亚低温脑保护基因芯片数据的生物信息学挖掘和枢纽基因功能研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号：
    30901543
  • 项目类别：
    青年科学基金项目
  • 资助金额：
    20.0万
  • 负责人：
    冯军峰
  • 依托单位：
    上海交通大学
  • 学科分类：
    H0910.神经损伤、修复与再生
  • 结题年份：
    2012
  • 批准年份：
    2009
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2010-01-01 至2012-12-31

项目摘要

1.首次筛选出亚低温后脑创伤大鼠海马即早基因组的差异表达谱，得出显著性Gene Ontology分类。在此基础上拟行Pathway显著性分析，构建靶向基因的功能网络，确定其中的枢纽基因。从而，从亚低温对脑创伤保护之分子机制的整体脉络出发，确立关键途径和分子，为其机制的深入研究指出可能的重要方向；并为创伤后脑保护研究提供重要的介入点（枢纽基因的干预）。 2.同时，对选定的枢纽基因- - 转谷氨酰胺酶2(Tgm2)进行纵深研究：观察其在脑创伤及亚低温作用后的时间－空间表达特征；结合应用RNA干扰技术和"细胞培养机械损伤模型"，通过控制Tgm2不同程度的表达，动态观察与神经损伤、细胞死亡模式及相关基因表达等多个环节的特点，探讨Tmg2在脑创伤中的作用和可能的分子机制。本研究将为其他枢纽基因的验证和探索提供一种研究模式，也为创伤后脑保护治疗提供一条新的研究策略。

结项摘要

创伤性脑损伤(TBI)后继发性损伤可导致大量神经细胞损伤和死亡，是TBI高死残率的重要病理基础，而众多“针对性”的临床药物干预研究都未能发现有效的神经保护药物。与此同时，亚低温的神经保护作用却在基础研究和临床实践中均得到广泛证实，但其作用机制尚不明确。本课题基于前期实验发现，运用基因芯片和生物信息学技术，以mRNA和MicroRNA基因芯片表达谱的改变为重点，结合特定基因的表达特征，开展了亚低温对TBI后大鼠海马基因表达量、类别、信号途径、调控网络的立体探索。研究对首次筛选出的133个TBI大鼠海马亚低温治疗后即早差异表达基因（mRNA水平）进行了功能聚类和信号通路分析，明确了“突触形成和发生”、 “突触传递”等在亚低温神经保护中的特殊重要作用；确定出Ank3、Cmbp、Nrxn、Tgm2和Fcgr3等关键枢纽基因。同时，“面”和“点”的研究相结合，观察到TBI后Nav1.3的mRNA和蛋白水平在海马神经元表达明显升高，并与伤情相关。生物信息学的快速发展，继而把课题研究推进到MicroRNA表达谱的检测和分析水平。目前通过构建MicroRNA-mRNA功能网络、MicroRNA-GO功能网络，绘制基因作用关系网络图（Signal-Net），进而从亚低温对TBI保护作用分子机制的立体调控层面，聚焦出最为关键的调控途径和分子，为TBI后神经保护研究提供新的思路和科学依据，为有效开发脑保护药物和技术，提供真正“针对性”的切入点。

项目成果

期刊论文数量（3）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（0）
专利数量（0）
Expression of Voltage-Gated Sodium Channel Nav1.3 Is Associated with Severity of Traumatic Brain Injury in Adult Rats
电压门控钠通道 Nav1.3 的表达与成年大鼠创伤性脑损伤的严重程度相关
  • DOI：
    10.1089/neu.2012.2508
  • 发表时间：
    2013-01-01
  • 期刊：
    JOURNAL OF NEUROTRAUMA
  • 影响因子：
    4.2
  • 作者：
    Huang, Xian-jian;Mao, Qing;Jiang, Ji-yao
  • 通讯作者：
    Jiang, Ji-yao
Effect of Therapeutic Mild Hypothermia on the Genomics of the Hippocampus After Moderate Traumatic Brain Injury in Rats
亚低温治疗对中度脑外伤大鼠海马基因组的影响
  • DOI：
    10.1227/01.neu.0000378023.81727.6e
  • 发表时间：
    2010-09-01
  • 期刊：
    NEUROSURGERY
  • 影响因子：
    4.8
  • 作者：
    Feng, Jun-feng;Zhang, Kui-ming;Liang, Yu-min
  • 通讯作者：
    Liang, Yu-min
Guided Migration of Neural Stem Cells Derived from Human Embryonic Stem Cells by an Electric Field
通过电场引导源自人胚胎干细胞的神经干细胞的迁移
  • DOI：
    10.1002/stem.779
  • 发表时间：
    2012-02-01
  • 期刊：
    STEM CELLS
  • 影响因子：
    5.2
  • 作者：
    Feng, Jun-Feng;Liu, Jing;Zhao, Min
  • 通讯作者：
    Zhao, Min

