小分子探针对肿瘤细胞表面整合素 (Integrin) 胞外蛋白质配体的标记与识别

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    21572014
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    65.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    B0701.生物体系分子探针
  • 结题年份:
    2019
  • 批准年份:
    2015
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2016-01-01 至2019-12-31

项目摘要

Integrin is a family of membrane proteins widely distributed in numerous cell and tissue types. By binding to specific protein ligands in the extracellular matrix or on the membrane of neighboring cells, integrins regulate many key aspects of cell adhesion properties and related signaling transductions. Consequently, integrins play important roles in numerous cellular activities including cell migration, proliferation, angiogenesis, etc. Many tumor cells over-express integrins in order to improve their motility and invasiveness, therefore enhancing tumor’s ability in metastasis and angiogenesis. Indeed, integrins have been intensively pursued as a major class of anti-cancer drug targets. In addition, imaging probes based on integrin-specific ligands are extensively used in cancer diagnostics to detect metastasis and to evaluate efficacy of treatment. However, due to integrin’s nature as a family of membrane proteins, comprehensive profiling and accurate characterization of its extracellular protein ligands has been proved to be extremely challenging. Herein we propose a novel DNA-programmed small-molecule probe strategy, which can enable the direct interrogation of protein-protein interactions on the surface of live cells. We propose to use this strategy to label and identify extracellular ligand proteins for a variety of integrins in cancer cells. We expect the proposed research will provide novel and useful tools for studying integrin’s molecular mechanisms, discovering drug candidates, and developing versatile imaging probes targeting integrin in various forms of cancers.
整合素 (integrin) 是一类通过结合多种蛋白质配体,实现细胞内外信号传导的重要膜蛋白。整合素调控细胞与环境、细胞与细胞之间的相互作用,影响细胞增殖、分化、迁移、形态变化、免疫应答等重要生命活动。整合素在多种恶性肿瘤中高度表达,促进肿瘤血管生成和癌转移,是抗肿瘤药物研发和疾病诊断的一类重要靶标。由于整合素作为膜蛋白的性质,当今尚缺乏对其细胞外所结合的配体蛋白质进行准确、全面、特异性的识别和分析方法。本申请提出一种新颖的基于DNA模板控制的分子探针方法,以实现在活细胞表面对“蛋白质-蛋白质”相互作用的表征,从而能够用于肿瘤细胞整合素胞外配体蛋白的标记与识别。由于整合素与胞外配体的相互作用对其在细胞中的生物功能至关重要,因此本申请的研究内容对探索癌症分子机理、抗肿瘤药物研发、以及疾病诊断成像方面,具有重要的科学和实际意义。

结项摘要

整合素 (integrin) 是一类通过结合多种蛋白质配体,实现细胞内外信号传导的重要膜蛋白。由于整合素作为膜蛋白的性质,当今尚缺乏对其细胞外配体蛋白质进行准确、全面、特异性分析的有效方法。在本项目的执行中,我们拓展了基于DNA模板控制的分子探针方法 (DNA-Programmed Affinity Labeling, DPAL),实现了在活细胞表面对膜蛋白的特异性标记,从而本方法能够用于对膜蛋白的胞外配体蛋白的标记与识别,以及用于细胞内复杂复合体的蛋白质成分解析。在膜蛋白DNA标记的基础之上,本项目进一步实现了对整合素的胞外配体蛋白的识别工作。.本项目研究成果一方面发展了新颖的膜蛋白和蛋白质复合体标记技术,一方面发现了众多新颖的的整合素胞外配体蛋白。例如,在膜蛋白方面,我们发现了多个潜在的新颖整合素配体蛋白,并且发现了integrin-LRC15-MT2A 的蛋白质复合体,有潜力成为一种新颖的细胞传导通路,从而为进一步的细胞分子机理的基础研究,以及相应的靶点识别和药物研发等应用研究,提供了重要的科学基础和技术手段。

项目成果

期刊论文数量(7)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Identification of Annexin A2 as a target protein for plant alkaloid matrine
植物生物碱苦参碱靶蛋白膜联蛋白 A2 的鉴定
  • DOI:
    10.1039/c7cc02227a
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    Chemical Communications
  • 影响因子:
    4.9
  • 作者:
    Wang Dongyao;Cao Yan;Zheng Leyi;Lv Diya;Chen Langdong;Xing Xinrui;Zhu Zhenyu;Li Xiaoyu;Chai Yifeng
  • 通讯作者:
    Chai Yifeng
Detection of protein targets with a single binding epitope using DNA-templated photo-crosslinking and strand displacement
使用 DNA 模板光交联和链置换检测具有单一结合表位的蛋白质靶标
  • DOI:
    10.1016/j.ab.2018.01.010
  • 发表时间:
    2018-03-15
  • 期刊:
    ANALYTICAL BIOCHEMISTRY
  • 影响因子:
    2.9
  • 作者:
    Huang, Yiran;Zheng, Wenlu;Li, Xiaoyu
  • 通讯作者:
    Li, Xiaoyu
Target Identification of Kinase Inhibitor Alisertib (MLN8237) by Using DNA-Programmed Affinity Labeling
使用 DNA 编程亲和标记识别激酶抑制剂 Alisertib (MLN8237) 的靶点
  • DOI:
    10.1002/chem.201702033
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    CHEMISTRY-A EUROPEAN JOURNAL
  • 影响因子:
    4.3
  • 作者:
    Wang Dong-Yao;Cao Yan;Zheng Le-Yi;Chen Lang-Dong;Chen Xiao-Fei;Hong Zhan-Ying;Zhu Zhen-Yu;Li Xiaoyu;Chai Yi-Feng
  • 通讯作者:
    Chai Yi-Feng
Selecting a DNA-Encoded Chemical Library against Non-immobilized Proteins Using a "Ligate-Cross-Link-Purify" Strategy
使用“连接-交联-纯化”策略选择针对非固定化蛋白质的 DNA 编码化学文库
  • DOI:
    10.1021/acs.bioconjchem.7b00343
  • 发表时间:
    2017-09-01
  • 期刊:
    BIOCONJUGATE CHEMISTRY
  • 影响因子:
    4.7
  • 作者:
    Shi, Bingbing;Deng, Yuqing;Li, Xiaoyu
  • 通讯作者:
    Li, Xiaoyu
Future challenges with DNA-encoded chemical libraries in the drug discovery domain
DNA 编码化学库在药物发现领域的未来挑战
  • DOI:
    10.1080/17460441.2019.1614559
  • 发表时间:
    2019-05-22
  • 期刊:
    EXPERT OPINION ON DRUG DISCOVERY
  • 影响因子:
    6.3
  • 作者:
    Zhao, Guixian;Huang, Yiran;Li, Xiaoyu
  • 通讯作者:
    Li, Xiaoyu

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  • 作者:
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  • 通讯作者:
    胡月明

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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