3d过渡金属体系L边X射线吸收光谱的多参考态量子化学研究

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基本信息

  • 批准号:
    21703105
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    26.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    B0301.化学理论与方法
  • 结题年份:
    2020
  • 批准年份:
    2017
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2018-01-01 至2020-12-31

项目摘要

Transitional metal ions appear in a wide range of systems like enzymes and molecular magnets, which act as active centers in processes like adsorption, redox, and spin transition and play important roles. L-edge X-ray absorption spectroscopy (XAS) based on metal 2p core orbital transitions offers a direct probe of spin, valence, and bonding of the metal ion center and thus gives effective mapping of its geometry and electronic structure. Yet it remains a great challenge in theoretical chemistry to accurately simulate this type of spectroscopy, mainly due to the multiplet effects caused by the degeneracy of the 2p and 3d orbitals, which are often difficult to be described by density functional theory methods based on single electron approximation. We consider three important factors, static correlation, dynamic correlation, and environmental effects, and develop models to accurately calculate core-excited states and metal L-edge XAS of transition metal complexes, by combing various multiconfigurational methods [restricted-active-space self-consistent field, (RASSCF), RAS second-order perturbation theory (RASPT2), multi-reference configurational interaction (MRCI)] and the quantum mechanics/molecular mechanics (QM/MM) model. The multiconfigurational methods offer a natural choice to consider the multiplet effects. Taking 3d metals as examples, we will provide benchmark studies based on the latest gas phase experiments and applications to important metalloenzymes, molecular magnets, solutions of coordination complexes, and transition metal based materials.
过渡金属离子广泛存在于生物酶结构、分子磁性材料等系统中,作为吸附、氧化还原、自旋转换等过程的活性中心,扮演着重要角色。基于金属2p核轨道跃迁的L边X射线吸收光谱可以对金属离子的自旋、价态、成键情况直接测量,从而对体系的几何和电子结构给出有效表征。然而,由于2p和3d轨道的简并性造成的多态效应,基于单电子近似的密度泛函理论通常很难描述,精确模拟这类光谱成为理论化学的挑战。我们从静态相关、动态相关、和环境效应三个方面考虑,基于各种多参考态理论化学方法(RASSCF,RASPT2,MRCI)以及量子力学/分子力学(QM/MM)模型,发展能精确描述过渡金属核激发态以及金属L边X射线吸收光谱的方法。多参考态方法是描述多态效应的自然选择。我们以3d过渡金属体系为例,比照最新的气相试验,对该类方法做系统的标定,并应用于重要的金属酶、分子磁体、配合物溶液、过渡金属材料等体系。

结项摘要

X射线光谱研究依赖于同步辐射光源与X射线自由电子激光(XFEL)大科学装置。理论研究对实验发展有巨大的推动作用,可最大化巨额实验研究经费的价值,符合国家基础科学战略需求。本研究以提高X射线光谱计算精度为目标,围绕静态相关、动态相关、环境效应、电声耦合效应四个方面,基于多参考方法与密度泛函理论,发展了光谱计算方法和实用程序,应用于分子(过渡金属酶结构、有机小分子)和材料(二维材料、晶体发光材料)中。我们的理论光谱很好地吻合了实验。基于精确的光谱计算,我们解释了实验和预测了新光谱。(1)基于多参考方法(RASSCF,RASPT2),系统研究了静态相关、动态相关、价电子与芯电子激发态的态平均数、基组对铜酶模型化合物的Cu L边X射线吸收光谱(XAS)的影响。(2)发展了基于势能面快照的瞬态X射线吸收谱(TXAS)计算方法。开发了MCNOX程序,应用于光化学机理研究。预测了尿嘧啶光学退激发过程中nπ*光学暗态的C/N/O 1s边TXAS指纹峰;其中O1s信号已获最新XFEL实验的证实。(3)发展了簇-周期方法,用于精确计算二维材料的X射线光电子能谱(XPS)。通过增大簇模型直至光谱收敛,系统标定了芯电子电离中心的环境效应。(4)拓展了自主开发的程序DynaVib的新功能,将振动分辨光谱计算从光学波段推广到X射线波段,获得与最新气相实验吻合很好的XPS光谱精细结构。应用该程序于发光材料的光学光谱研究,并基于量子力学/分子力学(QM/MM)水平下得到的精确的荧光和磷光谱,提出了双通道热激活延迟发光的光物理机制,解释了实验。本项目中理论方法、程序工具、计算方案的发展与优化,为借助光谱(特别是X射线光谱)来表征分子、材料的结构与动力学的各种应用打下了基础。.

项目成果

期刊论文数量(6)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
On the spectral profile change in the Q band absorption spectra of metalloporphyrins (Mg, Zn, and Pd): A first-principles study
金属卟啉(Mg、Zn 和 Pd)Q 带吸收光谱的光谱轮廓变化:第一性原理研究
  • DOI:
    10.1063/1.5090964
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    Journal of Chemical Physics
  • 影响因子:
    4.4
  • 作者:
    Pan Yafu;Li Li;Qiu Feifei;Wei Yong;Hua Weijie;Tian Guangjun
  • 通讯作者:
    Tian Guangjun
Thermally Activated Delayed Fluorescence in an Organic Cocrystal: Narrowing the Singlet-Triplet Energy Gap via Charge Transfer
有机共晶中的热激活延迟荧光:通过电荷转移缩小单线态-三线态能隙
  • DOI:
    10.1002/anie.201904427
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    Angewandte Chemie International Edition
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Sun Lingjie;Hua Weijie;Liu Yang;Tian Guangjun;Chen Mingxi;Chen Mingxing;Yang Fangxu;Wang Shufeng;Zhang Xiaotao;Luo Yi;Hu Wenping
  • 通讯作者:
    Hu Wenping
Accurate K-edge X-ray photoelectron and absorption spectra of g-C3N4 nanosheets by first-principles simulations and reinterpretations
通过第一性原理模拟和重新解释获得 g-C3N4 纳米片的准确 K 边 X 射线光电子和吸收光谱
  • DOI:
    10.1039/c9cp04573b
  • 发表时间:
    2019-11-07
  • 期刊:
    PHYSICAL CHEMISTRY CHEMICAL PHYSICS
  • 影响因子:
    3.3
  • 作者:
    Zhang, Jun-Rong;Ma, Yong;Hua, Weijie
  • 通讯作者:
    Hua, Weijie
Theoretical assessment of vibrationally resolved C1s X-ray photoelectron spectra of simple cyclic molecules
简单环状分子振动分辨 C1s X 射线光电子能谱的理论评估
  • DOI:
    10.1039/d0cp02970j
  • 发表时间:
    2020-09-21
  • 期刊:
    PHYSICAL CHEMISTRY CHEMICAL PHYSICS
  • 影响因子:
    3.3
  • 作者:
    Hua, Weijie;Tian, Guangjun;Luo, Yi
  • 通讯作者:
    Luo, Yi
Local structures of nitrogen-doped graphdiynes determined by computational X-ray spectroscopy
通过计算 X 射线光谱测定氮掺杂石墨二炔的局部结构
  • DOI:
    10.1016/j.carbon.2019.04.045
  • 发表时间:
    2019-08-01
  • 期刊:
    CARBON
  • 影响因子:
    10.9
  • 作者:
    Ma, Yong;Lin, Juan;Luo, Yi
  • 通讯作者:
    Luo, Yi

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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