基于质谱-分子网络策略的柳珊瑚来源真菌环肽活性先导物发现

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    81874300
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    60.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H3405.海洋药物
  • 结题年份:
    2022
  • 批准年份:
    2018
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2019-01-01 至2022-12-31

项目摘要

Marine microorganisms with high biodiversity have proven to be a rich source for searching for secondary metabolites with novel structures and potential bioactivities. In recent years, marine microorganisms have been considered as a hot resource for the discovery of bioactive marine natural products and lead compounds. Unfortunately, a critical problem not overcomed by many methodologies has emerged accompanying with the research on the secondary metabolites from marine microorganisms. The known compounds have been isolated repeatedly, and the new molecules especially with trace amounts have been lost frequently. To face this challenge, we propose to find bioactive lead compounds of cyclodepsipeptides from gorgonian-derived fungi by MS/MS molecular networking strategy. Firstly, the mass data and mass clearage modes of the secondary metabolites should be collected by LC-MS/MS analysis of the cultivated products of the fungal strains. A viewable MS/MS molecular network should be established based on the mass characteristics and clearage patterns of the same type of compounds. Consequently, under the guidance of the established MS/MS molecular network, the new cyclodepsipeptides with angiogenesis activity should be isolated from the fermentation broth of gorgonian-derived fungi. By using the MS/MS molecular network, the trace new compounds would be predicted and discovered, and the bioactive lead compounds whould be obtained accurately with high efficiency. The results from this research would be valuable to the dereplication of the secondary metabolites and the discovery for lead compounds with novel structures from marine microorganisms.
海洋微生物具有丰富的物种多样性,能够产生结构新颖、活性显著的次级代谢产物,已成为活性海洋天然产物和药物先导化合物发现的热点资源。然而,随着对海洋微生物次级代谢产物研究的不断深入,重复分离获得已知化合物、丢失微量存在的新化合物等问题日益突出。本项目瞄准海洋天然产物领域面临的这一关键问题,以柳珊瑚来源真菌为研究对象,开展基于质谱-分子网络策略的环肽活性先导物发现研究。首先利用LC-MS/MS系统分析发酵产物中化合物质谱及其裂解模式,依据同类化合物的质谱特征及其裂解规律,构建可视化质谱-分子网络数据库(MS/MS Molecular Network);进而在质谱-分子网络策略指导下,以具有促血管新生等活性的新颖环肽类化合物为目标,从发酵产物中预测、排重、追踪、发掘微量新颖化合物,精准、高效发现活性先导物。本项目研究结果对海洋微生物代谢产物的排重和新颖结构药物先导化合物的发现具有启示和借鉴价值。

结项摘要

海洋微生物具有丰富的物种多样性,能够产生结构新颖、活性显著的次级代谢产物,已成为活性海洋天然产物和药物先导化合物发现的热点资源。然而,随着对海洋微生物次级代谢产物研究的不断深入,重复分离获得已知化合物、丢失微量存在的新化合物等问题日益突出。..本项目瞄准海洋天然产物领域面临的这一关键问题,以柳珊瑚来源真菌为研究对象,开展了基于质谱-分子网络策略(MS/MS Molecular Network)的环肽活性先导物发现研究。利用LC-MS/MS系统分析真菌Penicillium chrysogenum,Aspergillus versicolor,Aspergillus sclerotiorum, Scopulariopsis brevicaulis等发酵产物中化合物质谱及其裂解模式,依据同类化合物的质谱特征及其裂解规律,构建可视化质谱-分子网络数据库;进而以新颖环肽类化合物为目标,在质谱-分子网络策略指导下,结合OSMAC策略、化学表观遗传修饰和基因组采掘技术,通过生物活性追踪,从发酵产物中预测、排重、追踪、发掘微量新颖化合物。本研究获得了多个系列环肽类新颖结构化合物,分离鉴定新环肽化合物17个,半合成获得系列新衍生物31个;通过生物活性筛选评价,发现了促血管生成(3个)、抗结核杆菌(7个)、抗肿瘤(1个)等活性化合物11个;分析了高活性化合物的构效关系,评价了体内外活性,初步探讨了作用机制,为药物先导化合物的发现提供了化合物基础。..本研究证明了质谱-分子网络(MS/MS Molecular Networking)技术是发掘海洋微生物新颖结构活性次级代谢产物的有效途径,对海洋微生物代谢产物的排重和新颖结构药物先导化合物的发现具有启示和借鉴价值。

