土壤线虫提高细菌合成吲哚乙酸(IAA)能力的分子机制

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AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    41571244
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    63.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    D0709.基础土壤学
  • 结题年份:
    2019
  • 批准年份:
    2015
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2016-01-01 至2019-12-31

项目摘要

Bacterial-feeding nematodes increase the biosynthetic ability of ndole acetic acid (IAA) in bacteria, but the molecular mechanism is still unclear. Based on incubation microsites, our study will first analyze IAA synthesis pathways in strain Bacillus amyloliquifaciens JX1 by HPLC/MS and GC/MS, and then clone and express the genes responsible for the IAA synthesis pathways of B. amyloliquifaciens JX1. Secondly, we prepare to purify and identify the effectors regulating the genes responsible for the IAA synthesis pathways in strain JX1 from the secretion of one genus of bacterial-feeding nematodes (Mesorhabditis sp.). Based on the pot experiment, the transcription and expression of the genes responsible for the IAA synthesis pathways in strain JX1 will be analyzed after adding the effectors into the soils. This step will further confirm the biological function of the effector from the nematode secretion in real soil environment. Our results will reveal the molecular mechanism of bacterial-feeding nematode increasing the bacterial IAA biosynthetic ability from gene level. And our results will also help us to reveal the ecological process and mechanism of soil biological interactions, enrich ecology theory, and establish a scientific foundation of the excavating and reasonable utilization beneficial soil organisms regulating plant growth.
土壤食细菌线虫能提高细菌合成吲哚乙酸(IAA)的能力,但作用机制尚不明确。本研究拟采用室内培养试验,首先利用HPLC/MS、GC/MS手段分析Bacillus amyloliquifaciens JX1合成IAA的途径,并通过分子生物学技术对IAA合成相关功能基因进行克隆、表达;而后分离、纯化和鉴定中杆属食细菌线虫(Mesorhabditis sp.)分泌物中调控JX1菌株IAA合成基因的效应物,揭示效应物对IAA合成途径的影响机制;并设置土培试验,验证上述效应物在土壤中对JX1体内IAA合成相关功能基因的调控情况,进一步证实线虫分泌的效应物在真实土壤环境中的生物功能。进而从基因水平上揭示土壤食细菌线虫提高细菌合成IAA能力的分子作用机制,研究结果有助于揭示土壤生物相互作用的生态过程及机理,丰富生态学理论,并为调控植物生长的有益土壤生物的发掘和合理利用奠定科学基础。

结项摘要

土壤食细菌线虫能够通过与产IAA细菌的相互作用,增加土壤中IAA的含量,促进植物根系生长。土壤食细菌线虫分泌物不仅可以帮助其吸引土壤微生物作为食物资源,还可以调节微生物和线虫自身的生理生化行为,因此在土壤生态学上具有重要的作用。本项目研究模式线虫C. elegans和土著食细菌线虫(中杆属线虫Mesorhabditis sp.和拟丽突属线虫Acrobeloides sp.)及其分泌物对不同细菌合成IAA能力的影响;通过全基因组扫描、代谢组学和HPLC-MS分析供试细菌中可能存在的IAA生物合成途径;通过转录组学和代谢组学分析C. elegans分泌物对供试细菌基因表达和代谢的影响,分析细菌中受线虫分泌物调控的IAA生物合成途径,挖掘食细菌线虫分泌物对细菌合成IAA能力的调控机制;通过HPLC-MS对C. elegans分泌物中能够影响细菌合成IAA能力的活性物质进行分离与鉴定。研究发现,模式线虫C. elegans和土著食细菌线的分泌物均能提高细菌合成IAA的能力,且不同食细菌线虫对不同细菌合成IAA能力的影响程度和作用时间不同;供试细菌A. pascens ZZ21中主要存在吲哚乙酰胺和吲哚丙酮酸这两条依赖于色氨酸的IAA合成途径;C. elegans分泌物主要通过吲哚丙酮酸途径影响细菌合成IAA;通过液相色谱串联质谱对C. elegans分泌物中能够影响细菌合成IAA的物质进行分离与鉴定,最终得到6个活性短肽。本研究从食细菌线虫分泌物的角度出发,探究食细菌线虫分泌物对细菌合成IAA能力的影响,明确供试细菌中合成IAA的主要途径,揭示食细菌线虫与产IAA细菌相互作用的生态过程及机理,并为后续深入探索食细菌线虫分泌物的生态学功能提供有利线索。

项目成果

期刊论文数量(9)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
A comprehensive formula for decomposing change in community similarity into introduction and extinction events
将群落相似性变化分解为引入和灭绝事件的综合公式
  • DOI:
    10.1111/ecog.04613
  • 发表时间:
    2019-07
  • 期刊:
    Ecography
  • 影响因子:
    5.9
  • 作者:
    Li Xianping;Bellard Celine;Hu Feng;Li Huixin
  • 通讯作者:
    Li Huixin
Food familiarity does not change nematode feeding behavior
食物熟悉度不会改变线虫的摄食行为
  • DOI:
    10.1016/j.soilbio.2018.07.011
  • 发表时间:
    2018-10
  • 期刊:
    Soil Biology and Biochemistry
  • 影响因子:
    9.7
  • 作者:
    Ting Liu;Li Yu;Mengsha Li;Jun Wu;Huixin Li;Joann K. Whalen;Feng Hu
  • 通讯作者:
    Feng Hu
Indole-3-Acetic Acid Biosynthesis Pathways in the Plant-Beneficial Bacterium Arthrobacter pascens ZZ21.
植物有益细菌节杆菌 ZZ21 中的吲哚 3 乙酸生物合成途径
  • DOI:
    10.3390/ijms19020443
  • 发表时间:
    2018-02-01
  • 期刊:
    International journal of molecular sciences
  • 影响因子:
    5.6
  • 作者:
    Li M;Guo R;Yu F;Chen X;Zhao H;Li H;Wu J
  • 通讯作者:
    Wu J
Earthworm mucus interfere in the behavior and physiology of bacterial-feeding nematodes
蚯蚓粘液干扰以细菌为食的线虫的行为和生理机能
  • DOI:
    10.1016/j.apsoil.2019.06.002
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    Applied Soil Ecology
  • 影响因子:
    4.8
  • 作者:
    Yu Fei;Li Chunkai;Liu Ting;Li Teng;Hu Feng;Li Huixin;Jiao Jiaguo
  • 通讯作者:
    Jiao Jiaguo
Polyploidy in invasive Solidago canadensis increased plant nitrogen uptake, and abundance and activity of microbes and nematodes in soil
入侵加拿大一枝黄花的多倍体增加了植物氮的吸收以及土壤中微生物和线虫的丰度和活性
  • DOI:
    10.1016/j.soilbio.2019.107594
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    Soil Biology and Biochemistry
  • 影响因子:
    9.7
  • 作者:
    Wu Shuqi;Cheng Jiliang;Xu Xinyu;Zhang Yi;Zhao Yexin;Li Huixin;Qiang Sheng
  • 通讯作者:
    Qiang Sheng

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不同施肥处理对红壤土壤土微团聚
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  • 发表时间:
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AI项目解读示例

课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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