长链非编码RNA与非小细胞肺癌发病风险的关联及其机制研究

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AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    81773520
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    50.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H3010.非传染病流行病学
  • 结题年份:
    2021
  • 批准年份:
    2017
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2018-01-01 至2021-12-31

项目摘要

The long non-coding RNAs(lncRNAs) as the majority of non-conding RNA, were found to be involved in many biological activity and played a key role in development of many tumors including non-small cell lung cancer (NSCLC). The current findings demonstrated several plasma lncRNAs could be used as a early prediction biomarker for NSCLC. But these lncRNAs were mostly found by comparing the expression of lncRNAs between tumor tissue and tumor adjacent tissue. It is still known little about the role of plasma lncRNAs on NSCLC risk in transcriptome level. To systematic evaluate the value of plasma lncRNAs on the prediction of NSCLC risk, we plan to compare the difference of lncRNAs expression in plasma of before and after accident NSCLC using RNA sequencing based on a prospective cohort, Dongfeng-Tongji Cohort. After selected the NSCLC related lncRNAs by RNA sequencing, the associations between their expression levels and the risk of NSCLC will be tested in a 1 to 3 nested case control study. The positive associated lncRNAs will be further function studied The proposed study will suggest the new biomarker for NSCLC detection and the new mechanism of NSCLC development.
长链非编码RNA(lncRNA)作为非编码RNA中数量最多的RNA,在多种肿瘤的发生发展中扮演了重要角色。现有的研究表明血浆中lncRNA的表达水平与非小细胞肺癌发病风险相关联。但目前所研究的血浆lncRNA多从比较癌和癌旁组织lncRNA表达差异的角度来筛选,该研究策略可能会遗漏较多的血浆lncRNA。为了系统研究血浆lncRNA表达水平与非小细胞肺癌发病风险的关联,本研究依托东风-同济队列,运用转录组测序技术直接比较队列人群中新发非小细胞肺癌病人发病前后血浆中lncRNA表达谱的变化,筛选血浆中潜在的非小细胞肺癌风险相关lncRNA,进而采用巢式病例对照研究设计评估血浆中非小细胞肺癌相关lncRNA表达水平与非小细胞肺癌风险的关联性,并对阳性关联的lncRNA进行功能研究。本研究将为非小细胞肺癌发病风险的早期预测提供新的分子标志物,并为阐明非小细胞肺癌发生发展的机制提供科学依据。

结项摘要

根据本项目的研究目标,我们通过对31对癌和癌旁肺腺癌组织样本进行RNA测序,通过表达差异分析,发现20个lncRNA是肺腺癌相关的lncRNA。利用正常对照和肺癌病人的外周血淋巴细胞进行验证发现,在肺腺癌病人中AP001056.1表达量高于健康对照,而在健康对照中RAMP2-AS1表达量高于肺腺癌病人。因此我们推测AP001056.1表达增加是肺腺癌的危险因素,而RAMP2-AS1是保护因素。进一步的功能分析表明,RAMP2-AS1的靶点在淀粉酶受体复合物2富集最显著,进而确定该lncRNA可通过淀粉酶受体复合物2参与肺腺癌的发生发展。同时,我们利用TCGA数据库肺鳞癌的转录组测序数据,确定4个铁死亡相关的lncRNA AC016924.1、AP006545.2、LINC02555和AL122125.1 是肺鳞癌相关lncRNA。进一步的功能分析表明,这些基因在粘附斑通路富集最显著。表明这些铁死亡相关的lncRNA通过影响粘附斑酶活性来参与肺鳞癌的发生发展。本研究所发现的这些lncRNA可以用于肺腺癌和鳞癌的早期诊断和风险评估。

项目成果

期刊论文数量(5)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Genetic correction of serum AFP level improves risk prediction of primary hepatocellular carcinoma in the Dongfeng-Tongji cohort study.
东风-同济队列研究中血清 AFP 水平的基因校正可提高原发性肝细胞癌的风险预测
  • DOI:
    10.1002/cam4.1481
  • 发表时间:
    2018-06
  • 期刊:
    Cancer medicine
  • 影响因子:
    4
  • 作者:
    Wang K;Bai Y;Chen S;Huang J;Yuan J;Chen W;Yao P;Miao X;Wang Y;Liang Y;Zhang X;He M;Yang H;Guo H;Wei S
  • 通讯作者:
    Wei S
基于TCGA数据挖掘筛选肺鳞癌预后相关lncRNA分子标签
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    癌变·畸变·突变
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    刘颖;王可;何杨婷;肖金荣;王唤卓;李旸凯;魏晟
  • 通讯作者:
    魏晟
A functional methylation signature to predict the prognosis of Chinese lung adenocarcinoma based on TCGA.
基于TCGA预测中国肺腺癌预后的功能甲基化特征
  • DOI:
    10.1002/cam4.4431
  • 发表时间:
    2022-01
  • 期刊:
    Cancer medicine
  • 影响因子:
    4
  • 作者:
    Wang K;Liu Y;Lu G;Xiao J;Huang J;Lei L;Peng J;Li Y;Wei S
  • 通讯作者:
    Wei S
基于公共数据库挖掘肝细胞癌预后相关的长链非编码RNA分子标签
  • DOI:
    10.3760/cma.j.issn.0254-6450.2019.07.014
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    中华流行病学杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    肖金荣;王可;刘颖;李泽武;周玉静;王唤卓;卢静雅;程珊珊;魏晟
  • 通讯作者:
    魏晟
Genome-wide expression profiling-based copy number variations and colorectal cancer risk in Chinese
基于全基因组表达谱的拷贝数变异与中国人结直肠癌风险
  • DOI:
    10.1002/mc.23015
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    Molecular Carcinogenesis
  • 影响因子:
    4.6
  • 作者:
    Wang Ke;Yu Xingchen;Jiang Hongwei;Huang Jiao;Wang Huanzhuo;Jiang Hongyu;Wei Sheng;Liu Li
  • 通讯作者:
    Liu Li

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其他文献

社会网络分析法在传染病预防控制中的应用
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  • 作者:
    许川;魏晟;聂绍发;黄淑琼;龙璐
  • 通讯作者:
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GHR、IGF-Ⅰ在结直肠癌中的表达及其临床意义
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  • 通讯作者:
    聂绍发
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  • 发表时间:
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    --
  • 作者:
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  • 通讯作者:
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  • 通讯作者:
    胡樱
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    --
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    --
  • 期刊:
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    --
  • 作者:
    石梓薇;秦周;黄娇;魏晟
  • 通讯作者:
    魏晟

其他文献

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魏晟的其他基金

可变剪切与非小细胞肺癌发病风险的关联及其机制研究
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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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