微生物降解4-硝基酚途径中关键酶的结构与功能研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号：
    31070655
  • 项目类别：
    面上项目
  • 资助金额：
    34.0万
  • 负责人：
    谷立川
  • 依托单位：
    山东大学
  • 学科分类：
    C0501.结构生物学
  • 结题年份：
    2013
  • 批准年份：
    2010
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2011-01-01 至2013-12-31

项目摘要

4-硝基酚是多种化工产品的重要原料，对人体有很强的毒性与致癌性。工业上的广泛应用使其成为一种重要的环境污染物。微生物能利用4-硝基酚进行生长并实现污染物的完全降解，其微生物代谢途径及其机理最近得到了深入的研究。在Pseudomonas sp. WBC-3菌株中，4-硝基酚单加氧酶（PnpA），对苯二醌还原酶（PnpB）催化4-硝基酚代谢的起始反应，即催化4-硝基酚经对苯二醌生成对苯二酚; 而对苯二酚双加氧酶（PnpCD）催化的对苯二酚开环反应为4-硝基酚下游代谢途径的关键步骤。目前对这些蛋白质的结构与功能的研究缺乏，整个反应途径的催化机理尚未在分子水平上得到阐明。本项目拟运用X射线晶体学的方法系统的测定PnpA，PnpB和PnpCD三个酶及其与底物复合物的三维结构，在原子分子水平阐明活性中心精细结构,并结合活性位点定点突变的结果从而揭示其底物识别与催化反应的机理。

结项摘要

测定了4-硝基酚降解途径中PnpB, PnpE的晶体结构并对其结构与功能的关系进行了深入分析与生化实验验证。获得了PnpCD复合物的晶体并收集到一套中等分辨率数据，再有一套反常散射数据既可得到结构。PnpE的研究结构已经发表BMC Struct Biol. 2013 Nov 19;13(1):30。PnpB的相关论文正在撰写中。

项目成果

期刊论文数量（1）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（0）
专利数量（0）
Crystal structure of the -hydroxymuconic semialdehyde dehydrogenase from Pseudomonas sp. strainWBC-3, a key enzyme involved in para-Nitrophenol degradation.
晶体结构
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2013
  • 期刊：
    BMC Struct Biol
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    Su jing;Gu Lichuan
  • 通讯作者：
    Gu Lichuan

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其他文献

其他文献

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课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
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