蓝藻和红藻藻胆体中连接蛋白进化的生物信息学和比较蛋白质组学研究

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AI项目解读

基本信息

  • 批准号：
    40676078
  • 项目类别：
    面上项目
  • 资助金额：
    35.0万
  • 负责人：
    张玉忠
  • 依托单位：
    山东大学
  • 学科分类：
    D0604.生物海洋学与海洋生物资源
  • 结题年份：
    2009
  • 批准年份：
    2006
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2007-01-01 至2009-12-31

项目摘要

藻胆体是蓝藻和红藻光合作用的捕光复合物，是由带色素的藻胆蛋白和大多数无色的连接蛋白自组装而成的有序超分子复合物。本研究首先从公共数据库中搜集各种连接蛋白和藻胆蛋白的一维序列和三维晶体结构信息，运用生物信息学技术，开展连接蛋白的分子进化的研究以及连接蛋白与藻胆蛋白共进化研究，在国内外首次提出连接蛋白的进化模式和连接蛋白与藻胆蛋白共进化模式。在此基础上，以不同藻胆蛋白组成和不同结构类型的典型蓝藻和红藻为材料，应用蛋白质组学研究技术，开展不同藻胆体中连接蛋白的比较蛋白质组学的研究，为阐明藻胆体连接蛋白的进化提供实验证据。最终，结合分子进化和比较蛋白质组学的研究结果，构建连接蛋白的进化模型，阐明进化过程中超分子体系内分子间相互作用协同进化的规律，为最终阐明藻胆体超分子复合物的自组装机制以及高效吸能和传能的机制提供理论依据。

结项摘要

项目成果

期刊论文数量（5）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（0）
专利数量（0）
Predicting Intra- and Inter-protein Interaction Interfaces from Protein Sequences: Case Studies of Subtilisin and Phycocyanin
从蛋白质序列预测蛋白质内和蛋白质间相互作用界面：枯草杆菌蛋白酶和藻蓝蛋白的案例研究
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    Proteins-Structure Function and Genetics
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    张玉忠
  • 通讯作者：
    张玉忠
Probing the pH sensitivity of R-phycoerythrin: Investigations of active conformational and functional variation
探讨 R-藻红蛋白的 pH 敏感性：活性构象和功能变异的研究
  • DOI：
    10.1016/j.bbabio.2009.02.018
  • 发表时间：
    2009-07-01
  • 期刊：
    BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-BIOENERGETICS
  • 影响因子：
    4.3
  • 作者：
    Liu, Lu-Ning;Su, Hai-Nan;Zhang, Yu-Zhong
  • 通讯作者：
    Zhang, Yu-Zhong

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其他文献

肌酸化学交换饱和转移加权成像评估大鼠胶质瘤模型肌酸浓度变化
  • DOI：
    10.13929/j.issn.1003-3289.2021.08.001
  • 发表时间：
    2021
  • 期刊：
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  • 影响因子：
    --
  • 作者：
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  • 通讯作者：
    吴仁华
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  • DOI：
    10.13201/j.issn.1001-1781.2018.16.013
  • 发表时间：
    2018
  • 期刊：
    临床耳鼻咽喉头颈外科杂志
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    陈耔辰;张玉忠;杨勇智;魏馨雨;胡娟;高滢;陈飞云;罗花南;许珉;张青
  • 通讯作者：
    张青
Scheduling Simple Linear Deteriorating Jobs with Rejection
调度简单的线性恶化作业并拒绝
  • DOI：
    10.1155/2014/170475
  • 发表时间：
    2014-07
  • 期刊：
    MATHEMATICAL PROBLEMS IN ENGINEERING
  • 影响因子：
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  • 作者：
    邹娟;张玉忠
  • 通讯作者：
    张玉忠
Removal of Heavy Metal in Drinking Water Resource with Cation-Exchange Resins (Type 110-H) Mixed PES Membrane Adsorbents
阳离子交换树脂（110-H型）混合PES膜吸附剂去除饮用水源中的重金属
  • DOI：
    10.1061/(asce)hz.2153-5515.0000229
  • 发表时间：
    2015-04
  • 期刊：
    Journal of Hazardous, Toxic, and Radioactive Waste
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    张玉忠;李泓;林立刚;丁晓莉
  • 通讯作者：
    丁晓莉
机器有使用限制的混合恶化排序问题的复杂性
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2015
  • 期刊：
    系统科学与数学
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    张玉忠;苗翠霞
  • 通讯作者：
    苗翠霞

其他文献

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张玉忠的其他基金

海洋微生物驱动有机硫DMSP循环的新类群、新机制与代谢调控
  • 批准号：
    32330001
  • 批准年份：
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  • 资助金额：
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    91851205
  • 批准年份：
    2018
  • 资助金额：
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  • 批准年份：
    2016
  • 资助金额：
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  • 批准号：
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    2012
  • 资助金额：
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深海适冷菌分泌的适冷蛋白酶的性质及适冷催化机理
  • 批准号：
    40276047
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生孢噬纤维菌的生活史及降解纤维素机制的AFM研究
  • 批准号：
    30270022
  • 批准年份：
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  • 批准号：
    39700002
  • 批准年份：
    1997
  • 资助金额：
    10.0 万元
  • 项目类别：
    青年科学基金项目

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课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
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