全基因组双变量meta分析鉴定肥胖症和骨质疏松症多效易感基因的方法与应用研究
项目介绍
AI项目解读
基本信息
- 批准号:31501026
- 项目类别:青年科学基金项目
- 资助金额:20.0万
- 负责人:
- 依托单位:
- 学科分类:C0607.基因组学
- 结题年份:2018
- 批准年份:2015
- 项目状态:已结题
- 起止时间:2016-01-01 至2018-12-31
- 项目参与者:张欢; 莫兴波; 陆鑫; 朱晓炜; 夏伟; 邱映华; 陈科锦;
- 关键词:
项目摘要
There exist pleiotropic genes joints regulating the development of obesity (OB) and osteoporosis (OP), but the current theoretical and empirical research progress on their identifications is very limited. Aiming to identify pleiotropic genes for OB and OP, the present project proposes to conduct both statistical methodology development and epidemiological experiment for bivariate genome-wide association meta-study. Research works include: 1) develop a powerful and robust bivariate meta-analysis method to detect pleiotropic genes for complex diseases; 2) apply the proposed method to the existing genome-wide association datasets of over 9000 sample size to detect pleiotropic genes for OB and OP, and replicate significant SNPs by genotyping in an independent sample of 2000 unrelated subjects; 3) program and publish the relevant computer software. The conduction of the present project will not only partially resolve the problem of pleiotropic gene detection theoretically, providing powerful and robust statistical method and friendly software for the identification of complex diseases pleiotropic genes, but also identify pleiotropic genes for OB and OP, providing genetic basis for their common molecular mechanism and clinical prevention..
存在同时调控肥胖症(OB)和骨质疏松症(OP)的多效易感基因,但现有鉴定多效基因的理论方法和实验研究仍非常有限。本项目以鉴定OB和OP的多效易感基因为目的,拟开展全基因组双变量关联meta分析的统计方法和实验研究。研究内容包括:1)创建一个高效稳健的双变量meta分析方法检验多效基因的遗传关联;2)应用新方法在现有样本量>9000的全基因组关联数据中鉴定OB和OP的多效易感基因,并在2000人的验证样本开展基因分型实验重复验证显著关联;3)编制并发布本方法对应的计算机软件。本项目的顺利实施不仅在理论上部分解决了多效基因检验的统计难题,为鉴定复杂疾病的多效基因提供高效稳健的统计方法和方便易用的计算机软件,而且在实验上鉴定了OB和OP的多效基因,为两者共同的分子机理和临床防治提供遗传基础。
结项摘要
肥胖症和骨质疏松症在遗传上高度相关,但目前鉴定两者多效易感基因的研究相对匮乏。为鉴定肥胖症和骨质疏松症的多效易感基因,本项目开展了一系列理论方法和实验研究,取得一定研究成果。理论成果包括:①创建了一个高效稳健的双变量meta回归方法开展全基因组关联meta分析,该方法可有效检测复杂疾病多效易感基因。②探讨了全基因组关联meta分析中异质性的程度和主要来源,为 meta分析中协变量校正和结果的理解提供了理论指导。基于上述理论方法我们在大规模样本中开展了肥胖症和骨质疏松症的全基因组基因定位研究,实验成果包括:①采用双变量全基因组关联meta分析鉴定了多个影响肥胖症和骨质疏松症的多效易感位点,包括2p23.2(rs61620093,p=1.93X10-8)、10p14(rs2892347,p=3.01X10-9)和18p11.21(rs78202598,p=3.09X10-9);②发现了1个新的肥胖症易感区域2p11和5个新的骨质疏松症易感区域1q43、2q32.2、3q13.32、20p12.1和20q13.33。本项目的研究结果不仅可为鉴定复杂疾病多效基因提供高效稳健的统计方法,而且在实验上鉴定的肥胖症和骨质疏松症的多效基因,可为两者共同的分子机理和临床防治提供遗传基础。
项目成果
期刊论文数量(6)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Exploring the Major Sources and Extent of Heterogeneity in a Genome-Wide Association Meta-Analysis.
在全基因组关联荟萃分析中探索异质性的主要来源和程度
- DOI:10.1111/ahg.12143
- 发表时间:2016-03
- 期刊:Annals of human genetics
- 影响因子:1.9
- 作者:Pei YF;Tian Q;Zhang L;Deng HW
- 通讯作者:Deng HW
Association of 3q13.32 variants with hip trochanter and intertrochanter bone mineral density identified by a genome-wide association study.
全基因组关联研究确定 3q13.32 变异与髋转子和转子间骨矿物质密度的关联
- DOI:10.1007/s00198-016-3663-y
- 发表时间:2016
- 期刊:Osteoporosis International
- 影响因子:4
- 作者:Pei Yu-Fang;Xie Zong-Gang;Wang Xiu-Yan;Hu Wen-Zhu;Li Liu-Bing;Ran Shu;Lin Yong;Hai Rong;Shen Hui;Tian Qing;Zhang Yong-Hong;Lei Shu-Feng;Papasian C J;Deng Hong-Wen;Zhang Lei
- 通讯作者:Zhang Lei
A new method for estimating effect size distribution and heritability from genome-wide association summary results
一种根据全基因组关联总结结果估计效应大小分布和遗传力的新方法。
- DOI:10.1007/s00439-015-1621-y
- 发表时间:2016-02
- 期刊:Human Genetics
- 影响因子:5.3
- 作者:Zhang Lei;Shen Yue-Ping;Hu Wen-Zhu;Ran Shu;Lin Yong;Lei Shu-Feng;Zhang Yong-Hong;Papasian Christopher J.;Yi Nengjun;Pei Yu-Fang
- 通讯作者:Pei Yu-Fang
Genomic variants at 20p11 associated with body fat mass in the European population.
20p11 的基因组变异与欧洲人群的体脂量相关
- DOI:10.1002/oby.21775
- 发表时间:2017-04
- 期刊:Obesity (Silver Spring, Md.)
- 影响因子:--
- 作者:Pei YF;Ren HG;Liu L;Li X;Fang C;Huang Y;Hu WZ;Kong WW;Feng AP;You XY;Zhao W;Shen H;Tian Q;Zhang YH;Deng HW;Zhang L
- 通讯作者:Zhang L
Genome-wide association meta-analyses identified 1q43 and 2q32.2 for hip Ward's triangle areal bone mineral density.
全基因组关联荟萃分析确定 1q43 和 2q32.2 代表髋部 Ward 三角面积骨矿物质密度
- DOI:10.1016/j.bone.2016.07.004
- 发表时间:2016-10
- 期刊:Bone
- 影响因子:4.1
- 作者:Pei YF;Hu WZ;Hai R;Wang XY;Ran S;Lin Y;Shen H;Tian Q;GEFOS-seq Consortium;AOGC Consortium;UK10K Consortium;Lei SF;Zhang YH;Papasian CJ;Deng HW;Zhang L
- 通讯作者:Zhang L
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- 发表时间:2012
- 期刊:中国科学:生命科学
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- 作者:张垒;裴育芳;赵兰娟;冉姝;韩颖颖;朱学珍;沈汇;田青;邓红文
- 通讯作者:邓红文
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