靶向冠状病毒关键功能蛋白的抑制剂设计及其抑制效应和机制研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    81672008
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    57.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H2101.呼吸道病毒与感染
  • 结题年份:
    2020
  • 批准年份:
    2016
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2017-01-01 至2020-12-31

项目摘要

RNA viruses which replicate and transcribe in cytoplasm, such as coronaviruses, infect human, bird, livestock, and closely contact with human society, cause a great threat and economic loss. We found that nonstructural protein nsp14 and nsp16 / Nsp10 complex of SARS coronavirus (SARS-CoV) possess N7- and 2'- O- methyl transferase activity, which involved in viral RNA 5' end capping process. These viral RNA capping enzymes are important to viral RNA stability, viral protein translation, viral immune escape and many other aspects. This study will focuse on the coronaviridae virus critical enzymes as potential drug targets. Based on our previous work, we are planning to screen small molecular compounds which inhibit the activities of coronavirus RNA capping enzymes, through bioinformatics prediction and yeast genetic screenning system in vivo. And biochemical assays in vitro will be use to illuminate the mechanisms of these inhibitors, further revealing viral RNA cap mechanism. Finally, cell and animal models will be use to validate the inhibition efficiency. These studies will promote the development of antiviral drugs, which could also be used for inhibit other cytoplasmic replication viruses.
以SARS冠状病毒和人冠状病毒为代表的,细胞质内复制的冠状病毒主要感染人、禽、畜,与人类社会密切接触,造成巨大威胁和经济损失。我们研究发现SARS冠状病毒非结构蛋白nsp14和nsp16/nsp10复合体分别具有N7-和2'-O-甲基转移酶活性,参与病毒RNA的5'端加帽过程,是病毒RNA帽子合成的必须蛋白之一,影响病毒RNA的稳定,病毒蛋白翻译,参与病毒免疫逃逸等方面,是理想的抗病毒药物靶点。本研究将在前期的研究工作基础上,继续通过生物信息学预测,设计并大量筛选抑制冠状病毒RNA加帽酶功能的各种小分子化合物。结合体外生化活性实验,深入研究抑制剂的工作机理,并在细胞及动物模型上验证其抑制效应。这些研究将有利于我们高开发特异抗病毒药物,且具有较高的推广及应用潜力,也可用于其他细胞质内复制的RNA病毒的药物开发,对病毒病的防治提供依据。

结项摘要

以新型冠状病毒、SARS冠状病毒和人冠状病毒为代表的,细胞质内复制的冠状病毒主要感染人、禽、畜,与人类社会密切接触,造成巨大威胁和经济损失。本项目在前期研究工作的基础上,针对冠状病毒感染复制的特点,聚焦冠状病毒药物靶点的鉴定及抗冠状病毒药物研发,优化了特异性的抑制剂,能够在动物水平有效抑制冠状病毒的复制;揭示了冠状病毒感染与宿主抗病毒天然免疫调控的新机制;在新冠抗疫科研攻关中,合作完成了病原鉴定,并于2020年1月7日完成全基因组测序并依规上报;鉴定了气溶胶新型冠状病毒载量及传播特性;发展了基于数字PCR的高灵敏度的核酸检测方法,建立了临床辅助诊断实验室;发表了新冠患者BALF和PBMC转录组数据,揭示了免疫及炎症反应特点;转化了1种抗新冠病毒药物。这些成果一共发表SCI论文8篇,申请/授权发明专利2项。这些研究成果为抗疫工作提供科学支持和理论依据。

项目成果

期刊论文数量(7)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(2)
ddPCR: a more accurate tool for SARS-CoV-2 detection in low viral load specimens
ddPCR:一种在低病毒载量样本中检测 SARS-CoV-2 的更准确工具。
  • DOI:
    10.1080/22221751.2020.1772678
  • 发表时间:
    2020-01-01
  • 期刊:
    EMERGING MICROBES & INFECTIONS
  • 影响因子:
    13.2
  • 作者:
    Suo, Tao;Liu, Xinjin;Chen, Yu
  • 通讯作者:
    Chen, Yu
P200 family protein IFI204 negatively regulates type I interferon responses by targeting IRF7 in nucleus
P200家族蛋白IFI204通过靶向细胞核中的IRF7负向调节I型干扰素反应
  • DOI:
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  • 发表时间:
    2019-10-01
  • 期刊:
    PLOS PATHOGENS
  • 影响因子:
    6.7
  • 作者:
    Cao, Liu;Ji, Yanxi;Guo, Deyin
  • 通讯作者:
    Guo, Deyin
Transcriptomic characteristics of bronchoalveolar lavage fluid and peripheral blood mononuclear cells in COVID-19 patients
COVID-19患者支气管肺泡灌洗液和外周血单个核细胞的转录组特征
  • DOI:
    10.1080/22221751.2020.1747363
  • 发表时间:
    2020-01-01
  • 期刊:
    EMERGING MICROBES & INFECTIONS
  • 影响因子:
    13.2
  • 作者:
    Xiong, Yong;Liu, Yuan;Chen, Yu
  • 通讯作者:
    Chen, Yu
Electron microscopy studies of the coronavirus ribonucleoprotein complex.
冠状病毒核糖核蛋白复合物的电子显微镜研究
  • DOI:
    10.1007/s13238-016-0352-8
  • 发表时间:
    2017-03
  • 期刊:
    Protein & cell
  • 影响因子:
    21.1
  • 作者:
    Gui M;Liu X;Guo D;Zhang Z;Yin CC;Chen Y;Xiang Y
  • 通讯作者:
    Xiang Y
Analytical comparisons of SARS-COV-2 detection by qRT-PCR and ddPCR with multiple primer/probe sets
qRT-PCR 和 ddPCR 使用多个引物/探针组检测 SARS-COV-2 的分析比较
  • DOI:
    10.1080/22221751.2020.1772679
  • 发表时间:
    2020-01-01
  • 期刊:
    EMERGING MICROBES & INFECTIONS
  • 影响因子:
    13.2
  • 作者:
    Liu, Xinjin;Feng, Jiangpeng;Lan, Ke
  • 通讯作者:
    Lan, Ke

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其他文献

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    2020
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    --
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  • 通讯作者:
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  • 通讯作者:
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  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    l林胜楠;陈宇;罗晓东;李毅
  • 通讯作者:
    李毅

其他文献

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AI项目解读示例

课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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