数据更新时间：{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI：
    {{ item.doi || "--"}}
  • 发表时间：
    {{ item.publish_year || "--" }}
  • 期刊：
    {{ item.journal_name }}
  • 影响因子：
    {{ item.factor || "--"}}
  • 作者：
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者：
    {{ item.author }}

数据更新时间：{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者：
    {{ item.authors }}

数据更新时间：{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者：
    {{ item.authors }}

数据更新时间：{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者：
    {{ item.authors }}

数据更新时间：{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者：
    {{ item.authors }}

数据更新时间：{{ patent.updateTime }}

其他文献

脑损伤后大鼠海马差异蛋白质组学分析
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    中华创伤杂志
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    包映辉;FU Xian;JIANG Ji-yao;张夔鸣;高国一;ZHANG Kui-ming;江基尧;BAO Ying-hui;PAN Yao-hua;GAO Guo-yi;傅西安;LIANG Yu-min;冯军峰;FENG Jun-feng;梁玉敏;潘耀华
  • 通讯作者：
    潘耀华
颅脑创伤患者颅内压相关参数与预后关系的研究
  • DOI：
    10.3760/cma.j.issn.1001-2346.2018.02.003
  • 发表时间：
    2018
  • 期刊：
    中华神经外科杂志
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    吴翔;高国一;冯军峰;毛青;江基尧
  • 通讯作者：
    江基尧
颅脑创伤后亚低温脑保护的蛋白质组研究
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    中华神经外科杂志
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    冯军峰;傅西安;LIANG Yu-min;FU Xi-an;高国一;潘耀华;江基尧;FENG Jun-feng;GAO Guo-yi;包映辉;张夔鸣;梁玉敏;PAN Yao-hua;ZHANG Kui-ming;JIANG Ji-yao;BAO Ying-hui
  • 通讯作者：
    BAO Ying-hui
颅脑创伤患者颅内压波形中纺锤波的意义
  • DOI：
    10.3760/cma.j.issn.1001-2346.2017.07.004
  • 发表时间：
    2017
  • 期刊：
    中华神经外科杂志
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    吴翔;高国一;陈文劲;冯军峰;毛青;江基尧
  • 通讯作者：
    江基尧
小胶质细胞对创伤性脑损伤病理生理影响的研究进展
  • DOI：
    10.3760/cma.j.issn.1001-8050.2020.08.013
  • 发表时间：
    2020
  • 期刊：
    中华创伤杂志
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    马羽霄;杨春;冯军峰
  • 通讯作者：
    冯军峰

其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI：
    {{ item.doi || "--" }}
  • 发表时间：
    {{ item.publish_year || "--"}}
  • 期刊：
    {{ item.journal_name }}
  • 影响因子：
    {{ item.factor || "--" }}
  • 作者：
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者：
    {{ item.author }}
empty
内容获取失败，请点击重试
重试联系客服
title开始分析
查看分析示例
此项目为已结题，我已根据课题信息分析并撰写以下内容，帮您拓宽课题思路：

AI项目思路

AI技术路线图

冯军峰的其他基金

亚低温调控颅脑创伤急性期神经干细胞Mpc2/Lactate/H3K9lac通路促进神经修复的研究
  • 批准号：
    82371379
  • 批准年份：
    2023
  • 资助金额：
    49.00 万元
  • 项目类别：
    面上项目
物理干预调控小胶质细胞的神经保护作用及机制研究
  • 批准号：
    81771317
  • 批准年份：
    2017
  • 资助金额：
    54.0 万元
  • 项目类别：
    面上项目
直流电场对神经细胞的诱导迁移作用和机制研究
  • 批准号：
    31371406
  • 批准年份：
    2013
  • 资助金额：
    75.0 万元
  • 项目类别：
    面上项目

相似国自然基金

{{ item.name }}
  • 批准号：
    {{ item.ratify_no }}
  • 批准年份：
    {{ item.approval_year }}
  • 资助金额：
    {{ item.support_num }}
  • 项目类别：
    {{ item.project_type }}

相似海外基金

{{ item.name }}
{{ item.translate_name }}
  • 批准号：
    {{ item.ratify_no }}
  • 财政年份：
    {{ item.approval_year }}
  • 资助金额：
    {{ item.support_num }}
  • 项目类别：
    {{ item.project_type }}
{{ showInfoDetail.title }}

作者：{{ showInfoDetail.author }}

知道了

AI项目解读示例

课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
关闭
close
客服二维码