新的具有转糖基活性的唾液酸苷酶的基因发掘、分子改造及其催化分子机制研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31872626
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    61.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0102.微生物生理与生化
  • 结题年份:
    2022
  • 批准年份:
    2018
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2019-01-01 至2022-12-31

项目摘要

More than one available reactive hydroxyl group of carbohydrates makes chemical synthesis laborious and difficult for application. The glycosidase approach in enzymatic synthesis has better industrial practicality as the simple glycosyl donors and diverse acceptors are used. Sialoglycans with sialic acid occupation of outermost positions are widespread in higher animal cell surface have a variety of important biological functions, such as cell-cell interactions, immune response, pathogen adhesion and so on. More than 70% of human milk oligosaccharides are sialyloligosaccharides which play important roles in gut maturation, brain and cognitive development and supporting resistance to pathogen infection in neonate. We have unearthed a new sialidase from CAZy Database and synthesized 6'-sialyllactose at the highest conversion reported so far. This project intends to discover more new transglycosyl-sialidase from CAZy Database. We will make use of molecular evolution to improve trans-glycosylation activity and regioselectivity of the enzymes, and to expand their substrate specificity. Moreover, we will elucidate the molecular mechanism of effects of specific amino acid sites on trans-glycosylation activity, substrate specificity and regioselectivity. The research will be able to provide a variety of new powerful enzymatic tools for the synthesis of sialoglycans/ sialyloligosaccharides and sialyl-chemicals and the interpretation of the specific amino acid sites affecting transglycosylation, substrate specificity and regioselectivity, which will deepen the understanding of the mechanism of glycosidase transglycosylation and promote the practice of glucosidase synthesis of glygan.
糖的多羟基使特异糖苷的化学法合成步骤繁琐;糖苷酶法糖基供体为简单糖类且糖基受体多样,应用潜力巨大。唾液酸末端定位的唾液酸糖链普遍存在于高等生物细胞表面,具有细胞间相互作用、免疫反应、病原体粘附等重要功能;人乳寡糖的70%以上是唾液酸寡糖,在婴幼儿肠道菌群形成、大脑发育及抵抗病原体感染中具有重要作用。我们已从糖酶数据库CAZy Database发掘出了一种新的唾液酸苷酶,以目前报道的最高转化率专一合成了6’-唾液酸基乳糖。本项目拟从该数据库中继续发掘出更多新的转糖基唾液酸苷酶,分子改造提高酶的转糖基活性和区域选择性,拓展酶的底物特异性,并阐释特殊氨基酸位点影响转糖基活性、区域选择性及底物特异性的分子机制。项目完成不仅可获得多种新的糖合成工具酶用于唾液酸糖链和糖苷化合物的合成,而且所阐释的糖苷酶转糖基作用相关的分子机制,也将加深人们对糖苷酶转糖基性质的理解,促进糖苷酶法合成糖苷的研究及应用。

结项摘要

唾液酸常存在于各种真核生物糖蛋白、鞘糖脂等糖链的末端,由于唾液酸末端定位和负电荷特性,唾液酸糖链具有重要的生物功能,包括细胞间的相互作用、免疫反应、细菌粘附和病毒感染等。利用微生物来源的唾液酸苷酶和锥虫来源的转唾液酸苷酶合成唾液酸糖链/寡糖已经成为了一个非常有吸引力的酶合成方法。但是目前研究报道的细菌或病毒源唾液酸苷酶的合成产率比较低(0.3-24%),而且产物常为α-2,3键和α-2,6键唾液酸苷的同分异构体混合物,分离纯化比较困难;而锥虫源转唾液酸苷酶具有比较高的转糖基活性,但该类酶只能合成α-2,3键唾液酸苷,不能合成α-2,6键唾液酸苷。这些局限导致了目前仅有很少一部分商品化的酶被用于研究,远远不能满足酶法大量合成获得各种特定结构的唾液酸糖链/寡糖及唾液酸苷化合物的需求,限制了新的相关糖类药物研发和人乳寡糖的工业化制备和应用。在本项目工作中,我们发现了新的来源于肠道细菌的唾液酸苷酶,发展了一种有效的分子改造策略,获得了一系列具有应用前景的具有高的转糖基活性的突变酶。以肠道菌群的宏基因组为模板克隆并表达得到了8种GH33家族的具有转糖基活性的唾液酸苷酶,系统地研究了一种来源于Bacteroides intestinalis的转糖基活性较高的唾液酸苷酶BiS47的底物特异性、酶水解唾液酸二糖、6’-唾液酸乳糖和3’-唾液酸乳糖的动力学参数和转糖基反应条件;深入开展了BiS47的理性设计分子改造,成功获得了转糖基活性显著提高的突变体BiS47-G185C和BiS47-G398H,并将所发现的G185C和G398H位点突变策略应用到本研究发掘获得的4种同属不同种细菌源唾液酸苷酶的分子改造中,进一步获得了一系列转糖基催化活性提高的突变酶。本项目工作为酶分子改造的理性设计奠定了理论基础,对于新的糖合成工具酶开发、酶法合成唾液酸糖链/寡糖及唾液酸苷化合物,以及在此基础上进一步开发药物和母乳寡糖等,具有重要的科学意义和应用价值。

项目成果

期刊论文数量(6)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Two-Step Enzymatic Conversion of Rebaudioside A into a Mono-α-1,4-Glucosylated Rebaudioside A Derivative
将莱鲍迪甙 A 两步酶促转化为单-α-1,4-葡萄糖基化莱鲍迪甙 A 衍生物。
  • DOI:
    10.1021/acs.jafc.0c07452
  • 发表时间:
    2021-02-23
  • 期刊:
    JOURNAL OF AGRICULTURAL AND FOOD CHEMISTRY
  • 影响因子:
    6.1
  • 作者:
    Wang, Wenzheng;Sun, Yajing;Xiao, Min
  • 通讯作者:
    Xiao, Min
唾液酸苷酶的催化机理及水解与合成寡糖进展
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
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  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    郭龙成;马忠轩;卢丽丽;肖敏
  • 通讯作者:
    肖敏
Enzymatic Glucosylation of Salidroside from Starch by alpha-Amylase
α-淀粉酶对淀粉中的红景天苷进行酶促糖基化
  • DOI:
    10.1021/acs.jafc.8b06618
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    Journal of Agricultural and Food Chemistry
  • 影响因子:
    6.1
  • 作者:
    Wang Ke;Qi Tingting;Guo Longcheng;Ma Zhongxuan;Gu Guofeng;Xiao Min;Lu Lili
  • 通讯作者:
    Lu Lili

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不同月龄BALB/c小鼠感染甲型H1N1型流感病毒的炎性调控差异研究
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  • 通讯作者:
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  • DOI:
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  • 发表时间:
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  • DOI:
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  • 发表时间:
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  • 影响因子:
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  • 作者:
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  • 发表时间:
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我国 RD 资本存量的空间分布特征
  • DOI:
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  • 发表时间:
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  • 期刊:
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  • 作者:
    肖敏;谢富纪
  • 通讯作者:
    谢富纪

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AI项目解读示例

课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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