c-di-GMP信号受体与前噬菌体蛋白共调控细菌毒性表达的分子机理

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AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31671990
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    60.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C1401.植物病理学
  • 结题年份:
    2020
  • 批准年份:
    2016
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2017-01-01 至2020-12-31

项目摘要

Functional identification of the receptors is of scientific importance for elucidation of the c-di-GMP signaling pathway involved in regulation of virulence in pathogenic bacteria. Our previous studies identified the cyclic di-GMP receptor PXO_02374, which is a PilZ-domain containing protein and involved in negative regulation of virulence of Xanthomonas oryzae pv. oryzae (Xoo) strain PXO99A. The specific interaction between PXO_02374 and PXO_03510, a putative prophage protein occurred. Single and double gene deletion of two interacting proteins resulted in increased virulence of the pathogen, indicating their negative co-regulation of Xoo virulence. These results suggest the existence of a novel c-di-GMP signal pathway in Xoo, in which PXO_02374 interacts with PXO_03510, and whereby regulates bacterial virulence expression. Here, further studies on the molecular interactions of PXO_02374-PXO_03510 and its regulatory mechanism(s) of virulence of Xoo will be proposed, including interaction modes, the relationship and regulation between PXO_03510 and PXO_02374, subcellular localization, co-regulation of downstream genes. The objectives of this study are to demonstrate the novel PilZ-type receptor-mediated c-di-GMP signaling pathway, and to reveal the negative regulatory mechanism(s) of virulence in Xoo.
c-di-GMP信号受体参与细菌毒性调控机制的研究将有助于细菌信号调控机理的解析。前期鉴定了一个对水稻白叶枯病菌毒性具有抑制功能的c-di-GMP信号受体—PilZ结构域蛋白PXO_02374,其与前噬菌体蛋白PXO_03510特异性互作,二者基因缺失突变均导致致病性增强,推测病菌可能具有一个新的c-di-GMP信号通路。本申请拟深入探究两个互作蛋白的作用方式以及对病菌毒性调控的分子机理,内容包括:(1)c-di-GMP—互作蛋白(PXO_02374和PXO_03510)的作用机制研究;(2)PXO_02374与PXO_03510的表达调控关系研究; (3)互作蛋白亚细胞定位;(3)互作蛋白对水稻白叶枯病菌毒性表达的共调控作用分析。本研究旨在鉴定和发掘PilZ受体介导的c-di-GMP信号调控新途径,揭示其负向调控Xoo毒性表达的分子机理。

结项摘要

前期研究发现,c-di-GMP信号受体蛋白PilZX2 (PXO_02374)可以作为c-di-GMP受体负调控水稻白叶枯病菌(Xoo)毒性表达(Yang et al., AEM, 2015)。本项目进一步解析了PilZX2通过与前噬菌体蛋白PXO_03510(ProP)及c-di-GMP信号代谢蛋白互作对Xoo毒性的调控机制,研究内容包括:1)PilZX2与ProP互作机制及运动性调控分析;2) c-di-GMP受体PilZX2与c-di-GMP信号代谢蛋白互作分析;3) PilZX2与GdpX6的互作机制研究; 4) PilZX2与GdpX6毒性调控功能分析;5) PilZX2与GdpX6亚细胞定位分析;6) c-di-GMP受体Filp及其互作蛋白PilZX3下游的共调控蛋白的鉴定;7) c-di-GMP代谢酶PdeR互作蛋白的鉴定;8) c-di-GMP代谢蛋白PXO_03945的功能鉴定与分析。取得了主要研究结果包括:1) 研究发现PilZX2与ProP负调控Xoo运动性,但是与ProP互作并不影响PilZX2与c-di-GMP的结合;2) 鉴定了PilZX2可以和17个c-di-GMP代谢蛋白发生互作,其中包括GGDEF结构域蛋白GdpX6; 3) GdpX6具有DGC活性,并且可以和c-di-GMP结合;4) 发现GdpX6负调控Xoo的毒性和鞭毛运动,正调控Xoo的菌毛运动和生物膜形成;5) PilZX2和GdpX6都是多细胞定位;6) 鉴定了Filp/PilZX3共同调控下游的共调控蛋白,包括多个受c-di-GMP信号调控的Xoo中的毒性新因子;7)反应调控蛋白TriP通过与c-di-GMP磷酸二酯酶PdeR相互作用,正调控Xoo毒性和EPS的产生;8) PXO_03945正调控 Xoo致病性、运动以及体内c-di-GMP水平,负调控 EPS和生物膜的产生;9) 综述了水稻黄单胞菌c-di-GMP信号转导的关键成分及其在黄单胞菌中的同源序列,以及c-di-GMP受体介导的细菌行为调控和病原菌中c-di-GMP受体调控机制的研究进展。本研究初步阐明了水稻白叶枯病菌中PilZX2通过与下游蛋白互作负调控Xoo毒性机制。

