新型miRNA检测技术在冠状动脉疾病的风险预测、临床诊断和病情监测中的应用研究

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AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    81371896
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    65.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H2606.检验医学研究新技术与新方法
  • 结题年份:
    2017
  • 批准年份:
    2013
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2014-01-01 至2017-12-31

项目摘要

Acute coronary syndrome(ACS)is one of the coronary artery diseases (CAD) affecting seriously human being. Unfortunately, current clinical examination methods are not suitable for risk evaluation and early diagnosis of ACS patients. There is an urgent need for advanced ACS detection and diagnostic methods. Based on our previous studies on rolling circle amplification (RCA) and DNAzyme detection, we will develop a novel method for highly sensitive detection of low-abundance nucleic acids. This method combines the advantages of easy operation at room temperature and dual-amplification of RCA and DNAzyme techniques. Furthermore, we will utilize this method to examine the miRNA quantities in a large number of clinical urine and circulating blood samples, make a comparison with clinical examination data (myocardial enzyme spectrum, cardiac troponin, ECG, coronary angiography) and clinical diagnostic results, establish correlations between different coronary cardiac diseases and miRNA quantities in urine samples and circulating blood samples, and identify the miRNA biomarkers capable for distinguishing different types of coronary cardiac diseases. This project will deliver an valuable information and advanced detection method for risk prediction, early warning and condition monitoring of ACS patients.
急性冠状动脉综合征是严重危害人类的常见冠状动脉疾病之一。但是现有的临床检验技术不仅无法对急性冠状动脉疾病患者进行风险预测和早期预警,也无法在第一时间内对突发的急性冠脉综合征进行确切诊断。本课题将在前期工作的基础上,进一步优化滚环扩增技术和DNAzyme的酶促化学发光技术,充分利用它们在常温下检测的简便性和双重放大的高灵敏度,开发出可以检测低丰度核酸的高灵敏度核酸检测技术。利用该技术检测大样本量的临床尿样和血样的miRNA,通过与传统临床检验指标(心肌酶谱、心肌钙蛋白、心电图、冠状动脉造影)和确切诊断结果的对比分析,建立不同冠状动脉疾病与尿样和外周血中miRNA表达量的关联性,筛选出可以鉴定出不同冠状动脉疾病(特别是急性冠脉综合征)的尿样和血样中的miRNA诊断标志物,为急性冠状动脉疾病的风险预测、早期预警和病情监测提供重要的检验指标和先进的诊断技术。

结项摘要

本课题针对目前临床诊断的迫切需求和现有核酸检测技术的弊端,提出了利用新型恒温扩增技术改善核酸检测性能的设想。我们将关注点聚焦在滚环扩增(rolling circle amplification,简称RCA)。首先我们系统地研究了核苷酸衍生物对滚环扩增效率的影响、不同连接酶对制备锁式探针(padlock probe)的环化效率的影响、核苷酸衍生物对G-四链体结构稳定性的影响、G-四链体的结构特性与DNAzyme的酶促显色的相关性、利用胶体金纳米颗粒对滚环扩增产物和指数扩增(EXPAR)产物实施新型裸眼可视化检测。基于这些研究的实验结果和结论,我们开发了新型的核酸检测方法。该方法具有灵敏(检测限可以达到2.219zmol的量级)、精准(可以特异性地区分出仅有单个核苷酸差异的寡核苷酸靶分子)、便捷(样品制备方便、操作方便、结果显示方便)、高效(不需要价格昂贵的精密检测仪器)、快速(20分钟 ~ 30分钟即可获得检测结果)和实时(可以开展现场的POCT检测)的技术优势。这种新方法可以成为常规临床诊断分析中的超灵敏核酸检测、生物学以及基础医学研究中的基因组检测、实时实地海关检验检疫、公共卫生监测、法医现场标本分析的一种极有价值的工具。.在此基础上,我们又开拓了该项新技术的应用领域。在后基因组时代和蛋白质组学时代,蛋白质之间的相互作用以及蛋白质与核酸之间的相互作用是解析物种进化、探索疾病起源、延长生命极限、保障人类健康的基本问题和关键技术。现有的方法和技术都有不同的优缺点,为了实现快速检测、高通量筛选和全基因组挖掘的目的,我们充分利用了蛋白质在与核酸相互作用时的变构效应,开发出了基于滚环扩增技术的新方法。应用该项新技术,我们已经成功地研究了核酸内切酶在切割核酸链过程中的动力学特性,检测了与新生儿代谢病相关的氨酸,构建了生物逻辑门元件等,填补了经典研究方法的不足,为开发具有自主知识产权的新型核酸检测技术和生物大分子相互作用的研究方法奠定了坚实的实验基础。

