小鼠断颈死后组织中RNA与DNA相对含量与死亡时间相关性的继续研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    81471827
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    73.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H2502.法医物证学及法医人类学
  • 结题年份:
    2018
  • 批准年份:
    2014
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2015-01-01 至2018-12-31
  • 项目参与者:
    李英碧; 吴谨; 白鹏; 廖淼; 龙兵; 王莉; 李芝隆; 何望; 竹文清;
  • 关键词:

项目摘要

Estmation the early postmortem interval (PMI) is very diffcult in forensic appliction and study. Previous research has drawn confilcting conclusions about the postmortem stability of RNA in brain tissue. Many studies report that global measures of total RNA quality are relative stable over a wide range of PMI while some others report a definite loss with increasing time. And the studies of subtypes of RNA have also had a varying conclusions, with some indicating generalized stability while others have reported significant loss of a set of individual mRNA transcripts with increasing PMI. Our previous project has studied the change of mRNA under the control of DNA in the mouse brain tissue and heart tissue within 48 hours of PMI in 37℃. A significant loss of mRNA transcripts in the range of 2-24 hours, but we could not intepret it with a better regression curve because the PMI points in this range is not enough. More PMI points in the range of 2-24 hours and more target mRNA need to be studied in the next project to prove the change of mRNA in the early PMI. We plan to measure the change of 22 mRNA in the 24 hours of PMI under the control of DNA in 37℃ and 18℃ (average tempreature in Chengdu) to determine how PMI affects the expression of individual genes and in order to determine whether there is a line relationship between PMI and mRNA. In our previous project we also find that microRNAs are very stable in 48 hours of PMI, some microRNA will begin to loss at 48 hours of PMI. We will study the change of microRNA under the controls of DNA in 240 hours of PMI in outdoor winter and summer of Chengdu in the next project. A detailed story about changes of mRNA in 24 hours and microRNA in 240 hours of PMI will be wrote after we finished next project. And the result will be tested by brain and heart tissues from at least 100 autopsy with different PMI.Better regression curves will be drawn by the intimate datas, and the could be used to estimate the PMI. The result of this study can also help other scientist to study the RNA integrity in postmortem and further study in the estimation of PMI.
死亡时间推断是法医学面临的难题之一。RNA在机体死后早期是否具有规律性变化,能否用于推断死亡时间,在学术界仍有争议。课题组前期以DNA为参照研究RNA在死后48小时内含量变化,证明37℃环境下机体死亡2-24小时内RNA含量有明显时间相关降解,并在2013年国际法医遗传学会议中进行大会报告。前期研究在该范围内设置时间点的密度和目的基因数量不足,无法获得准确的线性关系。课题组计划继续以DNA为参照在前期研究基础上对机体死亡后37℃和18℃环境中24小时内高密度时间点分组的22个目的基因,以及在成都冬夏两季室外环境机体死亡后240小时内5个microRNA含量变化进行深入研究。以期阐明RNA/DNA相对含量在机体死后24小时内详细的变化规律,在上述争议中提出有力证据。继而进行法医学尸体解剖样本研究,对本研究所获得规律性结论的实践应用价值进行评估,为法医学死亡时间推断提供解决思路和理论基础。

结项摘要

死亡时间(Postmortem Interval, PMI)推断一直是法医学实践的重要内容,是法医学研究的重点方向。本研究通过检测死后小鼠心脏以及大脑组织中基因组DNA以及mRNA表达量,发现基因组DNA的CT值与0-48h的死亡时间没有明显的相关性,作为内参时, mRNA的表达量随死亡时间延长而降低,呈现出与死亡时间显著的相关性,并确定了表达量与死亡时间的回归曲线。其次,死后脑、心组织中mRNA降解速度具有时间阶段性,总体上,死亡早期mRNA降解速度快于中期。第三,同一组织中的相同mRNA基因,在片段大小为79bp-365bp时,其在0-48h PMI的降解速度与片段大小无统计学差异。第四,mRNA的降解具有组织差异性,加上对国内外研究动态的了解,课题组认为联合研究多基因在死后多种组织中的变化情况,更有利于准确判断死亡时间。

项目成果

期刊论文数量(21)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
A 21-plex DIP panel’s application in multinational Chinese population
21重DIP面板在跨国华人人群中的应用
  • DOI:
    10.1016/j.fsigss.2015.09.212
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    Forensic Science International: Genetics Supplement Series
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Youjing Jiang;Li Wang;Zhilong Li;Jing Zhu;Duo Peng;Qin Su;Jiong Mao;Hui Wang;Weibo Liang;Lin Zhang
  • 通讯作者:
    Lin Zhang
MicroRNA markers for forensic body fluid identification obtained from miRCURY™ LNA array
从 miRCURY™ LNA 阵列获得的用于法医体液鉴定的 MicroRNA 标记
  • DOI:
    10.1016/j.fsigss.2015.10.006
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    Forensic Science International: Genetics Supplement Series
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    X.Y. Luo;Z.L. Li;D. Peng;L. Wang;L. Zhang​;W.B. Liang
  • 通讯作者:
    W.B. Liang
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  • DOI:
    10.1016/j.fsigen.2015.08.005
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    Forensic Science International-Genetics
  • 影响因子:
    3.1
  • 作者:
    Wang Li;Lv Meili;Zaumsegel Daniel;Zhang Lushun;Liu Fengji;Xiang Jihua;Li Jun;Schneider Peter M.;Liang Weibo;Zhang Lin
  • 通讯作者:
    Zhang Lin
Mutation Study of 28 Autosomal STR Loci in Southwest Chinese Han Population
中国西南汉族人群28个常染色体STR基因座突变研究
  • DOI:
    10.1016/j.fsigss.2015.09.118
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    Forensic Science International: Genetics Supplement Series
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    W.Q. Zhu;B. Jin;Q. Su;H.B. Luo;Y.B. Li;J. Wu;J. Yan;Y.P. Hou;W.B. Liang;L. Zhang
  • 通讯作者:
    L. Zhang
Development of a SNP-STRs multiplex for forensic identification
用于法医鉴定的 SNP-STR 多重分析的开发
  • DOI:
    10.1016/j.fsigss.2015.09.236
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    Forensic Science International: Genetics Supplement Series
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    L. Wang;W. He;J. Mao;H. Wang;B. Jin;H.B. Luo;W.B. Liang;L. Zhang
  • 通讯作者:
    L. Zhang

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    蔡继峰

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AI项目解读示例

课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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