基于表观遗传学IDH1/2基因突变及相关代谢物的急性髓细胞白血病预后体系的完善及药物干预

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    81370653
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    70.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H0809.白血病
  • 结题年份:
    2017
  • 批准年份:
    2013
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2014-01-01 至2017-12-31

项目摘要

Acute myeloid leukemia (AML) is a group of heterogeneous diseases whose clinical behavior and prognosis are strictly associated with the underlying molecular events. In our previous study, we have launched a large scale examination on the distribution and frequencies of the gene mutational status and analyzed the prognostic value of up-mentioned parameters in cytogenetic normal AML patients and proved that the mutations associated with epigenetic regulation. In our preliminary results, we have proved that epigenetic changes are important high risk factors for the prognosis of AML and the patients carry the mutations related with modulation of methylation share an individualized clinical phenotype and poor prognosis. Furthermore, we proved that IDH1/2 mutations and their metabolomic parameters such as 2-HG were all related with the poor prognosis of AML and clinically related with some other important gene events in this disease. In this study, we will: 1)import the gene expression level changes associatered with methylation to improve our established epigenetic based prognostic system and screen the biomarkers associated with the disease progress; 2)intervene with IDH1/2 mutations in AML cell lines and animal models to investigate the relationship of these mutations and 2-HG level, biological behavior of AML and chemosensitivity. We would like to explore the efficacy of non-chemotherapeutic demethylation stratedy and establish a theoretic basis of the relationship of the epigenetic changes and the leukemogenesis of AML and its related targeted therapy.
急性髓细胞白血病(AML)是一组异质性较强的疾病,分子生物学异常与疾病发病和预后密切相关。我们的前期研究在大样本AML患者中进行了大规模基因突变检测,证实表观遗传学调控基因突变是AML重要的高危因素,具有甲基化调控基因突变的患者具有独特的临床表型和转归变化。我们的深入研究发现,表观遗传学基因IDH1/2及其代谢物2-HG提示AML预后不良,且与若干AML基因事件存在相关性。在前期研究的基础上,我们拟:1)进一步完善基于甲基化调控基因的AML的预后体系,引入与甲基化有关的基因表达水平的变化,筛选与疾病进展显著相关的标志物组合;2)在AML细胞株及动物模型中,通过调控IDH1/2基因,研究其与2-HG水平、AML细胞生物学行为和化疗敏感程度的相关性,并探索非化疗药物去甲基化药物干预的疗效,为深入阐明甲基化调控AML发病的具体分子机制及制定相应的表观遗传学靶向治疗策略打下理论基础。

结项摘要

急性髓细胞白血病(acute myeloid leukemia, AML)是一种异质性较强的血液系统恶性疾病。细胞遗传学异常广泛认为是AML临床行为和预后分层的重要标志,但多数AML患者缺乏典型的具有预后价值的核型变化。随着AML的风险调整治疗越来越在疾病的分层治疗上呈现重要价值,在目前没有预后标志的AML中发现新的分子标志日益显得重要。 为此我们收集了1300例AML患者,结合基因突变、基因表达水平、表观遗传学基因数据与临床病例资料进行统计学分析,并对其与预后的关系进行了系统性的研究。.在535例初发APL患者中,相比于中低预后的APL患者,更多的高危患者同时携带有除PML-RARA外的基因突变。同时我们发现,表观修饰相关基因(EMG)的突变与不良预后密切相关,具有这些突变的患者无病生存率要显著低于一般患者。因此,我们认为在ATRA/ATO联合治疗APL的时代,以EMG为代表的分子标志与基于临床指标的预后分型系统应当同时运用于对APL预后的判断。.在205例CBF-AML患者中,有40%患者都携带有一种或以上基因突变,其中C-KIT、NRAS、CEBPA是突变率较高的三个基因,分别为26.8%、8.8%、8.8%,而FLT3的突变率较低,约1%。在I类激酶相关的基因中,同类基因共突变的情况比较常见,且在不同人群及不同亚类CBF白血病之间的分布存在一定差异。.在560例初发AML(非M3)患者中,我们发现一些基因表达量与细胞遗传学异常有关,尤其是MECOM、MEIS1和BAALC。FLT3、CKIT、NRAS在不同MEIS1、WT1、GATA2和BAAL基因表达水平时有着不同的突变频率。FLT3、DNMT3A、NPM1、双等位CEBPA基因突变都影响预后。单因素分析和多因素分析显示当MECOM基因、MEIS1基因高表达时对总体生存率、无病生存率、完全缓解率都有明显的影响,当两个基因同时高表达时还有叠加效应。.总之,我们通过系统性整合基因突变、基因表达量、表观遗传学改变等因素以期建立了更加全面精细的AML预后分层系统。

项目成果

期刊论文数量(5)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Mutations of Epigenetic Modifier Genes as a Poor Prognostic Factor in Acute Promyelocytic Leukemia Under Treatment With All-Trans Retinoic Acid and Arsenic Trioxide.
表观遗传修饰基因突变是全反式视黄酸和三氧化二砷治疗急性早幼粒细胞白血病的不良预后因素。
  • DOI:
    10.1016/j.ebiom.2015.04.006
  • 发表时间:
    2015-06
  • 期刊:
    EBioMedicine
  • 影响因子:
    11.1
  • 作者:
    Shen Y;Fu YK;Zhu YM;Lou YJ;Gu ZH;Shi JY;Chen B;Chen C;Zhu HH;Hu J;Zhao WL;Mi JQ;Chen L;Zhu HM;Shen ZX;Jin J;Wang ZY;Li JM;Chen Z;Chen SJ
  • 通讯作者:
    Chen SJ
Kinase-associated gene mutation pattern and clinical relevance in 205 patients with core binding factor leukemias.
205 例核心结合因子白血病患者的激酶相关基因突变模式和临床相关性。
  • DOI:
    10.1038/bcj.2016.107
  • 发表时间:
    2016-11-11
  • 期刊:
    Blood cancer journal
  • 影响因子:
    12.8
  • 作者:
    Chen YS;Wang PP;Hu Y;Zhu YM;Chen B;Huang JY;Li JM;Weng XQ;Yu Y;Shen Y
  • 通讯作者:
    Shen Y
Gene mutational pattern and expression level in 560 acute myeloid leukemia patients and their clinical relevance.
560例急性髓系白血病患者基因突变模式及表达水平及其临床意义
  • DOI:
    10.1186/s12967-017-1279-4
  • 发表时间:
    2017-08-22
  • 期刊:
    Journal of translational medicine
  • 影响因子:
    7.4
  • 作者:
    Zhu YM;Wang PP;Huang JY;Chen YS;Chen B;Dai YJ;Yan H;Hu Y;Cheng WY;Ma TT;Chen SJ;Shen Y
  • 通讯作者:
    Shen Y
Clinical and prognostic analysis of 78 patients with human immuno-deficiency virus associated non-Hodgkin's lymphoma in Chinese population.
中国人群人类免疫缺陷病毒相关非霍奇金淋巴瘤78例临床及预后分析
  • DOI:
    10.1186/s13027-017-0120-2
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    Infectious agents and cancer
  • 影响因子:
    3.7
  • 作者:
    Shen Y;Zhang R;Liu L;Shen Y;Song W;Qi T;Tang Y;Wang Z;Guan L;Lu H
  • 通讯作者:
    Lu H

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    --
  • 作者:
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  • 通讯作者:
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沈杨的其他基金

IKZF1突变在急性髓系白血病发病及治疗中的功能和机制研究
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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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