ANKRD18B基因在肺癌发生过程中的调控及功能的初步研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    81071695
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    35.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H1804.肿瘤遗传与进化
  • 结题年份:
    2013
  • 批准年份:
    2010
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2011-01-01 至2013-12-31
  • 项目参与者:
    周燕虹; 刘文斌; 韩飞; 姜晓; 周妮娅; 韩雪; 李代波;
  • 关键词:

项目摘要

我们前期通过全基因组甲基化分析,筛选出一个在肺癌发生过程中的高甲基化片段,通过生物信息学分析,该片段位于ANKRD18B基因外显子1和2。进一步分析揭示该基因在肺癌及一些不同组织来源的肿瘤细胞中均发生高甲基化。通过DNA甲基化酶抑制剂去甲基化实验证实ANKRD18B高甲基化与其mRNA表达下调相关,表明该基因在肺癌发生中具有重要作用。经文献检索,未见关于该基因的调控和功能研究的报道。为此,本项目拟进一步分析该基因在肺癌发生发展过程中的甲基化动态变化,结合DNA突变、杂合性缺失分析,初步确定其在肿瘤发生过程中DNA水平的调控模式。同时,从细胞生长/凋亡、细胞周期、细胞迁移、恶性转化等方面入手,分析该基因的主要功能,为进一步全面研究该基因在蛋白质相互作用、生长发育、疾病发生等方面的作用奠定基础。

结项摘要

本项目在前期发现ANKRD18B是肺癌发生中一个新的甲基化基因的基础上,利用MSP、PCR分析等分子生物学实验方法,对该基因在肺癌发生发展过程中的甲基化变化,基因功能等进行了分析。结果发现53.1%(52/98)肿瘤组织中该基因高甲基化,而10例正常组织中均未检测到高甲基化。进一步对病理资料完整的62例肿瘤组织ANKRD18B基因甲基化与临床病理关系进行分析发现,肿瘤细胞分化程度越低,该基因甲基化发生率越高(p=0.09)。在来源于肺癌病人的痰液标本和血浆标本中,36.9% (24/65)血浆标本和38.8% (33/85)的痰标本中能够检测出该基因的高甲基化。在62例配对肿瘤组织、血浆和痰标本中,33例ANKRD18B基因甲基化肿瘤组织病人中,72.7%(24/32)的病人血浆 和69.7%(23/32)病人痰标本中能够检测出该基因的高甲基化,表明该基因高甲基化可以作为肺癌病人诊断的候选标志物。利用RACE(rapid amplification of cDNA ends)技术结合DNA测序,获得其cDNA全长并上传Genbank(accession number KC955137)。在此基础上,进一步分析发现ANKRD18B基因甲基化明显抑制其表达,而且在肺癌发生过程中该基因主要通过DNA甲基化调控而失活。通过构建ANKRD18B高表达细胞模型,发现该基因能明显抑制肿瘤细胞生长,其机制主要是通过诱导细胞凋亡,相关的研究表明该基因是一个潜在的抑癌基因。

项目成果

期刊论文数量(2)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Epigenetic Regulation of ANKRD18B in Lung Cancer
ANKRD18B 在肺癌中的表观遗传调控
  • DOI:
    10.1002/mc.22101
  • 发表时间:
    2015-04-01
  • 期刊:
    MOLECULAR CARCINOGENESIS
  • 影响因子:
    4.6
  • 作者:
    Liu, Wen-Bin;Han, Fei;Liu, Jin-Yi
  • 通讯作者:
    Liu, Jin-Yi
ANKRD18A as a novel epigenetic regulation gene in lung cancer
ANKRD18A作为肺癌的新型表观遗传调控基因
  • DOI:
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  • 发表时间:
    2012-12-14
  • 期刊:
    BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS
  • 影响因子:
    3.1
  • 作者:
    Liu, Wen-bin;Han, Fei;Liu, Jin-yi
  • 通讯作者:
    Liu, Jin-yi

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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