基于多中心电子病历数据协同分析的预后预测系统

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    81801796
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    21.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H2806.医学信息系统与远程医疗
  • 结题年份:
    2021
  • 批准年份:
    2018
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2019-01-01 至2021-12-31

项目摘要

In clinical practice, the prognosis prediction model has become increasingly appreciated. In recent years, the method of constructing prognosis prediction model has changed from expert experience mode to data-driven mode, especially establishing prediction model based on the electronic health records has become a hot area of research. However, due to the significant differences in system architecture, data management pattern, clinical term coding system and data sharing strategies, it is difficult to translate massive clinical data from multi-center electronic health record systems into clinical decision support system which may help doctors and patients in clinical practice. These problems have seriously restricted the analysis of medical big data from “single-center” to “multi-center”. This study intent to break through the existing research paradigm of “first data aggregation then data analysis”, and focused on the unified expression of clinical data from multi-center electronic health record system and the construction and evaluation methods of multi-center fusion prognosis prediction model. This study explored novel solutions for collaborative analysis of multi-center electronic health record data which currently was difficult to carry out effectively due to the problems such as clinical data normalization, patient data privacy-preserving and data heterogeneity feature aggregation. Finally, through the establishment of a prototype system, the theory and technology proposed in this study were validated and evaluated.
预后预测模型在临床实践中的作用日益突出,近年来预后预测模型的构建方法开始从专家经验模式向数据驱动模式转变,特别是基于电子病历数据构建预后预测模型已经成为领域研究的热点。然而不同医疗机构电子病历系统在软件基础架构、数据管理模式、临床术语编码、数据共享策略等方面存在巨大差异,难以将多中心电子病历中的海量数据转化为具有临床应用价值的决策支持模型及工具,从而严重制约医疗大数据分析从“单中心”走向“多中心”。本研究拟突破现有“先数据汇总,再建模分析”的研究范式,从多中心电子病历数据统一化表达、多中心融合预后预测模型构建与评估方法等方面开展研究,重点解决多中心电子病历数据协同分析中的规范化表达、患者数据隐私保护、数据异质性特征融合等关键问题,并通过建立原型系统,对本研究提出的理论与技术进行验证评估。本研究可为建立部署更灵活、覆盖范围更广、预测更精准的临床决策支持系统探索新理论、新方法。

结项摘要

预后预测在临床研究及实践中具有重要作用,近年来电子病历系统的应用及普及,为预后预测模型研究提供了丰富的数据来源。然而,单一医疗机构电子病历系统中积累的临床数据,由于样本数量、患者特征复杂度等方面的限制,往往难以满足数据驱动预后预测研究需求,因此构建高质量的数据驱动预后预测模型需要整合、分析来自不同医疗机构的多中心电子病历数据。建立一套面向多中心临床数据产生、存储、管理真实环境,兼具较高灵活性与可拓展性,并能够适应不同医疗机构患者数据隐私保护要求与数据异质性特点的数据协同分析预后预测系统具有十分重要的意义。. 本课题着眼于构建基于多中心电子病历数据协同分析的预后预测系统框架。首先搭建了构建了适应多家医院异构信息系统的多中心电子病历数据协同分析框架,完成了多家医院近20年的结直肠癌患者临床数据到OMOP通用数据模型的转换;其次构建了多中心融合预后预测模型及分布式隐私保护计算框架,包括基于多变量Meta分析的多中心协同预后预测框架、基于随机森林模型的多中心协同预后预测模型、基于同态加密的多中心隐私保护的预后预测模型以及基于半监督迁移学习的多中心协同分析预后预测模型;然后提出了多中心协同分析框架中预后预测模型评估方法,将针对预测模型在单一数据集上的预测性能评估指标拓展到了具有异质性特征的不同医疗机构数据集上;最后将提出的理论及框架针对结直肠肿瘤预后研究特点进行调整,构建了一套覆盖3家医疗机构电子病历系统(科室层级)的结直肠癌预后预测原型系统。本课题解决了多中心数据统一化表达、分析过程中患者数据隐私保护、不同医疗机构异质性数据融合等阻碍医疗大数据分析从单中心模式向多中心模式拓展的关键问题,可为建立部署更加灵活、覆盖范围更广、预测更加精准的临床决策支持系统探索新理论、新方法。. 在本基金的资助下,项目组在IEEE Journal of Biomedical and Health Informatics、Journal of Medical Internet Research等医学信息学领域权威期刊上发表期刊论文16篇,申请国家发明专利4项,授权国家发明专利9项,培养硕士研究生2名,协助培养博士研究生5名、硕士研究生11名。此外,项目负责人2020年获浙江省科技进步一等奖1项(排名7/13)。

