基于GWAS发现的遗传变异及其与环境因素的交互作用与冠心病发生

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    81172751
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    14.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H3010.非传染病流行病学
  • 结题年份:
    2012
  • 批准年份:
    2011
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2012-01-01 至2012-12-31

项目摘要

冠心病是一种遗传和环境共同作用导致的多因素复杂性疾病。最近全基因组关联研究发现很多与冠心病有关的基因多态性位点,但是这些研究大多数在高加索人群中进行,而且中国人群与高加索人群有着不同的遗传背景和基因连锁关系,找到中国人群特有的与冠心病有关的基因多态性位点、探讨其与环境因素交互作用在冠心病发生中的作用及这些基因多态性位点的功能和参与冠心病的具体生物学机制成为目前的研究方向。本项目采用两阶段病例-对照关联研究策略对目前冠心病全基因组关联研究发现的多态性位点进行分型检测,对有统计学意义位点所在区段或基因通过再测序找到与冠心病有关的多态性位点并进行基因功能研究;同时采用流行病学调查收集详尽的环境因素资料,探讨基因-基因和基因-环境交互作用在冠心病中的作用。本研究有助于阐明冠心病的遗传因素及其参与冠心病可能的分子机制,对冠心病患者早期筛检和个体化干预与治疗具有重要现实和应用意义。

结项摘要

冠心病是一种遗传和环境共同作用导致的多因素复杂性疾病。最近全基因组关联研究发现很多与冠心病有关的基因多态性位点,但是这些研究大多数在高加索人群中进行,而且中国人群与高加索人群有着不同的遗传背景和基因连锁关系,找到中国人群特有的与冠心病有关的基因多态性位点、探讨其与环境因素交互作用在冠心病发生中的作用及这些基因多态性位点的功能和参与冠心病的具体生物学机制成为目前的研究方向。本项目采用病例-对照关联研究策略对目前冠心病全基因组关联研究发现的多态性位点进行分型检测,同时采用流行病学调查收集详尽的环境因素资料,探讨基因-环境交互作用在冠心病中的作用,为进一步探讨基因多态性位点的功能及其具体参与冠心病的生物学机制提供科学线索和依据。本研究选用20个目前全基因组关联研究发现的与冠心病有关的多态性位点进行分析,同时通过计算基因危险评分(genetic risk score,GRS)分析在中国人群中冠心病的遗传易感基因位点在冠心病发生中的累积效应并同时探讨基因-基因、基因-环境交互作用。本研究结果发现:CELSR2-PSRC1-SORT1,TTC32/WDR35,PHACTR1,CDKN2A/B,CYP17A1/NT5C2,ATP2B1,SH2B3,ADAMTS7,RASD1-PEMT和NCAN-CILP2 十个位点在中国人群中与冠心病危险性显著相关(P< 0.05)。其中TTC32/WDR35和ATP2B1两个位点为2012年在中国人群中发现的与CHD相关的新位点。另外,我们对这10个有统计学意义的的位点通过计算GRS分析基因累积效应。结果显示在调整了其他混杂因素如年龄、性别、吸烟、饮酒、体重指数(BMI)、CHD家族史、个人高血压史和个人糖尿病史等后,GRS与CHD的危险增加有显著性的关联,GRS每上升一个分数,患CHD的危险度为1.24倍(P=6.23E-18),其中GRS ≥14的个体与GRS≤11的个体相比,患冠心病的危险增加了1.5倍以上。经过加权计算GRS进与CHD的关联研究得到了同样的结果。未发现上述有显著性意义的位点有基因-基因、基因-环境交互作用。. 本项目按照计划书内容进行科学研究,基本完成本项目研究的具体内容,并得到了有意义的科学研究结果,为以后进一步探讨基因多态性位点的功能及其具体参与冠心病的生物学机制提供科学线索和依据。

项目成果

期刊论文数量(2)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
A genome wide association study of genetic loci that influence tumour biomarkers cancer antigen 19-9, carcinoembryonic antigen and &alpha; fetoprotein and their associations with cancer risk
影响肿瘤生物标志物癌抗原 19-9、癌胚抗原和
  • DOI:
    10.1136/gutjnl-2012-303434
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    Gut
  • 影响因子:
    24.5
  • 作者:
    何美安
  • 通讯作者:
    何美安
A Genome-Wide Association Study for Serum Bilirubin Levels and Gene-Environment Interaction in a Chinese Population
中国人群血清胆红素水平和基因-环境相互作用的全基因组关联研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    Genetic Epidemiology
  • 影响因子:
    2.1
  • 作者:
    何美安
  • 通讯作者:
    何美安

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其他文献

其他文献

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何美安的其他基金

全氟和多氟烷基化合物暴露及相关基因甲基化与2型糖尿病发生的巢式病例对照研究
  • 批准号:
  • 批准年份:
    2022
  • 资助金额:
    52 万元
  • 项目类别:
    面上项目
环境内分泌干扰物多氯联苯与基因交互作用在2型糖尿病发生中的作用及机制
  • 批准号:
    82073656
  • 批准年份:
    2020
  • 资助金额:
    56 万元
  • 项目类别:
    面上项目
基于队列人群研究基因-环境交互作用对2型糖尿病发生风险的预测和预警
  • 批准号:
    81473051
  • 批准年份:
    2014
  • 资助金额:
    80.0 万元
  • 项目类别:
    面上项目
血清铁蛋白、铁代谢关键基因及其交互作用与冠心病发生
  • 批准号:
    30800941
  • 批准年份:
    2008
  • 资助金额:
    20.0 万元
  • 项目类别:
    青年科学基金项目

相似国自然基金

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AI项目解读示例

课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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