对虾免疫相关基因簇的研究
项目介绍
AI项目解读
基本信息
- 批准号:30972245
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:31.0万
- 负责人:
- 依托单位:
- 学科分类:C1902.水产生物遗传育种学
- 结题年份:2012
- 批准年份:2009
- 项目状态:已结题
- 起止时间:2010-01-01 至2012-12-31
- 项目参与者:郇聘; 赵翠; 罗展; 王冬冬; 史英力; 柳承璋; 张成松;
- 关键词:
项目摘要
近年来,模式生物和其他重要动植物的全基因组研究显示,真核生物一些功能基因倾向于成簇存在。由此我们推测,与对虾免疫相关的一些基因也很可能是成簇存在的。本课题在已构建的凡纳滨对虾细菌人工染色体(BAC)基因组文库和国内外对虾免疫网络研究最新结果的基础上,挑选包括Toll、proPO等通路中的LGBP、Toll、peneaidin、crustin、serine proteinase、prophenoloxidase等10-20个重要的免疫相关基因,设计特异性探针和引物,筛选含有这些基因序列的BAC克隆;通过指纹分析、contig组装、序列测定、生物信息学解读;发现对虾免疫相关基因簇,确定其中各基因或基因家族的主要结构特点,从基因组结构的角度阐释基因序列与功能的关系,以及对虾免疫基因的系统进化过程。这些工作可以为完善对虾免疫防御网络,深入了解对虾免疫调控机制和对虾抗病选择育种提供理论基础。
结项摘要
本课题在凡纳滨对虾BAC基因组文库的基础上,通过对BAC克隆序列、BAC末端序列和对虾转录组的分析,找到68条对虾免疫相关基因;通过对对虾BAC克隆和基因组序列的测序和分析,找到了Toll-eIF3-cuticlin等8个免疫相关基因可能成簇的现象并确定其主要结构特点;同时找到了数十个的对虾各基因簇上的转录调控元件,并对HSC70的启动子进行了功能鉴定和调控定位研究;完善了对虾中的Toll和IMD调控通路;初步分析了对虾免疫免疫系统的进化过程。这些工作可以为完善对虾免疫防御网络,深入了解对虾免疫调控机制和对虾抗病选择育种提供理论基础。
项目成果
期刊论文数量(6)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(3)
专利数量(0)
Identification of a novel C-type lectin from the shrimp Litopenaeus vannamei and its role in defense against pathogens infection
凡纳滨对虾新型C型凝集素的鉴定及其防御病原体感染的作用
- DOI:10.1007/s00343-011-0249-6
- 发表时间:2011-08
- 期刊:Chinese Journal of Oceanology and Limnology
- 影响因子:--
- 作者:Luo Zhan;Zhang Jiquan;Li Fuhua;Zhang Xiaojun;Liu Chengzhang;Xiang Jianhai
- 通讯作者:Xiang Jianhai
栉孔扇贝NDPK基因的BAC-FISH定位研究
- DOI:--
- 发表时间:--
- 期刊:海洋科学
- 影响因子:--
- 作者:黄超;郇聘;张晓军;相建海
- 通讯作者:相建海
BAC end sequencing of Pacific white shrimp Litopenaeus vannamei: a glimpse into the genome of Penaeid shrimp
太平洋白虾凡纳滨对虾的 BAC 末端测序:对虾基因组一瞥
- DOI:10.1007/s00343-012-1159-y
- 发表时间:2012-05
- 期刊:Chinese Journal of Oceanology and Limnology
- 影响因子:--
- 作者:Zhao Cui;Zhang Xiaojun;Liu Chengzhang;Huan Pin;Li Fuhua;Xiang Jianhai;Huang Chao
- 通讯作者:Huang Chao
全基因组选择育种策略及在水产动物育种中的应用前景
- DOI:--
- 发表时间:--
- 期刊:中国水产科学
- 影响因子:--
- 作者:于洋;张晓军;李富花;相建海
- 通讯作者:相建海
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