医疗文本大数据分析中的统计学模型和方法

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    11771242
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    48.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    A0403.贝叶斯统计与统计应用
  • 结题年份:
    2021
  • 批准年份:
    2017
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2018-01-01 至2021-12-31

项目摘要

In past 20 years, millions of Electronic Medical Records (EMRs) have been cumulated in China's hospitals. These EMRs record rich information on what patients have experienced in hospitals, and contain great values. However, the Chinese texts in these EMRs introduce great challenges in data analysis. For example, identification and standardization of medical terminologies and reconstruction of the medical scenario encoded by medical texts are both very challenging but also very important tasks in EMR analysis. In this project, we plan to study these challenging problems from the statistical perspective. We hope to build statistical models for mining Chinese medical texts and standardizing disease names, and investigate the statistical inference and computation of these models. We also want to connect the problem of medical text analysis with medical knowledge database, and establish a intelligent statistical framework with which the two sides can efficiently interact and help each other.
过去20年,我国的各个大型医院积累了数以亿计的“电子病历”档案。这些“电子病历”详细记录了病人在医院就诊过程中的大量信息,对它们的深入挖掘具有极高的科学和社会价值。但是,“电子病历”中以自然语言形式出现的中文文本给数据分析带来了极大的挑战。 例如,“对医学文本中的医学术语进行识别和标准化”、“对医学文本中的多维度医学信息进行有效整合以准确重构医学场景”都是医学大数据分析中的核心问题,也是极其困难的问题。本项目力图从统计学角度研究这些问题,建立针对中文电子病历文本分析的统计模型,和能够高效实现“疾病名称”标准化的统计模型,并解决其中的统计推断和统计计算问题。同时,探索构建能够使“医学文本分析”与“医学知识库”高效互动的统计学框架,以更有效地促进医学知识库系统的自我完善和医学自然语言的语意理解。

结项摘要

过去20年,我国的各个大型医院积累了数以亿计的“电子病历”档案。这些“电子病 历”详细记录了病人在医院就诊过程中的大量信息,对它们的深入挖掘具有极高的科学和 社会价值。但是,“电子病历”中以自然语言形式出现的中文文本给数据分析带来了极大 的挑战。 例如,“对医学文本中的医学术语进行识别和标准化”、“对医学文本中的多 维度医学信息进行有效整合以准确重构医学场景”都是医学大数据分析中的核心问题,也 是极其困难的问题。本项目力图从统计学角度研究这些问题,建立针对中文电子病历文本 分析的统计模型,和能够高效实现“疾病名称”标准化的统计模型,并解决其中的统计推 断和统计计算问题。同时,探索构建能够使“医学文本分析”与“医学知识库”高效互动 的统计学框架,以更有效地促进医学知识库系统的自我完善和医学自然语言的语意理解。

项目成果

期刊论文数量(10)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(1)
DEsingle for detecting three types of differential expression in single-cell RNA-seq data
DEsingle 用于检测单细胞 RNA-seq 数据中三种类型的差异表达
  • DOI:
    10.1101/173997
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    Bioinformatics
  • 影响因子:
    5.8
  • 作者:
    Miao Zhun;Deng Ke;Wang Xiaowo;Zhang Xuegong
  • 通讯作者:
    Zhang Xuegong
RAPID DESIGN OF METAMATERIALS VIA MULTITARGET BAYESIAN OPTIMIZATION
通过多目标贝叶斯优化快速设计超材料
  • DOI:
    10.1214/20-aoas1426
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    Annals of Applied Statistics
  • 影响因子:
    1.8
  • 作者:
    Yang Yang;Ji Chunlin;Deng Ke
  • 通讯作者:
    Deng Ke
MiRACLe: an individual-specific approach to improve microRNA-target prediction based on a random contact model
MiRACLe:基于随机接触模型改进 microRNA 靶点预测的个体特异性方法
  • DOI:
    10.1093/bib/bbaa117
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    Briefings in Bioinformatics
  • 影响因子:
    9.5
  • 作者:
    Pan Wang;Qi Li;Nan Sun;Yibo Gao;Jun S Liu;Ke Deng;Jie He
  • 通讯作者:
    Jie He
From Object Detection to Text Detection and Recognition: a Brief Evolution History of Optical Character Recognition
从物体检测到文本检测和识别:光学字符识别的简史
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    WIREs Computational Statistics
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Haifeng Wang;Changzai Pan;Xiao Guo;Chunlin Ji;Ke Deng
  • 通讯作者:
    Ke Deng
Partition-Mallows Model and Its Inference for Rank Aggregation
划分-Mallows模型及其排序聚合推理
  • DOI:
    10.1080/01621459.2021.1930547
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    Journal of the American Statistical Association
  • 影响因子:
    3.7
  • 作者:
    Zhu Wanchuang;Jiang Yingkai;Liu Jun S.;Deng Ke
  • 通讯作者:
    Deng Ke

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其他文献

熔盐堆中石墨吸附氚的理论研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    核技术
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    吴喜军;钱楠;王广华;黄豫;邓柯;陈学坤;曾友石;吴胜伟;刘文冠;刘卫
  • 通讯作者:
    刘卫

其他文献

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邓柯的其他基金

复杂空间上具有特殊约束的Monte Carlo方法
  • 批准号:
    12371269
  • 批准年份:
    2023
  • 资助金额:
    43.5 万元
  • 项目类别:
    面上项目
无指导汉语文本挖掘的统计模型和统计推断
  • 批准号:
    11401338
  • 批准年份:
    2014
  • 资助金额:
    22.0 万元
  • 项目类别:
    青年科学基金项目

相似国自然基金

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相似海外基金

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知道了

AI项目解读示例

课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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