项目成果

期刊论文数量(5)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(11)
专利数量(2)
Targeted Isolation of Asperheptatides from a Coral-Derived Fungus Using LC-MS/MS-Based Molecular Networking and Antitubercular Activities of Modified Cinnamate Derivatives
使用基于 LC-MS/MS 的分子网络和修饰肉桂酸酯衍生物的抗结核活性,从珊瑚源真菌中靶向分离曲庚肽。
  • DOI:
    10.1021/acs.jnatprod.0c00804
  • 发表时间:
    2021-01-22
  • 期刊:
    JOURNAL OF NATURAL PRODUCTS
  • 影响因子:
    5.1
  • 作者:
    Chao, Rong;Hou, Xue-Mei;Shao, Chang-Lun
  • 通讯作者:
    Shao, Chang-Lun
Targeted isolation of antitubercular cycloheptapeptides and an unusual pyrroloindoline-containing new analog, asperpyrroindotide A, using LC-MS/MS-based molecular networking.
使用基于 LC–MS/MS– 的分子网络,有针对性地分离抗结核环七肽和一种不寻常的吡咯并吲哚啉 — 含有新类似物 asperpyrroindotide A
  • DOI:
    10.1007/s42995-022-00157-8
  • 发表时间:
    2023
  • 期刊:
    Marine life science & technology
  • 影响因子:
    5.7
  • 作者:
  • 通讯作者:
Discovery of marine natural products as promising antibiotics against Pseudomonas aeruginosa
发现海洋天然产物作为对抗铜绿假单胞菌的有前途的抗生素
  • DOI:
    10.3390/md2003019
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
    Mar. Drugs
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Haoran Li;Mireguli Maimaitiming;Yue Zhou;Huaxuan Li;Pingyuan Wang;Yang Liu;Till F. Schäberle;Zhiqing Liu;Chang-Yun Wang
  • 通讯作者:
    Chang-Yun Wang
Integrating Molecular Networking and 1H NMR To Target the Isolation of Chrysogeamides from a Library of Marine-Derived Penicillium Fungi
整合分子网络和 1 H NMR,从海洋青霉真菌库中分离金酰胺
  • DOI:
    10.1021/acs.joc.8b02614
  • 发表时间:
    2019-02-01
  • 期刊:
    JOURNAL OF ORGANIC CHEMISTRY
  • 影响因子:
    3.6
  • 作者:
    Hou, Xue-Mei;Li, Yue-Ying;Shao, Chang-Lun
  • 通讯作者:
    Shao, Chang-Lun

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其他文献

(plusmn;)-Pestalachloride D, an Antibacterial Racemate of Chlorinated Benzophenone Derivative from a Soft Coral-Derived Fungus Pestalotiopsis sp.
  • DOI:
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  • 发表时间:
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  • 期刊:
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  • 影响因子:
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  • 作者:
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  • 通讯作者:
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柳珊瑚来源真菌Aspergillus sp. 中吲哚生物碱类化学成分的研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
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  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    王长云
  • 通讯作者:
    王长云
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  • 发表时间:
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  • 作者:
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  • 通讯作者:
    王长云
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  • DOI:
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  • 发表时间:
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  • 期刊:
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  • 影响因子:
    --
  • 作者:
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  • 通讯作者:
    张丰聪
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生物碱化合物、其制备方法及其作为抗单纯疱疹病毒I剂的应用
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    邵长伦;王长云;牟晓凤;胥汝芳
  • 通讯作者:
    胥汝芳

其他文献

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AI项目解读示例

课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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