嗜盐古菌hsp70基因的特殊应激转录调控机制

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    30970070
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    32.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0104.微生物遗传与生物合成
  • 结题年份:
    2012
  • 批准年份:
    2009
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2010-01-01 至2012-12-31

项目摘要

Hsp70蛋白是三域生物共有的一种重要的分子伴侣和热激蛋白。我们研究发现嗜盐古菌Natrinema sp. J7菌Hsp70系统的三个基因(grpE-hsp70-hsp40)座位排列方式类似于细菌,然而其hsp70基因转录和翻译的方式却类似于真核生物。虽然J7菌hsp70启动子中有典型的TATA box,但是没有与已知热激元件相类似的保守序列。研究还发现J7菌hsp70基因不仅在热激时表达量增加,而且在冷激和低盐环境中表达量也大大增加。为此,本项目将在J7菌基因组序列已经完成的基础上,确定与其hsp70基因应激转录调控相关的基本转录因子和调节因子;同时开展hsp70基因在应激条件下转录调控的体内外分析;最后对嗜盐古菌hsp70基因的应激转录调控机制提出新的见解。本研究不仅有助于了解Hsp70蛋白在嗜盐古菌中的功能及古菌适应极端环境的机理,而且有可能发现在古菌中尚缺的高效、可调的启动子资源。

结项摘要

Hsp70蛋白是三域生物共有的一种重要的分子伴侣和热激蛋白。我们研究发现嗜盐古菌Natrinema sp. J7菌Hsp70系统的三个基因(grpE-hsp70-hsp40)座位排列方式类似于细菌,然而其hsp70基因转录却类似于真核生物。虽然J7菌hsp70启动子中有典型的TATA box,但是没有与已知热激元件相类似的保守序列。为此,本项目首先分析了已知的各类嗜盐古菌hsp70基因启动子的序列特征,发现嗜盐古菌hsp70启动子中存在一个类似于真核生物kozak序列的一致序列。接着对J7菌及其它嗜盐古菌中的启动子一致序列进行了点突变分析,实验结果表明该kozak类似序列在hsp70基因表达中起重要作用,其中的重要碱基不仅影响基因的转录水平,也影响基因的翻译效率。为确定参与hsp70基因表达的转录因子,我们对J7菌基因组序列中唯一的tbp基因和8个tfb基因进行了表达纯化,并制备了相应的多克隆抗体,尝试了启动子与转录因子的体外相互作用。随后,建立了Natrinema sp. J7菌的基因敲除系统,对其tfb基因分别进行了敲除,确定参与hsp70基因转录的TFB因子。由于前期研究中发现J7菌hsp70基因不仅在热激时表达增加,而且在冷激和低盐环境中表达量也大大增加,因此本研究中也开展了Hsp70功能的初步研究,结果表明与细菌相同的是在高温下缺失hsp70基因的菌株无法正常生长,然而任何条件下,嗜盐古菌中hsp70基因的缺失都不会改变菌的形态,并且在最适生长条件及低温下,hsp70基因的缺失也不会影响菌的生长。总之,本项目研究了嗜盐古菌hsp70基因特征序列对基因表达的作用,并确定参与基因表达的基本转录因子;建立了Natrinema sp. J7菌的基因敲除系统,开展了嗜盐古菌Hsp70蛋白的功能初步研究。本研究结果说明嗜盐古菌hsp70基因的表达机制及Hsp70蛋白的功能与细菌的明显不同,为揭示嗜盐古菌适应极端环境的机理奠定了良好的基础。

项目成果

期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(3)
专利数量(0)

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其他文献

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  • 通讯作者:
    沈萍

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黄玉屏的其他基金

嗜盐古生菌HSP70蛋白基因的转录及其调控研究
  • 批准号:
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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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