罗氏沼虾GTPases多样性分析及其在先天免疫中的功能研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31101926
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    23.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C1907.水产生物免疫学
  • 结题年份:
    2014
  • 批准年份:
    2011
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2012-01-01 至2014-12-31

项目摘要

罗氏沼虾(Macrobrachium rosenbergii)原产于印度太平洋地区,生活在淡水或咸淡水水域。罗氏沼虾属于节肢动物,无获得性免疫系统,只能依赖先天免疫系统,抵御外界微生物的感染。相对于对虾而言,罗氏沼虾有更强的抗WSSV能力。已有研究表明,对虾Ras蛋白超家族成员Ran和Rab通过调节吞噬作用参与抗病毒免疫防御反应。Ras蛋白是膜相关的小GTPase,该类蛋白在细胞的增值,分化和凋亡中起到重要的作用。另外,在脊椎动物中报道的大GTPases也具有抗病毒功能。我们通过转录组测序,在沼虾中发现了很多小GTPases家族成员, 尤其是发现许多Rab亚家族成员。另外,还发现了大分子量的GTPases。本研究结合生物信息学和分子生物学对沼虾GTPases多样性和在先天免疫防御中的功能进行研究,旨在阐明沼虾GTPases多样性与其较强的抗WSSV能力的关系,为沼虾疾病的防治提供依据。

结项摘要

通过对罗氏沼虾肝胰腺,受精卵,中肠组织进行转录组测序,获得了大量的免疫相关基因,其中包括该项目要研究的GTPases。我们研究了四类不同的GTPases,包括2种ADP ribosylation factors (MrArf1, MrArf2),11种Rab GTPases, 3种干扰素诱导的大GTPases, 3种Dynamins。在鳃中,MrArf1和MrArf2受WSSV刺激24小时后先下调表达,在48小时有明显的上调。在肝胰腺中,MrArf1受WSSV刺激24,48小时上调表达,MrArf2在24小时上调表达,48小时回到正常水平。RNAi干扰MrArf1或者MrArf2后,发现VP28表达下调。研究结果表明,WSSV利用宿主的Arfs,提高其复制水平。对虾的Ral重组表达蛋白,可以抑制病毒的复制,不影响VP28的表达。进化树分析表明,罗氏沼虾11种不同的Rabs, 属于不同的家族。Rab基因广泛表达,不同程度的受弧菌和WSSV调控。WSSV可以上调表达干扰素诱导的大GTPases,对其中一种大GTPases进行了干扰,发现其可以调控一种抗菌肽基因的表达。推测,大GTPases可能通过调节抗菌肽的表达,影响病毒的复制。Dynamins也是一种GTPase,研究发现,其受WSSV调控,同时我们的研究发现,Dynamins的表达受STAT基因调控,RNAi将STAT敲低后,dynamins的表达降低。将STAT或者dynamin分别干扰后,影响了WSSV的复制。研究结果表明,STAT基因通过调节dynamins基因的表达,影响了病毒的复制。通过该项目的研究,发现,无论是小GTPases还是大GTPases,在罗氏沼虾病原的侵染过程中,起到了重要作用。

项目成果

期刊论文数量(16)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Identification and function of 11 Rab GTPases in giant freshwater prawn Macrobrachium rosenbergii
罗氏沼虾11种Rab GTP酶的鉴定及功能
  • DOI:
    10.1016/j.fsi.2014.12.021
  • 发表时间:
    2015-03-01
  • 期刊:
    FISH & SHELLFISH IMMUNOLOGY
  • 影响因子:
    4.7
  • 作者:
    Huang, Ying;Ren, Qian
  • 通讯作者:
    Ren, Qian
Three different anti-lipopolysaccharide factors identified from giant freshwater prawn, Macrobrachium rosenbergii
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  • DOI:
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  • 期刊:
    FISH & SHELLFISH IMMUNOLOGY
  • 影响因子:
    4.7
  • 作者:
    Ren, Qian;Zhang, Zhao;Wang, Wen
  • 通讯作者:
    Wang, Wen
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  • DOI:
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  • 发表时间:
    2012
  • 期刊:
    Developmental and Comparative Immunology
  • 影响因子:
    2.9
  • 作者:
    Ren Q;Zhou J;Jia YP;Wang XW;Zhao XF;Wang JX
  • 通讯作者:
    Wang JX
Characterization of two novel ADP ribosylation factors from giant freshwater prawn Macrobrachium rosenbergii and their responses to WSSV challenge.
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  • DOI:
    10.1016/j.dci.2014.10.006
  • 发表时间:
    2015-01
  • 期刊:
    Developmental and comparative immunology
  • 影响因子:
    2.9
  • 作者:
    Ding ZF;Ren J;Tan JM;Wang Z;Yin SW;Huang Y;Huang X;Wang W;Lan JF;Ren Q
  • 通讯作者:
    Ren Q
Six defensins from the triangle-shell pearl mussel Hyriopsis cumingii
三角贝珍珠贝的六种防御素
  • DOI:
    10.1016/j.fsi.2011.07.020
  • 发表时间:
    2011-12-01
  • 期刊:
    FISH & SHELLFISH IMMUNOLOGY
  • 影响因子:
    4.7
  • 作者:
    Ren, Qian;Li, Meng;Chen, Ke-Ping
  • 通讯作者:
    Chen, Ke-Ping

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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