项目成果

期刊论文数量(16)
专著数量(0)
科研奖励数量(1)
会议论文数量(8)
专利数量(13)
Analysis of correlation between window duration for kurtosis computation and accuracy of noise-induced hearing loss prediction
峰度计算窗口时长与噪声性听力损失预测准确度的相关性分析
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    JOURNAL OF THE ACOUSTICAL SOCIETY OF AMERICA
  • 影响因子:
    2.4
  • 作者:
    Yu Tian;Wenxi Ding;Meibian Zhang;Tianshu Zhou;Jingsong Li;Wei Qiu
  • 通讯作者:
    Wei Qiu
EHR-Oriented Knowledge Graph System: Toward Efficient Utilization of Non-Used Information Buried in Routine Clinical Practice
面向EHR的知识图谱系统:高效利用日常临床实践中隐藏的未使用信息
  • DOI:
    10.1109/jbhi.2021.3085003
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    IEEE JOURNAL OF BIOMEDICAL AND HEALTH INFORMATICS
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Yong Shang;Yu Tian;Min Zhou;Tianshu Zhou;Kewei Lyu;Zhixiao Wang;Ran Xin;Tingbo Liang;Shiqiang Zhu;Jingsong Li
  • 通讯作者:
    Jingsong Li
Improving Prediction for Medical Institution with Limited Patient Data: Leveraging Hospital-Specific Data Based on Multicenter Collaborative Research Network
改善患者数据有限的医疗机构的预测:利用基于多中心协作研究网络的医院特定数据
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    ARTIFICIAL INTELLIGENCE IN MEDICINE
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Jin Li;Yu Tian;Runze Li;Tianshu Zhou;Jun Li;Kefeng Ding;Jingsong Li
  • 通讯作者:
    Jingsong Li
Establishment and evaluation of a multicenter collaborative prediction model construction framework supporting model generalization and continuous improvement: A pilot study
支持模型泛化和持续改进的多中心协同预测模型构建框架的建立和评估:试点研究
  • DOI:
    10.1016/j.ijmedinf.2020.104173
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    International Journal of Medical Informatics
  • 影响因子:
    4.9
  • 作者:
    Yu Tian;Weiguo Chen;Tianshu Zhou;Jun Li;Kefeng Ding;Jingsong Li
  • 通讯作者:
    Jingsong Li
Method of Tumor Pathological Micronecrosis Quantification via Deep Learning from Label Fuzzy Proportions
基于标签模糊比例深度学习的肿瘤病理微坏死量化方法
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    IEEE JOURNAL OF BIOMEDICAL AND HEALTH INFORMATICS
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Qiancheng Ye;Qi Zhang;Yu Tian;Tianshu Zhou;Hongbin Ge;Jiajun Wu;Na Lu;Xueli Bai;Tingbo Liang;Jingsong Li
  • 通讯作者:
    Jingsong Li

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其他文献

Indirect feed type omnidirectional printed antenna with radiant load
带辐射负载的间接馈电式全向印刷天线
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2012-08-07
  • 期刊:
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    林澍;刘梦芊;刘曦;林怡琛;陆加;马欣茹;田雨
  • 通讯作者:
    田雨
大连市水务智慧化依赖度研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    中国科技论文
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    田雨;蒋云钟
  • 通讯作者:
    蒋云钟
硝普钠对高胆固醇血症兔Oddi括约肌运动的影响
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    中华实验外科杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    谢斌;田雨;吴硕东;国星奇
  • 通讯作者:
    国星奇
智慧水务建设需求探析
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    清华大学学报(自然科学版)
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    杨明祥;蒋云钟;田雨;王浩
  • 通讯作者:
    王浩
Holographic Thermal Relaxation in Superfluid Turbulence
超流体湍流中的全息热弛豫
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    Journal of High Energy Physics
  • 影响因子:
    5.4
  • 作者:
    杜以强;牛超;田雨;张宏宝
  • 通讯作者:
    张宏宝

其他文献

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田雨的其他基金

基于多中心临床数据的疾病演进图谱构建及应用研究
  • 批准号:
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    2021
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  • 项目类别:
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相似国自然基金

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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