RIF1基因在重离子辐射损伤反应中的作用和分子机制研究

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基本信息

项目摘要

Medical protection of heavy ion radiation damage is one of the key factors in counteracting space radiation to humans. It is an important component of heavy ion radiation study to explore human genes related to radiation protection and the underlying mechanisms by genomics and molecular biology techniques. In our previous studies using gene expression profiles and subnetnetwork analysis, we have identified RIF1 an essential factor envolved in cellular response to heavy ion radiation from the set of most differentially dysregulated genes. In this project, with special focus on cell cycle-dependent coupling regulation and DNA repair, we shall investigate the function and determine the regulatory mechanism of RIF1 in DNA double strand break (DSB) repair pathways after heavy ion radiation. Of great importance, we shall try to reveal the activation of RIF1 and its regulatory role in DSB repair pathway choice between non-homologous end joining (NHEJ) and homologous recombination (HR) would also be investigated. This study will be significant in promoting mechanisms and basic scientific evidences of heavy ion radiation damage. It will provide new technology and strategy for screening of molecular targets and drug discovery against space radiation.
重离子辐射损伤的医学防护是对抗空间辐射人体健康危害的关键之一。通过基因组学和分子生物学技术发掘辐射防护相关人类基因并研究其作用机制是重离子辐射损伤医学防护的重要内容。课题组前期从细胞重离子辐射损伤反应的众多差异表达基因和相关基因激活子网中,通过关联网络分析等计算生物学的方法,辨识出RIF1基因为重离子辐射损伤反应的关键响应基因。本项目将以此为基础,从细胞周期变化与DNA修复的偶联调控着手,深入开展RIF1基因在重离子辐射损伤下DNA双链断裂修复通路中的功能调节机制研究,重点探讨RIF1基因的功能是如何被启动和调控的,以及RIF1基因对重离子辐射诱发DNA双链断裂的非同源末端连接和同源重组修复功能的影响及修复通路选择的调节作用机制。课题的实施将为深入阐明重离子辐射损伤机制提供前沿基础科学依据,为对抗空间辐射损伤的分子靶标和候选药物研发提供新的思路与策略。

结项摘要

空间辐射对航天员健康的危害制约人类的空间探索活动,对其中重离子成分的医学防护研究是对抗空间辐射人体健康威胁的关键之一。通过基因组学和分子生物学技术发掘辐射损伤相关人类基因并研究其作用机制是重离子辐射损伤医学防护的重要内容。前期研究建立了基于基因表达谱和关联网络分析的辐射关键响应基因辨识方法并得到了验证。.本课题以此为基础,以地面装置模拟空间辐射环境,运用不同剂量的碳离子(12C6+)辐照正常人淋巴母细胞AHH-1。通过基于模拟退火的迭代搜索算法辨识不同剂量12C6+辐照及防护药物作用下的辐射相关基因激活子网,预测空间辐射损伤防护高关联度基因。从细胞周期变化与DNA损伤修复的偶联调控着手,开展RIF1基因在重离子辐射损伤下DNA双链断裂修复通路中的功能调节机制研究,重点探讨RIF1基因对重离子辐射诱发DNA双链断裂非同源末端连接和同源重组修复功能的影响及修复途径选择的调节作用机制。.我们首先在AHH-1细胞上辨识出PPM1A、CASP3、TFE3和RIN1等一系列潜在的空间辐射损伤防护高关联度基因。富集分析表明,它们显著富集的分子功能类别主要与转录调节、激活子活性等有关,细胞定位类别主要是核体、染色体等,生物过程类别主要与信号转导、RNA代谢和细胞定位调节等有关。其次,我们发现12C6+辐照后RIF1蛋白表达量显著上升,mRNA表达量在24 h内先升高后下降。敲低RIF1基因表达可影响细胞存活,诱导细胞凋亡,减轻辐照引起的G2/M期阻滞。防护药物VND3207可有效降低辐照后的细胞凋亡率。敲低RIF1基因,53BP1的foci数量显著变化,细胞倾向于选择非同源末端连接修复途径。另一方面,我们研究了DNA-PKcs,发现抑制其活性,EXO1蛋白表达水平增加,半衰期延长,稳定性增加,细胞倾向于选择同源重组修复途径。此外,γH2AX/H2AX在各时间点显著响应不同剂量12C6+辐照,可作为重离子辐射生物剂量计。.本课题所得关键基因为有针对性地进行空间辐射损伤防护药物研发提供了候选靶标,得出的结论为重离子辐射生物效应和防护药物作用分子机制的深入研究提供了线索,奠定了基础。

项目成果

期刊论文数量(4)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(1)
基于关联网络的空间辐射防护分子靶标的辨识与预测
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    科学通报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    谢达菲;关华;樊婵;胡赛;刘晓丹;谢漪;王豫;张红;周平坤
  • 通讯作者:
    周平坤
LINCS gene expression signatures analysis revealed bosutinib as a radiosensitizer of breast cancer cells by targeting eIF4G1
LINCS 基因表达特征分析显示博舒替尼通过靶向 eIF4G1 作为乳腺癌细胞的放射增敏剂
  • DOI:
    10.1101/2020.04.24.059378
  • 发表时间:
    2020-04
  • 期刊:
    International Journal of Molecular Medicine
  • 影响因子:
    5.4
  • 作者:
    SAI HU;DAFEI XIE;PINGKUN ZHOU;XIAODAN LIU;XIAOYAO YIN;BO HUANG;HUA GUAN
  • 通讯作者:
    HUA GUAN

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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