东乡野生稻基因渗入系的构建及其遗传与表观遗传研究

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AI项目解读

基本信息

  • 批准号：
    30900781
  • 项目类别：
    青年科学基金项目
  • 资助金额：
    20.0万
  • 负责人：
    罗向东
  • 依托单位：
    江西师范大学
  • 学科分类：
    C0603.表观遗传调控
  • 结题年份：
    2012
  • 批准年份：
    2009
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2010-01-01 至2012-12-31

项目摘要

野生种基因渗入系是深入研究和利用野生优异基因、QTL精细定位与分析的优良材料。研究野生种基因渗入诱发的遗传与表观遗传变异特点及其分子机制，对阐明该物种的起源和系统演化具有十分重要的意义，对指导作物品种改良也具有重要的理论和实践价值。 .因此，本项目利用全球分布最北的普通野生稻、国家二级保护植物-东乡野生稻，栽培稻，以及我们前期创制的高代回交自交群体为试材，将分子标记辅助选择与荧光原位杂交（FISH）相结合，构建并评价东野基因渗入系。采用SSR、AFLP、和甲基化敏感多态性（MSAP）等技术分析各世代渗入系DNA序列及其甲基化模式变化特征。同时采用RT-PCR、Southern Blot和SSAP技术分析逆转座子与渗入系基因表达的关系，从而探明东野基因渐渗诱发栽培稻遗传与表观遗传的变化特点及其分子机制，进而阐明渗入系优异性状形成的分子机理，为丰富水稻的渐渗杂交理论和进化理论提供有力证据。

结项摘要

本项目利用全球分布最北的普通野生稻、国家二级保护植物—东乡野生稻，栽培稻，以及我们前期创制的高代回交自交群体为试材，利用SSR和AFLP等分子标记标记辅助选择与细胞学相结合，构建并评价了一批携带东乡野生稻优异基因（如耐冷、抗旱和耐低磷）的渗入系。采用SSR、AFLP和甲基化敏感多态性（MSAP）等技术分析了各世代渗入系DNA序列及其甲基化模式变化特征。同时采用RT-PCR和SSAP技术分析逆转座子与渗入系基因表达的关系。结果发现，东乡野生稻一些DNA片段已经渐渗到栽培稻中，基因组覆盖率达90%以上。同时受体基因组在经历外源DNA渐渗的过程中发生了广泛的遗传与表观遗传变化，包括基因组序列的非孟德尔式变化、DNA甲基化、转座子激活等。实时荧光定量PCR检测结果显示, IL5335和IL5243中houba, osr15以及osr17逆转录酶的表达量均远高于受体亲本中的表达量(表达量增加1.50-5.07倍)。这些结果为探明东野基因渐渗诱发栽培稻遗传与表观遗传分子机制，进而阐明渗入系优异性状形成的分子机理以及渐渗杂交理论奠定了重要基础。

项目成果

期刊论文数量（15）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（0）
专利数量（0）
杜鹃花色素的分离与鉴定分析
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    食品科学, Food Science
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    罗向东
  • 通讯作者：
    罗向东
东乡野生稻耐冷渐渗系的细胞学观察及SSR分析
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    西北植物学报
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    曹娟芳;罗向东;邓晓娟;戴亮芳;胡标林;张帆涛;谢建坤
  • 通讯作者：
    谢建坤
东乡野生稻渐渗系基因组结构变化及多样性分析
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    安徽农业科学
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    邓晓娟;罗向东;谢建坤;万勇;胡标林;曹娟芳;戴亮芳
  • 通讯作者：
    戴亮芳
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  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    安徽农业科学
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    罗向东;戴亮芳;陈劲枫;王述彬
  • 通讯作者：
    王述彬
Analysis on Genomic Structure Changes and Diversity of Introgression Lines in Dongxiang Wild Rice (O. rufipogon Griff.)
东乡野生稻基因组结构变化及渗入系多样性分析
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    Agricultural Science & Technology
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    DENG Xiao-Juan;LUO Xiang-Dong;XIE Jian-Kun
  • 通讯作者：
    XIE Jian-Kun

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  • 通讯作者：
    谢建坤
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    --
  • 作者：
    邵佩旭;罗向东;李春佩
  • 通讯作者：
    李春佩

其他文献

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AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
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