模式生物基因组中非编码序列的信息学特征分析和功能位点研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号：
    30560039
  • 项目类别：
    地区科学基金项目
  • 资助金额：
    21.0万
  • 负责人：
    李前忠
  • 依托单位：
    内蒙古大学
  • 学科分类：
    C0504.物理生物学
  • 结题年份：
    2008
  • 批准年份：
    2005
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2006-01-01 至2008-12-31

项目摘要

利用目前国际上已公布的各种基因组非编码序列的数据库，建立和完善包括启动子（Promoter）, 转录起始位点（TSS）, Alternative Splice Junction Sites，假基因（Pseudogenes）, 5'UTR和3'UTR等功能位点相关的各种模式生物基因组非编码序列的子库。分析它们的信息学特征，探索与不同功能位点相关的序列特征和保守片段及它们的相互联系。计算各种功能位点区

结项摘要

项目成果

期刊论文数量（47）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（2）
专利数量（0）
基于PCWM扫描模型的植物启动子分析及识别
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    内蒙古大学学报(自然科学版)
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    李前忠;杨磊;杨乌日吐;左永春
  • 通讯作者：
    左永春
Prediction of apoptosis protein subcellular location using improved hybrid approach and pseudo-amino acid composition
使用改进的混合方法和假氨基酸组成预测凋亡蛋白亚细胞位置
  • DOI：
    10.1016/j.jtbi.2007.05.019
  • 发表时间：
    2007-09-21
  • 期刊：
    JOURNAL OF THEORETICAL BIOLOGY
  • 影响因子：
    2
  • 作者：
    Chen, Ying-Li;Li, Qian-Zhong
  • 通讯作者：
    Li, Qian-Zhong
用支持向量机识别β-发夹模体
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    生物物理学报
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    李前忠;胡秀珍
  • 通讯作者：
    胡秀珍
用核糖体扫描模型预测翻译起始位点
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    内蒙古大学学报(自然科学版)
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    刘利;李前忠
  • 通讯作者：
    李前忠
Using pseudo amino acid composition to predict protein structural class: Approached by incorporating 400 dipeptide components
使用伪氨基酸组成预测蛋白质结构类别：通过合并 400 个二肽成分来实现
  • DOI：
    10.1002/jcc.20554
  • 发表时间：
    2007-07-15
  • 期刊：
    JOURNAL OF COMPUTATIONAL CHEMISTRY
  • 影响因子：
    3
  • 作者：
    Lin, Hao;Li, Qian-Zhong
  • 通讯作者：
    Li, Qian-Zhong

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其他文献

乳腺癌中hsa-miR-17-92基因簇及其旁系同源体的共调控作用
  • DOI：
    10.13484/j.nmgdxxbzk.20160409
  • 发表时间：
    2016
  • 期刊：
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  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    武成艳;李前忠;靳文;曹艳妮
  • 通讯作者：
    曹艳妮
人类乳腺癌异常甲基化基因分析
  • DOI：
    10.13484/j.nmgdxxbzk.20160411
  • 发表时间：
    2016
  • 期刊：
    内蒙古大学学报(自然科学版)
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    靳文;李前忠;苏文霞;武成艳
  • 通讯作者：
    武成艳
N~+注入对蒙古黄芪多倍体生化指标的影响
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2011
  • 期刊：
    生物物理学报
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    张利珍;李前忠;杨林源;武成艳
  • 通讯作者：
    武成艳
第一类鱼抗冻蛋白对冰晶生长界面层结构的影响
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2011
  • 期刊：
    生物物理学报
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    谢文静;刘俊杰;李前忠
  • 通讯作者：
    李前忠
使用蛋白质和mRNA序列信息预测蛋白质亚线粒体定位
  • DOI：
    10.13484/j.nmgdxxbzk.20170111
  • 发表时间：
    2017
  • 期刊：
    内蒙古大学学报(自然科学版)
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    刘娟娟;李前忠;闫振河;薛济先
  • 通讯作者：
    薛济先

其他文献

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李前忠的其他基金

不同表观遗传修饰对癌基因、抑癌基因异常表达的协同调控作用
  • 批准号：
    32160216
  • 批准年份：
    2021
  • 资助金额：
    36 万元
  • 项目类别：
    地区科学基金项目
几种癌症相关的基因表达水平与表观遗传修饰关系研究
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  • 批准年份：
    2001
  • 资助金额：
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    39660023
  • 批准年份：
    1996
  • 资助金额：
    8.0 万元
  • 项目类别：
    地区科学基金项目

相似国自然基金

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  • 批准号：
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相似海外基金

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  • 财政年份：
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AI项目解读示例

课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
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