多层次面向生物细胞元件的可视化编程与模拟技术研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    60671013
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    29.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    F0124.生物电子学与生物信息处理
  • 结题年份:
    2009
  • 批准年份:
    2006
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2007-01-01 至2009-12-31

项目摘要

随着后基因组计划的实施,生物细胞相关数据变得极为分散和庞杂。如果没有计算机辅助,人们很难从细胞整体层次上根据信息逻辑研究生命现象的本质规律。研究有效的生物细胞模型的计算机模拟技术将极大地推动生命科学的发展。为此,本项目拟开展多层次面向生物细胞元件的可视化编程与模拟技术研究,建立面向生物技术研究人员使用的特异生物模型描述语言。我们将采用可视化编程及可视化语言自动生成技术,完整地再现细胞中各种生理现象全过程,并有机地集成到一个交互式的可视化模型中,达到对细胞结构和功能的精确模拟,开发出面向对象的生物可视化编程平台。在该平台基础上整合各种生物信息模型和结构,建立一个可由用户按需自行定制参数的虚拟细胞实验环境,并可应用于简单自主单细胞生物的计算机模拟;最终为实现帮助生物学家设计实验和预测实验结果,并从整体上虚拟各种细胞结构和各种生理反应以及从整体上研究生命现象的本质提供有效的技术支持。

结项摘要

项目成果

期刊论文数量(9)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(5)
专利数量(0)
Analysis and prediction of protein local structure based on structure alphabets
基于结构字母表的蛋白质局部结构分析与预测
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    Proteins-Structure Function and Bioinformatics
  • 影响因子:
    2.9
  • 作者:
    Dong; Qiwen;Wang; Xiaolong;Wang; Yadong;Lin; Lei
  • 通讯作者:
    Lei
miR2Disease: a manually curated database for microRNA deregulation in human disease
miR2Disease:人类疾病中 microRNA 失调的手动数据库
  • DOI:
    10.1093/nar/gkn714
  • 发表时间:
    2009-01
  • 期刊:
    Nucleic Acids Research
  • 影响因子:
    14.9
  • 作者:
    Jiang Q;Wang Y;Hao Y;Juan L;Teng M;Zhang X;Li M;Wang G;Liu Y
  • 通讯作者:
    Liu Y
Reconstruct gene regulatory network using slice pattern model
使用切片模式模型重建基因调控网络
  • DOI:
    10.1186/1471-2164-10-s1-s2
  • 发表时间:
    2009-07-07
  • 期刊:
    BMC Genomics
  • 影响因子:
    4.4
  • 作者:
    Wang Y;Wang G;Yang B;Tao H;Yang JY;Deng Y;Liu Y
  • 通讯作者:
    Liu Y
Automatic Transformation between SBML and Other Biological Modeling Languages: A TGG-based Approach
SBML 和其他生物建模语言之间的自动转换:基于 TGG 的方法
  • DOI:
    10.1098/rstb.2020.0174
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    王亚东
  • 通讯作者:
    王亚东
Prioritization of disease microRNAs through a human phenome-microRNAome network
通过人类表型组-microRNAome 网络对疾病 microRNA 进行优先排序
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    BMC Systems Biology
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    王亚东
  • 通讯作者:
    王亚东

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其他文献

基于FCNN和ICAE的SAR图像目标识别方法
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
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  • 期刊:
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  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    喻玲娟;王亚东;谢晓春;林赟;洪文
  • 通讯作者:
    洪文
电针胃经穴抑制胃溃疡大鼠氧化损伤的作用机制研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
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  • 期刊:
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    --
  • 作者:
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  • 通讯作者:
    常小荣
齿面微织构对齿轮润滑特性的影响研究(已录用)
  • DOI:
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  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
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  • 影响因子:
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  • 作者:
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  • 通讯作者:
    尹延国
联合分析法在社区卫生服务选择偏好中的应用
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    中国全科医学
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    关丽征;金岳;滕菲;王亚东
  • 通讯作者:
    王亚东
U形还是线性?——网络情境下服务补救对口碑传播的影响研究
  • DOI:
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  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
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  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    王亚东;冯喜飞;秦进
  • 通讯作者:
    秦进

其他文献

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恶性肿瘤群体基因组变异检测理论与技术
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相似国自然基金

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相似海外基金

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AI项目解读示例

课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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