镁离子转运蛋白CorC受腺苷类配体以及镁离子调控的分子机理的生物化学和结构生物学研究

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基本信息

  • 批准号:
    31270792
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    80.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0501.结构生物学
  • 结题年份:
    2016
  • 批准年份:
    2012
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2013-01-01 至2016-12-31

项目摘要

Considering the biological abundance and importance of Mg2+, there is a surprising lack of information regarding the proteins that transport Mg2+, the mechanisms by which they do so, and their physiological roles within the cell. The magnesium channel CorA could not efflux Mg2+ independently whereas another magnesium channel MgtE does. A magnesium transporter CorC could assist CorA to efflux Mg2+, containing a CBS domain pair which is also observed in the cytosolic domain of MgtE. In this study, we would identify the profile of adenine nucleotide ligand and so on CorC binds, determine the crystal structures of CorC-ligands and CorC-ion complex, reveal the protein conformational change induced by ligands, discover the interaction between CorC and other proteins involving in ligand binding, illustrate the mechanism of CorC involved in CorA magnesium transporter system, and then study the difference of CorA and MgtE magnesium transporter system. On the other side, point or deletion mutations in CBS domains of several human enzymes and membrane channels are associated with hereditary diseases, including homocystinuria, retinitis pigmentosa, Bartter syndrome, osteopetrosis, Dent disease, Wolff-Parkinson-White syndrome, and familial hypertrophic cardiomyopathy. Based on the mechanism of CorC involved in magnesium transporter and sensing adenine nucleotides, we would study the mechanisms how mutations in CBS domains leads to losing the abilities of binding ligands or proteins and how mutations are involved in human diseases.
离子转运蛋白的研究是蛋白质科学领域的研究热点。目前在镁离子转运机理的研究上,相对于镁离子的生物体内丰度和重要性,我们对其转运机理和意义严重缺乏认知。镁离子通道蛋白CorA不能单独外溢镁离子,而另一镁离子通道蛋白MgtE可以。镁离子转运蛋白CorC含有一个MgtE胞质区具有的CBS结构域,可以协助CorA实现镁离子外溢。我们拟鉴定CorC以及其CBS结构域与腺苷类配体的结合特性,测定CorC与配体以及金属离子等复合物的晶体结构,阐释其在配体调控下的构象变化以及配体调控下的蛋白-蛋白相互作用,研究CorC受配体调控参与CorA镁离子转运系统行使离子转运功能的分子机理,探索CorA与MgtE镁离子转运系统离子转运特性的异同。同时我们将以CorC的CBS结构域研究为基础,探索人类CBS结构域蛋白质的CBS结构域突变引起人类遗传性疾病的分子机理,为此类遗传性疾病的发生、发展和干预提供理论基础指导。

结项摘要

目前在镁离子转运机理方面,相对于镁离子的生物体内丰度和重要性,我们对其转运机理和意义严重缺乏认知。镁离子通道蛋白CorA不能单独外溢镁离子,而另一镁离子通道蛋白MgtE可以。镁离子转运蛋白CorC含有一个MgtE胞质区具有的CBS结构域,可以协助CorA实现镁离子外溢。同时与CorC一样含有CBS结构域的镁离子转运蛋白CNNM2/CNNM3等已经明确受腺苷酸类配体调控直接参与镁离子转运蛋白。 为了研究CorC参与镁离子转运调控的机理,我们鉴定了CorC以及其CBS结构域与腺苷酸类配体的结合特性,测定CorC与配体以及金属离子等复合物的晶体结构,构建了CorC敲除株并观察了其在不同金属离子浓度下的生长。晶体结构和其他生化实验数据显示CorC通过CBS结构域结合三种配体呈现三种显著差异的构象状态,揭示了腺苷酸类配体通过CBS结构域调控CorC参与镁离子转运的结构基础,也揭示了一种可能的镁离子转运调控的三状态切换模型。蛋白质-腺苷酸配体-金属离子三元复合物结构和相关生化研究揭示了镁离子通过调控蛋白质-腺苷酸相互作用来调控蛋白质构象从而参与离子浓度依赖的离子转运调控的机理。同时我们以CorC的CBS结构域研究为基础,探索了人类CBS结构域蛋白质的CBS结构域突变引起人类遗传性疾病的分子机理,为此类遗传性疾病的发生、发展和干预提供理论基础指导。

项目成果

期刊论文数量(7)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Crystallization and preliminary crystallographic studies of AAL-2, a novel lectin from Agrocybe aegerita that binds nonreducing terminal N-acetylglucosamine
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  • DOI:
    10.1107/s1744309113011639
  • 发表时间:
    2013-06-01
  • 期刊:
    ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION F-STRUCTURAL BIOLOGY COMMUNICATIONS
  • 影响因子:
    0.9
  • 作者:
    Ren, Xiaoming;Jiang, Shuai;Wang, Dacheng
  • 通讯作者:
    Wang, Dacheng
Molecular Structural Basis for the Cold Adaptedness of the Psychrophilic beta-Glucosidase BglU in Micrococcus antarcticus
南极微球菌嗜冷β-葡萄糖苷酶BglU冷适应的分子结构基础
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    Applied and Environmental Microbiology
  • 影响因子:
    4.4
  • 作者:
    Qi, Chao;Liu, Ying;Li, De-Feng;Liu, Zhi-Pei
  • 通讯作者:
    Liu, Zhi-Pei
Biochemical and structural characterization of a novel ubiquitin-conjugating enzyme E2 from Agrocybe aegeria reveals Ube2w family-specific properties.
来自 Agrocybe aegeria 的新型泛素结合酶 E2 的生化和结构表征揭示了 Ube2w 家族特有的特性。
  • DOI:
    10.1038/srep16056
  • 发表时间:
    2015-11-03
  • 期刊:
    Scientific reports
  • 影响因子:
    4.6
  • 作者:
    Qi C;Li DF;Feng L;Hou Y;Sun H;Wang DC;Liu W
  • 通讯作者:
    Liu W

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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