项目成果

期刊论文数量(6)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
水稻白叶枯病菌HD-GYP结构域蛋白PXO_03945的功能鉴定
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    植物病理学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    钱珊珊;杨凤环;田芳;陈华民;何晨阳
  • 通讯作者:
    何晨阳
Identification of the Regulatory Components Mediated by the Cyclic di-GMP Receptor Filp and Its Interactor PilZX3 and Functioning in Virulence of Xanthomonas oryzae pv. oryzae
环状二 GMP 受体 Filp 及其相互作用物 PilZX3 介导的调节成分的鉴定及其在米黄单胞菌毒力中的功能。
  • DOI:
    10.1094/mpmi-04-20-0088-r
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    Molecular Plant-Microbe Interactions
  • 影响因子:
    3.5
  • 作者:
    Shahbaz Muhammad Umar;Qian Shanshan;Yun Fei;Zhang Jie;Yu Chao;Tian Fang;Yang Fenghuan;Chen Huamin
  • 通讯作者:
    Chen Huamin
Identification of c-di-GMP Signaling Components in Xanthomonas oryzae and Their Orthologs in Xanthomonads Involved in Regulation of Bacterial Virulence Expression
米黄单胞菌中 c-di-GMP 信号传导成分的鉴定及其黄单胞菌中参与细菌毒力表达调节的直系同源物
  • DOI:
    10.3389/fmicb.2019.01402
  • 发表时间:
    2019-07
  • 期刊:
    Frontiers in Microbiology
  • 影响因子:
    5.2
  • 作者:
    Yang Fenghuan;Xue Dingrong;Tian Fang;Hutchins William;Yang Ching Hong;He Chenyang
  • 通讯作者:
    He Chenyang
水稻白叶枯病菌T3SS基因表达及其调控网络
  • DOI:
    10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2017-1011
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    生物技术通报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    范素素;田芳;何晨阳
  • 通讯作者:
    何晨阳
Xanthomonas oryzae pv. oryzae Response Regulator TriP Regulates Virulence and Exopolysaccharide Production Via Interacting With c-di-GMP Phosphodiesterase PdeR
米黄单胞菌 pv.
  • DOI:
    10.1094/mpmi-09-18-0260-r
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    Molecular Plant-Microbe Interactions
  • 影响因子:
    3.5
  • 作者:
    Li Haiyun;Xue Dingrong;Tian Fang;Yuan Xiaochen;Yang Fenghuan;Chen Huamin;Hutchins William;Yang Ching Hong;He Chenyang
  • 通讯作者:
    He Chenyang

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  • 通讯作者:
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  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    中国农业科学,2007,40 (2): 377-382
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
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  • 通讯作者:
    何晨阳
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  • 发表时间:
    --
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    --
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  • 通讯作者:
    何晨阳
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  • 通讯作者:
    何晨阳
水稻白叶枯病菌第二信使c-di-GMP代谢酶基因的预测和分析
  • DOI:
    10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2015.11.016
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    2015
  • 期刊:
    生物技术通报
  • 影响因子:
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  • 作者:
    薛丁榕;田芳;李海云;杨凤环;陈华民;何晨阳
  • 通讯作者:
    何晨阳

其他文献

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AI项目解读示例

课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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