项目成果

期刊论文数量(15)
专著数量(0)
科研奖励数量(1)
会议论文数量(0)
专利数量(3)
Mapping the nicking efficiencies of nickase R.BbvCI for side-specific LNA-substituted substrates using rolling circle amplification.
使用滚环扩增绘制切口酶 R.BbvCI 对侧特异性 LNA 取代底物的切口效率
  • DOI:
    10.1038/srep32560
  • 发表时间:
    2016-09-01
  • 期刊:
    Scientific reports
  • 影响因子:
    4.6
  • 作者:
    Wei H;Zhao G;Hu T;Tang S;Jiang J;Hu B;Guan Y
  • 通讯作者:
    Guan Y
Repressor logic modules assembled by rolling circle amplification platform to construct a set of logic gates.
滚环放大平台组装抑制逻辑模块,构建一组逻辑门
  • DOI:
    10.1038/srep37477
  • 发表时间:
    2016-11-21
  • 期刊:
    Scientific reports
  • 影响因子:
    4.6
  • 作者:
    Wei H;Hu B;Tang S;Zhao G;Guan Y
  • 通讯作者:
    Guan Y
Determination of base binding strength and base stacking interaction of DNA duplex using atomic force microscope.
使用原子力显微镜测定 DNA 双链体的碱基结合强度和碱基堆积相互作用。
  • DOI:
    10.1038/srep09143
  • 发表时间:
    2015-03-16
  • 期刊:
    Scientific reports
  • 影响因子:
    4.6
  • 作者:
    Zhang TB;Zhang CL;Dong ZL;Guan YF
  • 通讯作者:
    Guan YF
A novel strategy to analyze L-tryptophan through allosteric Trp repressor based on rolling circle amplification.
基于滚环扩增的变构色氨酸阻遏物分析 L-色氨酸的新策略。
  • DOI:
    10.1016/j.bios.2015.04.017
  • 发表时间:
    2015-09
  • 期刊:
    Biosensors and Bioelectronics
  • 影响因子:
    12.6
  • 作者:
    Zhao Guojie;Hu Tianyu;Li Jun;Wei Hua;Shang Hong;Guan Yifu
  • 通讯作者:
    Guan Yifu
Production of dumbbell probe through hairpin cleavage-ligation and increasing RCA sensitivity and specificity by circle to circle amplification.
通过发夹切割连接生产哑铃探针,并通过环对环扩增提高 RCA 敏感性和特异性
  • DOI:
    10.1038/srep29229
  • 发表时间:
    2016-07-07
  • 期刊:
    Scientific reports
  • 影响因子:
    4.6
  • 作者:
    Wei H;Tang S;Hu T;Zhao G;Guan Y
  • 通讯作者:
    Guan Y

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一种细胞核质蛋白分离方法的建立
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  • 通讯作者:
    郑华川
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  • 期刊:
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  • 通讯作者:
    关一夫
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  • 发表时间:
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  • 期刊:
    中国肿瘤临床
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  • 作者:
    赵丹懿;安丽文;徐惠绵;关一夫
  • 通讯作者:
    关一夫

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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