深海适冷菌分泌的新结构的胞外多糖合成基因簇的克隆、序列分析及合成机制研究

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AI项目解读

基本信息

  • 批准号：
    30770062
  • 项目类别：
    面上项目
  • 资助金额：
    35.0万
  • 负责人：
    张玉忠
  • 依托单位：
    山东大学
  • 学科分类：
    C0104.微生物遗传与生物合成
  • 结题年份：
    2010
  • 批准年份：
    2007
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2008-01-01 至2010-12-31

项目摘要

深海适冷菌Pseudoalteromonas sp. SM9913 能分泌大量蛋白酶和胞外多糖（EPS）。我们已经系统研究了该菌分泌的三种蛋白酶的基因结构、酶的适冷特性和机制；分离纯化了EPS，解析了其结构，阐明了该EPS的生态学功能，提出了EPS介导的P. sp. SM9913对深海极端环境可能的生态学适应模式。在此基础上，本项目首先利用构建基因组文库、杂交和 TAIL PCR 等技术克隆与EPS 合成和分泌相关的酶的基因簇，然后测序和序列分析，分析基因簇中各个基因的功能，解析该EPS可能的合成和分泌途径，然后通过基因干扰实验验证相关基因的功能，从而阐明深海适冷菌的EPS 合成和分泌的机制，通过遗传操作对糖的结构进行修饰，验证其生态学功能，解析EPS生态学功能的分子基础，最终阐明胞外多糖介导的P. sp. SM9913对深海极端环境生态适应的分子机制。

结项摘要

项目成果

期刊论文数量（8）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（0）
专利数量（0）
Structural characterization and ecological roles of a novel exopolysaccharide from the deep-sea psychrotolerant bacterium Pseudoalteromonas sp SM9913
深海耐冷细菌假交替单胞菌 SM9913 的新型胞外多糖的结构特征和生态作用
  • DOI：
    10.1099/mic.0.2006/003327-0
  • 发表时间：
    2007-05-01
  • 期刊：
    MICROBIOLOGY-SGM
  • 影响因子：
    2.8
  • 作者：
    Qin, Guokui;Zhu, Lizhi;Zhang, Yuzhong
  • 通讯作者：
    Zhang, Yuzhong
南极海冰细菌胞外多糖的助凝作用及红外光谱分析
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    光谱学与光谱分析
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    周维芝;申博玲;刘升波;陈波;张玉忠
  • 通讯作者：
    张玉忠
The complete genome of Zunongwangia profunda SM-A87 reveals its adaptation to the deep-sea environment and ecological role in sedimentary organic nitrogen degradation.
Zunongwangia profunda SM-A87的完整基因组揭示了其对深海环境的适应及其在沉积物有机氮降解中的生态作用
  • DOI：
    10.1186/1471-2164-11-247
  • 发表时间：
    2010-04-17
  • 期刊：
    BMC genomics
  • 影响因子：
    4.4
  • 作者：
    Qin QL;Zhang XY;Wang XM;Liu GM;Chen XL;Xie BB;Dang HY;Zhou BC;Yu J;Zhang YZ
  • 通讯作者：
    Zhang YZ
Domains III and I-2 alpha, at the Entrance of the Binding Cleft, Play an Important Role in Cold Adaptation of the Periplasmic Dipeptide-Binding Protein (DppA) from the Deep-Sea Psychrophilic Bacterium Pseudoalteromonas sp Strain SM9913
位于结合裂口入口处的结构域 III 和 I-2 α 在深海嗜冷细菌假交替单胞菌 SM9913 菌株周质二肽结合蛋白 (DppA) 的冷适应中发挥重要作用
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    Applied and Environmental Microbiology
  • 影响因子：
    4.4
  • 作者：
    Xie, Bin-Bin;Zhang, Wei-Xin;Dong, Sheng;Zhou, Bai-Cheng;Zhang, Yu-Zhong;Zhang, Xi-Ying;Chen, Xiu-Lan
  • 通讯作者：
    Chen, Xiu-Lan
Comparative genomics reveals a deep-sea sediment-adapted life style of Pseudoalteromonas sp. SM9913
比较基因组学揭示了假交替单胞菌适应深海沉积物的生活方式。
  • DOI：
    10.1038/ismej.2010.103
  • 发表时间：
    2011-02-01
  • 期刊：
    ISME JOURNAL
  • 影响因子：
    11
  • 作者：
    Qin, Qi-Long;Li, Yang;Zhang, Yu-Zhong
  • 通讯作者：
    Zhang, Yu-Zhong

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  • 通讯作者：
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  • 期刊：
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  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    邹娟;张玉忠
  • 通讯作者：
    张玉忠

其他文献

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课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
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