学调控。力先促进再减弱ADAMTS-13黏附与酶切活性。这提示,A2存在一种最佳解折叠构象,此时,它最易于被ADAMTS13水解,也就是说,无论是ADAMTS-13结合到还是酶切A2,它均偏好与部分而不是过度解折叠的A2构象。通过采用恰当的计算策略,我们利用MD技术,在百纳米的时间尺度内,成功地模拟了力调节的A1/GPIba复合物的解离的“Slip-Catch-Slip bond”途径,结果表明,这一解离途径源于A1与GPIba间的相对刚体运动、A1和GPIba分子的局部动力学性质及结合面内残基相互作用的演化;同时,我们发现,突变诱导的A1局部结构的失稳,是导致2B型血友病的分子机制;此外,我们还提出了一种基于分子动力学模拟的预报抗体/抗原互补位残基的新方法。项目研究成果将深化对血栓形成和止血过程的理解,为血栓和出血性疾病的新干预疗法提供有用的信息和新的思路,而且可为新型抗血栓单克隆抗体及其他抗体的发展提供了一种新的技术手段。

项目成果

期刊论文数量(12)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(10)
专利数量(0)
Mapping paratope on antithrombotic antibody 6B4 to epitope on platelet glycoprotein Ibalpha via molecular dynamic simulations.
通过分子动力学模拟将抗血栓抗体 6B4 上的互补位映射到血小板糖蛋白 Ibalpha 上的表位
  • DOI:
    10.1371/journal.pone.0042263
  • 发表时间:
    2012
  • 期刊:
    PloS one
  • 影响因子:
    3.7
  • 作者:
    Fang X;Fang Y;Liu L;Liu G;Wu J
  • 通讯作者:
    Wu J
抗菌肽HP(2-20)与POPE脂膜相互作用的分子动力学模拟
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    华南理工大学学报(自然科学版)
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    吴建华;刘黎;方颖;黄庆生;Wu Jian-hua Liu Li Fang Ying Huang Qing-sheng (Sch
  • 通讯作者:
    Wu Jian-hua Liu Li Fang Ying Huang Qing-sheng (Sch
Conformational Transition of Glycoprotein Ib alpha Mutants in Flow Molecular Dynamics Simulation
流动分子动力学模拟中糖蛋白 Ib α 突变体的构象转变
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2011
  • 期刊:
    Cellular and Molecular Bioengineering
  • 影响因子:
    2.8
  • 作者:
    Huang, Qingsheng;Lou, Jizhong;Wu, Jianhua;Zhu, Cheng
  • 通讯作者:
    Zhu, Cheng
Force-dependent bond dissociation govern rolling of HL-60 cells through E-selectin
力依赖性键解离通过 E-选择素控制 HL-60 细胞的滚动
  • DOI:
    10.1016/j.yexcr.2012.05.018
  • 发表时间:
    2012-08-15
  • 期刊:
    EXPERIMENTAL CELL RESEARCH
  • 影响因子:
    3.7
  • 作者:
    Li, Quhuan;Fang, Ying;Wu, Jianhua
  • 通讯作者:
    Wu, Jianhua
Flexibility is a mechanical determinant of antimicrobial activity for amphipathic cationic alpha-helical antimicrobial peptides
灵活性是两亲性阳离子α螺旋抗菌肽抗菌活性的机械决定因素
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
    Biochimica et Biophysica Acta-Biomembranes
  • 影响因子:
    3.4
  • 作者:
    Liu, Li;Fang, Ying;Wu, Jianhua
  • 通讯作者:
    Wu, Jianhua

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其他文献

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等离子体屏蔽效应对原子能级和振
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  • 发表时间:
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  • 影响因子:
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  • 作者:
    李永强;吴建华;袁建民*
  • 通讯作者:
    袁建民*

其他文献

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循环血流中,血小板CD40L的分泌、聚化与功能的力学调控机制
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AI项目解读示例

课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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