基于蓝细菌光敏色素的细胞光遗传学元件的构建

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31270893
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    70.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0503.细胞感应与环境生物物理
  • 结题年份:
    2016
  • 批准年份:
    2012
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2013-01-01 至2016-12-31

项目摘要

Cyanobacteriochromes are linear tetrapyrrole photoreceptors characterized recently in cyanobacteria, homologous to plant phytochromes, and play important roles in the photoregulation of cyanobacterial photosynthesis. Because the variations of cyanobacteria, there are various groups of cyanobacteriochromes absorbing at different wavelengths, cyanobacteriochomes become excellent templates to design cellular optogenetic units. Optogenetics is a new interdisciplinary field, usually studying how to design and fuse one photoswitchable protein with regulator to yield a new optogenetic unit. After transforming the optogenetic unit into a kind of cells, the transformed cells will be endued a designed photoregulated character. We plan to evolve molecularly the red-green photoswitchable protein (RGS) that is newly found from Synechocystis PCC 6803, to design series of highly efficient photoswitchable proteins. After designing and fusing the RGS derivatives with adenylyl cyclase, new types of optogenetic units will be designed that can photoregulate the activity of adenylyl cyclase and become suitable to optogenetics. When the designed optogenetic unit is transformed into certain cells (e.g. microbial cells), which would be endued the new optogenetic character. The studies will yield new kind of optogenetic units designed from cyanobacteriochromes. Because cyanobacteriochromes have various spectra, new optogenetic units of various spectra will be designed, which is very important to the developments of optogenetics and photobiology.
蓝细菌光敏色素是最近确定的存在于蓝细菌中,发挥光合作用光调控作用的四吡咯光受体,与植物光敏色素同源,由于蓝细菌多样性而存在多种蓝细菌光敏色素,从而成为设计细胞光遗传学元件的良好模型。光遗传学是最近发展起来的新兴学科,它主要研究如何将光控开关蛋白与调控因子融合,转入一生物体,从而赋予该生物体新的光响应特征。本项目将从集胞蓝细菌PCC6803光敏色素设计成功的红光-绿光光控开关(RGS)入手,设计出适合于光遗传学的RGS系列高效光控开关,通过分子设计将它与腺苷环化酶融合,构建能光控开关腺苷环化酶活性的光遗传学元件。将设计的光遗传学元件转入微生物细胞或动物细胞,从而赋予该细胞崭新的光遗传学规律。该研究将构建崭新的基于RGS的光遗传学元件,特别由于蓝细菌光敏色素具有多种光响应光谱范围,从而能设计出多种光谱范围的光遗传学元件。该研究将对光遗传学和光生物学发展具有重要意义。

结项摘要

蓝细菌光敏色素是最近确定的存在于蓝细菌中,发挥光合作用光调控作用的四吡咯光受体,与植物光敏色素同源,由于蓝细菌多样性而存在多种蓝细菌光敏色素,从而成为设计细胞光遗传学元件的良好模型。光遗传学是最近发展起来的新兴学科,它主要研究如何将光控开关蛋白与调控因子融合,转入一生物体,从而赋予该生物体新的光响应特征。本项目从集胞蓝细菌PCC6803 光敏色素设计成功的红光-绿光光控开关(RGS)入手,设计出适合于光遗传学的RGS 系列高效光控开关,通过分子设计将它与腺苷环化酶融合,构建了能光控开关腺苷环化酶活性的光遗传学元件。将设计的光遗传学元件转入了微生物大肠杆菌,尝试赋予大肠杆菌细胞新的光遗传学规律。为了进一步优化该光遗传学元件,认真研究了RGS类胆色素蛋白的分子进化、瞬态动力学、光控开关机理,研究了它们的光谱红移与光控开关多态性的结构基础。作为拓展研究,认真研究了紫外光控开关UVR8结构及其光控开关机制,研究了蓝细菌中新型氧化还原光控开关,从而为其它类型光遗传学元件研究打下了基础。该研究构建了多种新型可用于光遗传学的光控开关元件,特别是适用于多种光响应光谱范围的光控开关元件,有利于设计出多种光谱范围的光遗传学元件。该研究对光遗传学和光生物学发展具有重要意义。

项目成果

期刊论文数量(16)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(1)
专利数量(0)
A novel periplasmic protein (Slr0280) tunes photomixotrophic growth of the cyanobacterium, Synechocystis sp PCC 6803
一种新型周质蛋白 (Slr0280) 调节蓝藻集胞藻 PCC 6803 的光合营养生长
  • DOI:
    10.1016/j.gene.2015.09.015
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    Gene
  • 影响因子:
    3.5
  • 作者:
    Dong Liang-Liang;Li Qing-Dong;Wu Dong;Sun Ya-Fang;Zhou Ming;Zhao Kai-Hong
  • 通讯作者:
    Zhao Kai-Hong
Detailed insight into the ultrafast photoconversion of the cyanobacteriochrome Slr1393 from Synechocystis sp.
详细了解集胞藻蓝藻色素 Slr1393 的超快光转换。
  • DOI:
    10.1016/j.bbabio.2015.07.013
  • 发表时间:
    2015-10-01
  • 期刊:
    BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-BIOENERGETICS
  • 影响因子:
    4.3
  • 作者:
    Slavov, Chavdar;Xu, Xiuling;Wachtveitl, Josef
  • 通讯作者:
    Wachtveitl, Josef
Dynamic crystallography reveals early signalling events in ultraviolet photoreceptor UVR8
动态晶体学揭示紫外线光感受器 UVR8 的早期信号事件
  • DOI:
    10.1038/nplants.2014.6
  • 发表时间:
    2015-01
  • 期刊:
    Nature Plants
  • 影响因子:
    18
  • 作者:
    Zhao, Kai-Hong;Zhao, Kai-Hong;Yang, Xiaojing;Yang, Xiaojing
  • 通讯作者:
    Yang, Xiaojing
Adapting photosynthesis to the near-infrared: non-covalent binding of phycocyanobilin provides an extreme spectral red-shift to phycobilisome core-membrane linker from Synechococcus sp PCC7335
使光合作用适应近红外:藻蓝蛋白的非共价结合为聚球藻 PCC7335 的藻胆体核膜连接体提供了极端的光谱红移
  • DOI:
    10.1016/j.bbabio.2016.03.033
  • 发表时间:
    2016-06-01
  • 期刊:
    BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-BIOENERGETICS
  • 影响因子:
    4.3
  • 作者:
    Miao, Dan;Ding, Wen-Long;Zhao, Kai-Hong
  • 通讯作者:
    Zhao, Kai-Hong
Redox-dependent Ligand Switching in a Sensory Heme-binding GAF Domain of the Cyanobacterium Nostoc sp PCC7120
蓝藻发菜 PCC7120 感觉血红素结合 GAF 结构域中的氧化还原依赖性配体转换
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    Journal of Biological Chemistry
  • 影响因子:
    4.8
  • 作者:
    Zhao, Kai-Hong;Zhao, Kai-Hong;Gaertner, Wolfgang;Gaertner, Wolfgang
  • 通讯作者:
    Gaertner, Wolfgang

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其他文献

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  • 通讯作者:
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  • 期刊:
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    赵开弘
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  • 发表时间:
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  • 发表时间:
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  • 期刊:
    华中师范大学学报(自然科学版),2006,40(2),256~259
  • 影响因子:
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  • 作者:
    张玲;武栋;叶斌;周明;赵开弘
  • 通讯作者:
    赵开弘

其他文献

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藻胆体核膜连接蛋白的Arm2结构域的功能研究
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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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