脱腺苷酸酶的内质网定位及其对内质网上mRNA的翻译调控研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31870783
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    59.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0505.蛋白质、多肽与酶生物化学
  • 结题年份:
    2022
  • 批准年份:
    2018
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2019-01-01 至2022-12-31

项目摘要

Regulation of translational efficiency is important to the control of eukaryotic gene expression. The bulk of mRNAs are translated on the ER surface or in the cytosol. Classically, translationally repressed mRNAs are separated from the ER and degraded or stored in the cytosol. Most mRNAs on the ER are thought to have a high translational efficiency. The poly(A) tail at the 3’-end of mRNAs have been proved to be crucial to mRNA quality control, transport, location, translational efficiency and decay. Deadenylation, the removal of the poly(A) tail, is a rate-limiting step in mRNA degradation. Although there are considerable amounts of mRNAs on the ER, it is unclear yet whether mRNAs on the ER could be deadenylated. In this research, this problem was addressed by studying deadenylases located on the ER and their potential roles in the regulation of translational efficiency of ER-localized mRNAs.
翻译水平的调控是基因表达调控中重要的一环。绝大部分mRNAs的翻译场所可以分成内质网和胞质两大类。无论mRNAs在何处翻译,一般认为其降解场所都是在胞质或胞质的一些特殊结构中,而内质网上mRNAs被默认为结合多聚核糖体的高效翻译状态。已有研究表明,mRNAs 3’端的poly(A)尾巴的长度与mRNAs的质量控制、转运、定位、翻译效率调节和降解都密切相关,脱腺苷酸化是成熟mRNAs降解途径中的一个限速步骤。在胞质和基质中mRNAs的脱腺苷酸化和降解途径已经得到了相对深入的研究,但对于内质网上的mRNAs是否会被脱腺苷酸化这一问题还未曾受到关注。这也是本项目拟解决的核心科学问题。本项目将在初期探索的基础上,鉴定内质网上存在的主要脱腺苷酸酶以及研究其内质网定位的机制,并进一步探索内质网定位的脱腺苷酸酶是否调控了内质网mRNAs的翻译效率和所参与的细胞功能。

结项摘要

翻译效率是基因表达调控中重要的一环。绝大部分mRNAs的翻译场所可以分成内质网和胞质两大类。无论mRNAs在何处翻译,一般认为其降解场所都是在胞质或胞质的一些特殊结构中,而内质网上mRNAs被默认为结合多聚核糖体的高效翻译状态。mRNAs 3’端poly(A)的长度与mRNAs的质量控制、转运、定位、翻译效率调节和降解都密切相关,脱腺苷酸化是成熟mRNAs降解途径中的一个限速步骤。在胞质和基质中mRNAs的脱腺苷酸化和降解途径已经得到了相对深入的研究,但对于内质网上的mRNAs是否会被脱腺苷酸化这一问题还未曾受到关注。本项目研究中,我们发现内质网上存在着具有酶学活性的脱腺苷酸酶,其中PARN在ER上明显富集。研究结果表明,PARN自身具有膜结合能力,其ER定位受到磷酸化修饰以及细胞状态的影响。ER定位的PARN特异性调控ER上mRNAs的poly(A)长度,通过促进低翻译效率转录本的降解促使核糖体在ER上重新分配,由此影响了基因表达水平。DNA损伤时,PARN在核仁-胞浆-ER上的比例被磷酸化所改变,从而通过功能转换参与了DNA损伤应答和细胞周期调控等重要细胞过程。

项目成果

期刊论文数量(5)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Diverse functions of deadenylases in DNA damage response and genomic integrity.
去腺苷酸酶在 DNA 损伤反应和基因组完整性中的多种功能。
  • DOI:
    10.1002/wrna.1621
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    Wiley Interdiscip Rev RNA
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Yan Yong-Bin
  • 通讯作者:
    Yan Yong-Bin
The Intrinsically Disordered C-Terminal Domain Triggers Nucleolar Localization and Function Switch of PARN in Response to DNA Damage
本质上无序的 C 端结构域触发 PARN 的核仁定位和功能转换以响应 DNA 损伤
  • DOI:
    10.3390/cells8080836
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    Cells
  • 影响因子:
    6
  • 作者:
    Duan Tian Li;He Guang Jun;Hu Li Dan;Yan Yong Bin
  • 通讯作者:
    Yan Yong Bin
Translation Efficiency and Degradation of ER-Associated mRNAs Modulated by ER-Anchored poly(A)-Specific Ribonuclease (PARN).
ER 锚定聚 (A) 特异性核糖核酸酶 (PARN) 调节的 ER 相关 mRNA 的翻译效率和降解。
  • DOI:
    10.1007/s40820-023-01050-4
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    Cells
  • 影响因子:
    6
  • 作者:
    Duan Tian-Li;Jiao Han;He Guang-Jun;Yan Yong-Bin
  • 通讯作者:
    Yan Yong-Bin
Contributions of the C-terminal domain to poly(A)-specific ribonuclease (PARN) stability and self-association.
C 末端结构域对聚腺苷酸特异性核糖核酸酶 (PARN) 稳定性和自缔合的贡献。
  • DOI:
    10.1016/j.bbrep.2019.100626
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    Biochem Biophys Rep
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    He Guang-Jun;Yan Yong-Bin
  • 通讯作者:
    Yan Yong-Bin
Human Ccr4 and Caf1 Deadenylases Regulate Proliferation and Tumorigenicity of Human Gastric Cancer Cells via Modulating Cell Cycle Progression
人 Ccr4 和 Caf1 脱腺苷酸酶通过调节细胞周期进程来调节人胃癌细胞的增殖和致瘤性
  • DOI:
    10.3390/cancers13040834
  • 发表时间:
    2021-02-17
  • 期刊:
    Cancers
  • 影响因子:
    5.2
  • 作者:
    Song XH;Liao XY;Zheng XY;Liu JQ;Zhang ZW;Zhang LN;Yan YB
  • 通讯作者:
    Yan YB

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其他文献

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    --
  • 作者:
    张勇;闫永彬
  • 通讯作者:
    闫永彬

其他文献

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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