Ryanodine受体钙离子释放通道RyR1的晶体结构研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31070650
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    34.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0501.结构生物学
  • 结题年份:
    2013
  • 批准年份:
    2010
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2011-01-01 至2013-12-31

项目摘要

Ryanodine受体(RyR)是由四个亚基组成的钙离子释放通道,分子量最大的膜蛋白,呈四重对称结构,在肌肉兴奋-收缩耦联等过程中起重要作用,突变将引起恶性高烧等多种离子通道病。冷冻电镜研究得到了大量结构信息,包括胞浆复合体1-10结构域,差异区的定位等,并得到RyR1 9.6 ? 分辨率的空间结构;去年国外研究组重组表达了RyR1, RyR2氨基端约200个氨基酸, 解析了N端的晶体结构,确认了RyR1上恶性高烧等通道病的突变"热点"环,揭示出RyR2点突变引起蛋白质表面的显著变化。但是,RyR跨膜区和孔道仍有许多待解之谜,N端晶体结构反映的未必是其在整个RyR分子上的真实折叠情况,整个RyR分子的晶体结构亟待解析。申请者成功培养了RyR1三维晶体,本项目将优化结晶条件,用9.6 ?分辨率的冷冻电镜结构作初始模型求解相位,测定晶体结构,阐明其结构与功能的关系和钙离子通道病的分子机制。

结项摘要

Ryanodine受体(RyR)是由四个亚基组成的钙离子释放通道,分子量最大的膜蛋白,2300 kDa,分为骨骼肌型RyR1、心肌型RyR2和脑型RyR3。RyR1在肌肉兴奋-收缩耦联等过程中起重要作用,突变将引起恶性高烧等多种离子通道病。冷冻电镜研究得到RyR1 9.6 A 分辨率的空间结构;国外研究组重组表达并解析了RyR1和RyR2的局部结构域(大约200个氨基酸)的晶体结构,但反映的未必是其在长达5000多个氨基酸的整个RyR分子上的真实折叠情况。整体RyR分子的晶体结构亟待解析。. 膜蛋白的纯化本身就很难,膜蛋白的结晶更困难,膜蛋白晶体对X-射线衍射也很弱,晶体冷冻保护剂的选择特别重要。本项目主要进展和所取得的成果如下:(1)通过反复优化RyR1纯化方案,纯化出足量均一的RyR1,负染电镜显示RyR1形态完整,适于培养晶体;(2)经过多次晶体培养实验,培养出RyR1与离子通道抑制剂钌红的共结晶晶体,晶体呈粉红色,块状,与RyR1分子本身形状(方形)相契合;(3)多次到上海光源BL17U 线站进行X射线衍射实验,通过挑选合适的晶体冷冻保护剂,RyR1晶体得到了X-射线衍射,分辨率为15 Å;(4)应用蛋白质组学进行了分析肌浆网膜SR重膜和轻膜,发现SR与T管、线粒体均有连接;蛋白质组学分析纯化的线粒体相关膜(MAM),发现线粒体与SR、T管也有连接。表明骨骼肌的兴奋-收缩耦联与线粒体的兴奋-代谢耦联存在物理和功能上的关联。为RyR1的结构和功能研究打下了良好的基础。. 总之,RYR是已知的分子量最大的膜蛋白,本项目在纯化RyR1、RyR1结晶和RyR1晶体X-射线衍射方面,都获得一定突破。目前,RyR1晶体衍射到15 Å, 尚不能解析出晶体结构,进一步的优化工作正在进行中。

项目成果

期刊论文数量(2)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
银胶菊丙二烯氧化物合成酶的表达纯化及其活性分析
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2012
  • 期刊:
    生物技术通报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    刘云华;周秋虎;张灵芝;常振战
  • 通讯作者:
    常振战
Shotgun proteomic analysis of sarcoplasmic reticulum preparations from rabbit skeletal muscle
兔骨骼肌肌浆网制剂的鸟枪法蛋白质组学分析
  • DOI:
    10.1002/pmic.201200138
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
    Proteomics
  • 影响因子:
    3.4
  • 作者:
    刘周英;杜香宁;尹长城;常振战
  • 通讯作者:
    常振战

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青蒿素生物合成关键酶CYP71AV1的表达纯化和晶体培养
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  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    中国中药杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    史超;邓洁;常振战
  • 通讯作者:
    常振战

其他文献

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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