大型浅水富营养化湖泊微生物时空格局及驱动机制

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    41471040
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    95.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    D0103.生物地理与土壤地理
  • 结题年份:
    2018
  • 批准年份:
    2014
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2015-01-01 至2018-12-31

项目摘要

Microorganism plays a vital role in maintaining ecosystem function in lakes. For centuries, the patterns of plants and animals have been studied extensively at different temporal and spatial scales, while few similar studies have been carried out for microorganisms in the past due to the limitation of techniques. In this proposed study, five large shallow eutrophic lakes, i.e. Lake Taihu, Lake Chaohu, Lake Poyang, Lake Hongze and Lake Dianchi, were chosen to explore the biogeography patterns of prokaryotic microorganism (mainly bacteria and archaea). Using 16S rRNA gene based high-throughput sequencing, geographic information system and multivariate statistical analysis, we are going to elucidate the temporal and spatial patterns of prokaryotic microbial abundance, community composition and diversity. Meanwhile, the contribution of geography distance and modern environmental factors, such as cyanobacterial blooms, aquatic plant and riverine input, to the patterns were investigated quantitatively. The observed results would supply the clear evidence of whether the microbial pattern is similar to the macro-organism's. And it would helpful to the development biogeography and provide important insights into the protection of eutrophic lake ecosystems.
微生物在维持湖泊生态系统功能方面具有重要作用,然而囿于技术的限制,对于微生物时空格局及形成机制的研究长期滞后于大型生物。本研究拟以我国大型浅水富营养化湖泊太湖、巢湖、鄱阳湖、洪泽湖和滇池为研究对象,利用高通量基因测序、地理信息系统及多元统计分析等手段,通过对不同尺度下原核微生物(细菌和古菌)的生物地理学研究,阐明富营养化湖泊中原核微生物多度、群落组成及多样性的时空格局,定量解析空间距离和当代环境因素(如蓝藻水华、营养盐、水草分布、河流输入等)对其时空格局形成的贡献。研究结果可以提供湖泊微生物时空格局在本质上与大型生物是否相似的证据,促进生物地理学的学科发展,并为富营养化湖泊生态系统保护提供科学依据。

结项摘要

本研究主要以我国大型浅水富营养化湖泊太湖、巢湖、鄱阳湖、洪泽湖和滇池为研究对象,利用高通量基因测序、地理信息系统及多元统计分析等手段,通过对不同尺度下原核微生物的生物地理学研究,阐明富营养化湖泊中原核微生物多度、群落组成及多样性的时空格局,定量解析空间距离和当代环境因素对其时空格局形成的贡献,并试图解答以下几个科学问题:(1)大型浅水富营养化湖泊中原核微生物是随机分布的?还是具有一定时空分布格局?(2)如果具有时空格局,那么不同尺度下其时空格局驱动机制是否不同?(3)各尺度下历史进化因素(以空间距离为表征)和当代环境因素的相对贡献有多大?..通过对我国大型浅水富营养化湖泊不同尺度下微生物时空格局及其驱动机制研究,我们发现:(1)大型浅水富营养化湖泊中原核微生物不是随机分布的,它与动植物的地理学分布一样也具有时空分布格局;(2)不同尺度下其时空格局驱动机制有所不同,局域尺度下(如太湖全湖尺度)随机过程所起的作用要远大于确定性过程,如环境因子和地理因素所起的作用;随着尺度的增加,在区域尺度下(约3000km),由于扩散限制,地理隔离所驱动的微生物群落分异作用增大;(3)局域尺度下空间距离和当代环境因子的相对贡献分别约为5%和9%,两者共同贡献约为8%;区域尺度下空间距离和当代环境因子的相对贡献分别约为6%和17%,两者共同贡献约为8%。(4)确定性过程对微生物群落变异的低解释率暗示随机过程及种间相互作用在湖泊微生物群落时空格局研究中的重要性,定量解析它们的贡献将是下一步研究的重点。上述研究提供了湖泊微生物时空分布格局在本质上与大型生物相似的证据,为阐释生物界的普遍原理(即地球上所有生物不仅使用相似的遗传物质,也遵循相似的生态学、进化学及生物地理学原则)提供了理论基础和科学依据。

