通过多基因序列分析研究冬虫夏草菌与寄主昆虫的协同进化

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31140013
  • 项目类别:
    专项基金项目
  • 资助金额:
    10.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C1406.生物防治
  • 结题年份:
    2012
  • 批准年份:
    2011
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2012-01-01 至2012-12-31

项目摘要

作为地球上的两大生物类群,真菌与昆虫会发生协同进化。然而,迄今为止的研究都集中在昆虫和与其共生的真菌之间,尚无寄生性的病原真菌与其宿主昆虫间协同进化的研究报道。名贵中药冬虫夏草是由冬虫夏草菌寄生蝙蝠蛾科昆虫的幼虫而形成的。冬虫夏草是研究协同进化的理想材料,但由于缺乏冬虫夏草菌与寄主昆虫合适的分子标记,尚未对二者的协同进化关系进行系统研究。本项目将选择代表性产地广泛采集冬虫夏草样品,通过构建shotgun基因组文库筛选冬虫夏草菌多种高效的分子标记,同时选择寄主昆虫适宜的多基因标记;利用分子群体遗传学方法分析冬虫夏草菌与寄主昆虫的遗传结构;结合生物地理学和生物信息学的手段分析驱动冬虫夏草菌适应性进化的因素,最终阐明冬虫夏草菌与寄主昆虫的协同进化关系。研究结果不仅能丰富协同进化的内涵,而且对冬虫夏草的保护生物学及人工规模化培育具有极为重要的意义。

结项摘要

本项目从青藏高原不同地域采集了900多枚冬虫夏草样品,并从中分离了59个冬虫夏草菌株。构建了冬虫夏草菌的shotgun基因组文库,并从所构建的文库中随机选择33个基因片段测试了其在4个冬虫夏草样品间的核苷酸多样性,最终找出一些新的可用于冬虫夏草菌群体遗传学研究的分子标记基因。以七个分子标记基因,以及121个冬虫夏草样品为材料,分析了冬虫夏草菌的群体遗传结构。研究发现,冬虫夏草菌不但在地理种群内而且在地理种群间都表现出明显的遗传分化。西藏南部种群具有最高的遗传多样性,可能是冬虫夏草菌的起源中心。冬虫夏草菌的遗传分化程度随纬度梯度的增加而增加,而与经度和海拔的相关性不强。造成冬虫夏草菌遗传分化的原因仍有待今后深入研究。

项目成果

期刊论文数量(2)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Determining novel molecular markers in the Chinese caterpillar fungus Ophiocordyceps sinensis by screening a shotgun genomic library
通过筛选鸟枪法基因组文库确定冬虫夏草中的新型分子标记
  • DOI:
    10.1007/s00253-012-4028-x
  • 发表时间:
    2012-04
  • 期刊:
    Applied Microbiology and Biotechnology
  • 影响因子:
    5
  • 作者:
    Zhang Yongjie;Bei Fengrong;Zhang Shu;Liu Xingzhong
  • 通讯作者:
    Liu Xingzhong

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其他文献

自噬和凋亡相关蛋白在脑缺血再灌注大鼠模型中的表达时间谱
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  • 通讯作者:
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  • 发表时间:
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  • 期刊:
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  • 影响因子:
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  • 作者:
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  • 通讯作者:
    张永杰
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  • 发表时间:
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  • 作者:
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  • 通讯作者:
    张永杰
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    10.13228/j.boyuan.issn0449-749x.20150280
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  • 期刊:
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  • 作者:
    侯晓光;王恩刚;张永杰;许秀杰;邓安元
  • 通讯作者:
    邓安元

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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