对虾免疫相关基因簇的研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    30972245
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    31.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C1902.水产生物遗传育种学
  • 结题年份:
    2012
  • 批准年份:
    2009
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2010-01-01 至2012-12-31

项目摘要

近年来,模式生物和其他重要动植物的全基因组研究显示,真核生物一些功能基因倾向于成簇存在。由此我们推测,与对虾免疫相关的一些基因也很可能是成簇存在的。本课题在已构建的凡纳滨对虾细菌人工染色体(BAC)基因组文库和国内外对虾免疫网络研究最新结果的基础上,挑选包括Toll、proPO等通路中的LGBP、Toll、peneaidin、crustin、serine proteinase、prophenoloxidase等10-20个重要的免疫相关基因,设计特异性探针和引物,筛选含有这些基因序列的BAC克隆;通过指纹分析、contig组装、序列测定、生物信息学解读;发现对虾免疫相关基因簇,确定其中各基因或基因家族的主要结构特点,从基因组结构的角度阐释基因序列与功能的关系,以及对虾免疫基因的系统进化过程。这些工作可以为完善对虾免疫防御网络,深入了解对虾免疫调控机制和对虾抗病选择育种提供理论基础。

结项摘要

本课题在凡纳滨对虾BAC基因组文库的基础上,通过对BAC克隆序列、BAC末端序列和对虾转录组的分析,找到68条对虾免疫相关基因;通过对对虾BAC克隆和基因组序列的测序和分析,找到了Toll-eIF3-cuticlin等8个免疫相关基因可能成簇的现象并确定其主要结构特点;同时找到了数十个的对虾各基因簇上的转录调控元件,并对HSC70的启动子进行了功能鉴定和调控定位研究;完善了对虾中的Toll和IMD调控通路;初步分析了对虾免疫免疫系统的进化过程。这些工作可以为完善对虾免疫防御网络,深入了解对虾免疫调控机制和对虾抗病选择育种提供理论基础。

项目成果

期刊论文数量(6)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(3)
专利数量(0)
Identification of a novel C-type lectin from the shrimp Litopenaeus vannamei and its role in defense against pathogens infection
凡纳滨对虾新型C型凝集素的鉴定及其防御病原体感染的作用
  • DOI:
    10.1007/s00343-011-0249-6
  • 发表时间:
    2011-08
  • 期刊:
    Chinese Journal of Oceanology and Limnology
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Luo Zhan;Zhang Jiquan;Li Fuhua;Zhang Xiaojun;Liu Chengzhang;Xiang Jianhai
  • 通讯作者:
    Xiang Jianhai
栉孔扇贝NDPK基因的BAC-FISH定位研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    海洋科学
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    黄超;郇聘;张晓军;相建海
  • 通讯作者:
    相建海
BAC end sequencing of Pacific white shrimp Litopenaeus vannamei: a glimpse into the genome of Penaeid shrimp
太平洋白虾凡纳滨对虾的 BAC 末端测序:对虾基因组一瞥
  • DOI:
    10.1007/s00343-012-1159-y
  • 发表时间:
    2012-05
  • 期刊:
    Chinese Journal of Oceanology and Limnology
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Zhao Cui;Zhang Xiaojun;Liu Chengzhang;Huan Pin;Li Fuhua;Xiang Jianhai;Huang Chao
  • 通讯作者:
    Huang Chao
全基因组选择育种策略及在水产动物育种中的应用前景
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    中国水产科学
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    于洋;张晓军;李富花;相建海
  • 通讯作者:
    相建海

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其他文献

一种基于东北草场鼠洞的数字化检测方法
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  • 通讯作者:
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  • 通讯作者:
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  • 作者:
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  • 通讯作者:
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AI项目解读示例

课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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