项目成果

期刊论文数量(18)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Spatiotemporal dynamics of bacterial community composition in large shallow eutrophic Lake Taihu: High overlap between free-living and particle-attached assemblages
大型浅层富营养化太湖细菌群落组成的时空动态:自由生活和颗粒附着组合之间的高度重叠
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    LIMNOLOGY AND OCEANOGRAPHY
  • 影响因子:
    4.5
  • 作者:
    Tang Xiangming;Chao Jianying;Gong Yi;Wang Yongping;Wilhelm Steven W.;Gao Guang
  • 通讯作者:
    Gao Guang
Spatial variation of surface sediment nutrients in the large shallow eutrophic lake taihu, china
大型浅层富营养化太湖表层沉积物养分空间变化
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    Fresenius Environmental Bulletin
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Shao Keqiang;Gao Guang;Tang Xiangming;Dai Jiangyu;Liu Hao;Gong Yi;Hu Yang;Qin Boqiang
  • 通讯作者:
    Qin Boqiang
Molecular prediction of lytic vs lysogenic states for Microcystis phage: Metatranscriptomic evidence of lysogeny during large bloom events
微囊藻噬菌体裂解与溶原状态的分子预测:大型水华事件期间溶原的宏转录组证据
  • DOI:
    10.1371/journal.pone.0184146
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    PLOS ONE
  • 影响因子:
    3.7
  • 作者:
    Stough Joshua M. A.;Tang Xiangming;Krausfeldt Lauren E.;Steffen Morgan M.;Gao Guang;Boyer Gregory L.;Wilhelm Steven W.
  • 通讯作者:
    Wilhelm Steven W.
Characterization of bacterial and microbial eukaryotic communities associated with an ephemeral hypoxia event in Taihu Lake, a shallow eutrophic Chinese lake
与太湖(中国浅层富营养化湖泊)短暂缺氧事件相关的细菌和微生物真核生物群落特征
  • DOI:
    10.1007/s11356-018-2987-x
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    Environmental Science and Pollution Research
  • 影响因子:
    5.8
  • 作者:
    Cai Jian;Bai Chengrong;Tang Xiangming;Dai Jiangyu;Gong Yi;Hu Yang;Shao Keqiang;Zhou Lei;Gao Guang
  • 通讯作者:
    Gao Guang
Pyrosequencing analysis of bacterial communities in Lake Bosten, a large brackish inland lake in the arid northwest of China
中国西北干旱地区大型咸水内陆湖博斯滕湖细菌群落的焦磷酸测序分析
  • DOI:
    10.1139/cjm-2015-0494
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    Canadian Journal of Microbiology
  • 影响因子:
    2.8
  • 作者:
    Zhang Lei;Gao Guang;Tang Xiangming;Shao Keqiang;Gong Yi
  • 通讯作者:
    Gong Yi

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其他文献

The shift from macrophytic to algal particulate organic matter favours dissimilatory nitrate reduction to ammonium over denitrification in a eutrophic lake
在富营养化湖泊中,从大型植物到藻类颗粒有机物的转变有利于硝酸盐异化还原为铵,而不是反硝化
  • DOI:
    10.1111/sed.12886
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    Freshwater Biology
  • 影响因子:
    2.7
  • 作者:
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  • 通讯作者:
    程花
太湖有机聚集体上附着细菌群落结构与动态的T-RFLP分析
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    生态科学
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    高光;汤祥明;秦伯强
  • 通讯作者:
    秦伯强
3种人工载体净化富营养化水体能力的比较
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    湖泊科学
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    戴江玉;高光;汤祥明;陈丹
  • 通讯作者:
    陈丹
湖泊富营养化及其生态系统响应
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
    科学通报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    宋玉芝;汤祥明;许海;邓建明
  • 通讯作者:
    邓建明
博斯腾湖水质现状(2010-2011年)及近50年来演变趋势
  • DOI:
    10.18307/2011.0603
  • 发表时间:
    2024-09-14
  • 期刊:
    Journal of Lake Sciences
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    谢贵娟;张建平;汤祥明;蔡永萍;高光
  • 通讯作者:
    高光

其他文献

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汤祥明的其他基金

湖泊有氧水层产甲烷微生物分布格局、代谢途径及调控机制
  • 批准号:
    42371065
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  • 项目类别:
    面上项目
湖泊有机聚集体附着微生物群落特征及构建机制
  • 批准号:
  • 批准年份:
    2019
  • 资助金额:
    62 万元
  • 项目类别:
    面上项目
富营养化湖泊中附着细菌与浮游细菌生态位转换研究
  • 批准号:
    31100342
  • 批准年份:
    2011
  • 资助金额:
    19.0 万元
  • 项目类别:
    青年科学基金项目

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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