核酸-蛋白质相互作用及其与进化的关系

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号：
    30470939
  • 项目类别：
    面上项目
  • 资助金额：
    18.0万
  • 负责人：
    黄京飞
  • 依托单位：
    中国科学院昆明动物研究所
  • 学科分类：
    C0602.基因表达及非编码序列调控
  • 结题年份：
    2007
  • 批准年份：
    2004
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2005-01-01 至2007-12-31

项目摘要

通过比较分析具有广泛分布的含有OB-fold折叠结构的结合核酸的蛋白质结构域超家族成员与DNA、RNA、tRNA或蛋白质相互作用部位或区域的序列、结构、反应催化机制和专一性的差别，以及它们在不同基因组中的异同，对于适应同一蛋白质的多种不同功能的序列和结构基础，蛋白质的不同结构域组合影响同源结构域功能异同的关键因素，蛋白质-核酸专一相互作用在进化过程中的进化规律，从结构生物信息学的角度提出新的诠释。对于弄清同一蛋白质适应多种不同功能的序列和结构基础及其这些功能的演化机制，核酸-蛋白质专一相互作用的进化，遗传信息的准确传递，核酸-蛋白质以及蛋白质-蛋白质间专一相互作用的本质等问题都具重要的科学意义。

结项摘要

项目成果

期刊论文数量（6）
专著数量（1）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（7）
专利数量（0）
Evolution of different oligome
不同寡聚体的进化
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
  • 通讯作者：
氨酰-tRNA合成酶的进化差异
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    动物学研究，28：563-567。2007。
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    唐素妮;黄京飞
  • 通讯作者：
    黄京飞
DNA拓扑异构酶II与IA的进化分析
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    动物学研究，27：595-600。2006。
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    任永明;唐素妮;黄京飞
  • 通讯作者：
    黄京飞
Adaptive evolution of the firs
第一个的适应性进化
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    李英;黄京飞;张亚平
  • 通讯作者：
    张亚平
Identification and Molecular e
鉴定与分子电子
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    李英;黄京飞
  • 通讯作者：
    黄京飞

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  • 作者：
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其他文献

Molecular dynamics simulation of PNPLA3 I148M polymorphism reveals reduced substrate access to the catalytic cavity
PNPLA3 I148M 多态性的分子动力学模拟揭示了底物进入催化腔的减少
  • DOI：
    10.1002/prot.24199
  • 发表时间：
    2012
  • 期刊：
    Proteins: Structure, Function, and Genetics
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    黄京飞
  • 通讯作者：
    黄京飞
CDRUG: a web server for predicting anticancer activity of chemical compounds
CDRUG：用于预测化合物抗癌活性的网络服务器
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2012
  • 期刊：
    Bioinformatics
  • 影响因子：
    5.8
  • 作者：
    黄京飞
  • 通讯作者：
    黄京飞
Benchmarking Human Protein Complexes to Investigate Drug-Related Systems and Evaluate Predicted Protein Complexes
对人类蛋白质复合物进行基准测试以研究药物相关系统并评估预测的蛋白质复合物
  • DOI：
    10.1038/nplants.2015.89
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    PLos One
  • 影响因子：
    3.7
  • 作者：
    黄京飞
  • 通讯作者：
    黄京飞
真核生物DNA连接酶Ⅲ的功能演化
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2012
  • 期刊：
    中国科学技术大学学报
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    靳春艳;盛自章;黄京飞
  • 通讯作者：
    黄京飞
Molecular dynamics simulations and statistical coupling analysis reveal functional coevolution network of oncogenic mutations in the CDKN2A-CDK6 complex
分子动力学模拟和统计耦合分析揭示了 CDKN2A-CDK6 复合物中致癌突变的功能协同进化网络
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2012
  • 期刊：
    FEBS Letters
  • 影响因子：
    3.5
  • 作者：
    黄京飞
  • 通讯作者：
    黄京飞

其他文献

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黄京飞的其他基金

适应性进化的分子机制研究
  • 批准号：
    31123005
  • 批准年份：
    2011
  • 资助金额：
    300.0 万元
  • 项目类别：
    专项基金项目
几个重要基因和基因家族功能的进化
  • 批准号：
    30623007
  • 批准年份：
    2006
  • 资助金额：
    120.0 万元
  • 项目类别：
    专项基金项目
氨酰-tRNA合成酶专一识别机制与其进化的关系
  • 批准号：
    30170507
  • 批准年份：
    2001
  • 资助金额：
    17.0 万元
  • 项目类别：
    面上项目

相似国自然基金

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  • 批准号：
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相似海外基金

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课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
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