新型表达模式下的功能基因分析算法研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号：
    60873184
  • 项目类别：
    面上项目
  • 资助金额：
    28.0万
  • 负责人：
    骆嘉伟
  • 依托单位：
    湖南大学
  • 学科分类：
    F0214.新型计算及其应用基础
  • 结题年份：
    2011
  • 批准年份：
    2008
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2009-01-01 至2011-12-31

项目摘要

生物信息学已列为未来10年我国最有可能的科学突破与技术突破的十大领域之一，功能基因分析是目前生物信息学研究的热点和重点，传统的功能基因分析研究都基于DNA、RNA的字母表示方式，随着可视化技术的发展，基因序列的字母形式不能满足人们的多种需要。本项目根据核苷酸的物理和化学性质分类给出DNA和RNA序列的非退化的3D、4D表示，将序列抽象为数值特征，利用数值特征进行序列分析，特别是病毒序列分析（如SARS病毒和禽流感病毒）；基于新型的非退化3D、4D表示，设计并实现多序列比对的最优算法和基因识别算法；将数据挖掘技术应用于RNA二级结构的分类，得到四种假结结构类的数值特征和不同结构类的关联特性，给出RNA的二级结构预测算法；将突变数值化，寻求高突变区的数值特征以及它与系统发育的关系，寻求补偿性替换、准补偿性替换的数值特征进而推断进化保守性机理，完成对病毒基因分析研究。

结项摘要

项目成果

期刊论文数量（20）
专著数量（0）
科研奖励数量（1）
会议论文数量（5）
专利数量（0）
A Novel Graphical Representation of Protein Sequences and Its Application
蛋白质序列的一种新的图形表示及其应用
  • DOI：
    10.1002/jcc.21833
  • 发表时间：
    2011-09-01
  • 期刊：
    JOURNAL OF COMPUTATIONAL CHEMISTRY
  • 影响因子：
    3
  • 作者：
    Liao, Bo;Liao, Benyou;Cao, Zhi
  • 通讯作者：
    Cao, Zhi
基于信息离散度的DNA序列相似性分析
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    计算机应用
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    骆嘉伟;LUO Jia-wei;刘芳;YANG Hua;LIU Fang;杨华
  • 通讯作者：
    杨华
一种新的关联特征和模糊聚类的进化树构建方法
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    计算机应用研究
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    殷志强;骆嘉伟;刘淑燕
  • 通讯作者：
    刘淑燕
基于增强显现模式的癌症分类算法
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    计算机工程
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    LI Dan;王海军;WANG Hai-jun;李丹;LU Xin-guo;卢新国
  • 通讯作者：
    卢新国
一种新的RNA二级结构特征序列表示及相似性分析
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    计算机应用研究
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    李仁发;骆嘉伟;LUO Jia-wei;梁成;LIANG Cheng;LI Ren-fa
  • 通讯作者：
    LI Ren-fa

数据更新时间：{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI：
    {{ item.doi || "--"}}
  • 发表时间：
    {{ item.publish_year || "--" }}
  • 期刊：
    {{ item.journal_name }}
  • 影响因子：
    {{ item.factor || "--"}}
  • 作者：
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者：
    {{ item.author }}

数据更新时间：{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者：
    {{ item.authors }}

数据更新时间：{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者：
    {{ item.authors }}

数据更新时间：{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者：
    {{ item.authors }}

数据更新时间：{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者：
    {{ item.authors }}

数据更新时间：{{ patent.updateTime }}

其他文献

医学图像计算机辅助诊断数据平台研究
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2013
  • 期刊：
    中国生物医学工程学报
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    王伟胜;骆嘉伟;林红利
  • 通讯作者：
    林红利
蛋白质相互作用网络演化模型研究进展
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2013
  • 期刊：
    计算机应用
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    骆嘉伟;梁成;宋丹;李光辉
  • 通讯作者：
    李光辉

其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI：
    {{ item.doi || "--" }}
  • 发表时间：
    {{ item.publish_year || "--"}}
  • 期刊：
    {{ item.journal_name }}
  • 影响因子：
    {{ item.factor || "--" }}
  • 作者：
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者：
    {{ item.author }}
empty
内容获取失败，请点击重试
重试联系客服
title开始分析
查看分析示例
此项目为已结题，我已根据课题信息分析并撰写以下内容，帮您拓宽课题思路：

AI项目思路

AI技术路线图

骆嘉伟的其他基金

面向单细胞和空间组学数据的细胞异质性分析和药物反应预测方法研究
  • 批准号：
    62372165
  • 批准年份：
    2023
  • 资助金额：
    50 万元
  • 项目类别：
    面上项目
MicroRNA对基因的调控作用及其与疾病关联关系的计算方法研究
  • 批准号：
    61873089
  • 批准年份：
    2018
  • 资助金额：
    66.0 万元
  • 项目类别：
    面上项目
基于新一代测序数据的复杂疾病特异共调控网络构建及分析方法研究
  • 批准号：
    61572180
  • 批准年份：
    2015
  • 资助金额：
    67.0 万元
  • 项目类别：
    面上项目
蛋白质网络动态演化模型及应用算法研究
  • 批准号：
    61240046
  • 批准年份：
    2012
  • 资助金额：
    18.0 万元
  • 项目类别：
    专项基金项目

相似国自然基金

{{ item.name }}
  • 批准号：
    {{ item.ratify_no }}
  • 批准年份：
    {{ item.approval_year }}
  • 资助金额：
    {{ item.support_num }}
  • 项目类别：
    {{ item.project_type }}

相似海外基金

{{ item.name }}
{{ item.translate_name }}
  • 批准号：
    {{ item.ratify_no }}
  • 财政年份：
    {{ item.approval_year }}
  • 资助金额：
    {{ item.support_num }}
  • 项目类别：
    {{ item.project_type }}
{{ showInfoDetail.title }}

作者：{{ showInfoDetail.author }}

知道了

AI项目解读示例

课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
关闭
close
客服二维码