基于矢量药理网络的中药寒热属性分类模型构建及药性混淆品种寒热属性厘清

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

项目摘要

There is an urgent demand to build a cold/heat property classification model to facilitate the property theory of Chinese herbal medicine, as well as to clarify the controversial properties of some herbs. Based on the previous NSFC project (No. 30902003), we have established a cold/heat property classification model based on chemical structure profile, besides reviewing other previous studies worldwide. It was concluded that bio-effect should be the key approach to classify the cold and heat properties of herbal medicines. In this study, metabonomics and proteomics techniques will be used to test the serum of SD rats before and after treatment with 5 herbs with typical cold property and another 5 herbs with typical heat property. The omics data will then be collected and analyzed with bioinfomatics approach. Vectorial pharmacological networks of both cold and heat herbs will be built up based on these data, which will contain qualitative and quantitative information of the herbal bio-effect. The vectorial networks will be analyzed using topological structure, key nodes identification, and central subnetwork extraction. Characteristics of pharmacological networks of cold and heat herbs will be identified. Then pattern recognition approaches will be adopted, including template matching algorithm, K near algorithms, and stochastic subspace preferred strategy, to build the cold/heat property classification model based on the bio-effect parameters extracted from network analysis. Four herbs of controversial properties will be selected as target herbs to treat SD rats with the same methods mentioned above. The vectorial pharmacological networks of these herbs will be built up and analyzed. The cold/heat property of these target herbs will be determined with this classification model. This study will provide a scientific model for determination the cold/heat property of herbal medicines, and a new strategy for expanding the Chinese herbal medicine resources as well.
建立科学可靠的药物寒热属性分类方法是药性理论发展的需求,更可为厘清药性混淆品种的寒热属性提供有效方法。项目组前期自然基金项目(30902003)建立了依据药物化学结构谱的中药寒热属性分类模型,并分析了其他药性判别模型,发现从生物效应角度是有效区分中药寒/热属性的最重要方向。本研究拟应用典型寒/热中药干预大鼠前后的代谢组和蛋白质组学实证数据,应用生物信息技术构建含有效应方向与强度信息的中药寒/热性药物的矢量药理网络,利用生物网络分析技术分析网络拓扑结构,识别关键节点、提取中心亚网络信息,对比提取寒、热性药物的药理网络特征;应用模式识别技术,采用模板匹配与K紧邻算法和随机子空间优选策略,构建基于药理网络的中药寒热属性分类模型;选择寒热属性混淆的中药,同样利用干预前后组学数据,构建其矢量药理网络,利用构建的模型厘清其寒热属性,为判定中药寒热属性提供科学方法,也为拓展中药新资源提供策略。

结项摘要

中药寒热属性的科学基础研究一直是中医药学科的关键问题,以客观科学数据定性定量研究中药寒热属性的分类原理是该领域的重要方向。本研究选择典型寒性中药(大黄、黄芩、黄连、黄柏、龙胆草)、热性中药(附子、肉桂、干姜、吴茱萸、仙茅)各5味,以其对SD大鼠进行干预,对比观察给药21天前后各组大鼠的一般状况、脏器系数、行为学、血液生化指标等变化;应用非靶向代谢组学分析技术,全面分析典型寒/热性药物作用于SD大鼠前后的血清代谢物谱,探索与药物寒热属性相关的代谢物。应用网络药理学方法,构建典型寒/热性药物的药理网络,对比典型寒热性中药组的特异性作用靶点和生物学信号通路。结合主成分分析、支持向量机、自组织神经网络等方法,基于所得的寒/热性药物代谢性药理网络数据构建药物寒热属性的分类模型,并应用该模型对于寒热属性不清的四味目标药物的寒热属性进行判定:人参:寒-平;薄荷:寒;姜黄:寒;丹参:平。对于分组有高权重的寒、热性药物干预后变化趋势相同的代谢物为:Myoinositol,L-Valine,L-Leucine,L-Proline,Methylcysteine,L-Arginine,3-Nitrotyrosine,L-Arabinose,L-Arabitol,Ratio of Glucose 6-phosphate/D-Glucose,Ratio of Tryptamine/L-Tryptophan;变化趋势相反的代谢物为:2-Hydroxypyridine,Homocysteine,Ratio of Ornithine/L-Arginine,Ratio of L-Arabinose/L-Arabitol,Tryptamine,Glycolic acid,Maleic acid,Ratio of Oxoglutaric acid/Isocitric acid,Unknown_14。为中药寒热属性的生物效应表征指标体系建设提供方法依据,为拓展中药资源提供寒热药性判断方法,推进药性理论发展。.发表学术论文7 篇,其中SCI 收录3篇、中文核心期刊论文4篇;已接收中文核心论文2篇待发表;在投SCI论文1篇;正在撰写SCI论文1篇。参加美国夏威夷大学学术交流活动3次,就研究设计、检测方法进行讨论,扩大中医药研究的国际影响力;培养博士研究生一名、硕士研究生一名;申请中国发明专利2项。

项目成果

期刊论文数量(9)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(2)
基于网络药理学方法的中药寒/热性药物特异性作用分子机制研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    中国中医基础医学杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    韩森;李城;魏佩煌;李诺;李立;赵雨坤;姜淼;李健
  • 通讯作者:
    李健
高血压病症状、证候及针刺治疗规律在2005年前后变化的文本挖掘研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    环球中医药
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    韩森;李立;王耀献;周红梅;崔赵丽;赵雨坤;陈则旭;李健;姜淼;丁治国;郑光
  • 通讯作者:
    郑光
基于文本挖掘方法对比2005年前后高血压病“证-法-方药”差异
  • DOI:
    10.13192/j.issn.1000-1719.2018.05.003
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    辽宁中医杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    李立;郑光;王耀献;杜雅薇;周红梅;崔赵丽;赵雨坤;陈则旭;韩森;姜淼;丁治国
  • 通讯作者:
    丁治国
网络药理学在中药药性理论研究中的应用概述
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    中国中医基础医学杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    韩森;吕爱平;李健;姜淼
  • 通讯作者:
    姜淼
基于文本挖掘技术初步探讨雷公藤应用相关的生物学基础
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    中国中医基础医学杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    展俊平;郑光;孟庆良;谷慧敏;左瑞庭;吕诚;姜淼
  • 通讯作者:
    姜淼

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其他文献

紫癜性肾炎患儿血清IgA1通过系膜细胞-足细胞轴对足细胞增殖及TNF-α分泌的影响
  • DOI:
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  • 作者:
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  • 通讯作者:
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丹红注射液治疗特发性肺纤维化临床疗效及安全性的Meta分析
  • DOI:
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  • 发表时间:
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  • 期刊:
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  • 作者:
    辛丽丽;姜淼;张赓;龚婕宁
  • 通讯作者:
    龚婕宁
文本挖掘探索慢性肾小球肾炎“证-症-方-药”相应规律
  • DOI:
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  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
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  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    展俊平;郑光;姜淼;杨静;吕诚;何晓鹃;吕爱平
  • 通讯作者:
    吕爱平
大鼠肝再生过程中肝细胞质膜微区差异蛋白质鉴定与分析
  • DOI:
    10.13865/j.cnki.cjbmb.2014.08.09
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    中国生物化学与分子生物学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    蔡乃旋;李江林;姜淼;王紫珺;李梅香;王迎;王贤纯;陈平
  • 通讯作者:
    陈平
基于文本挖掘技术的肥胖和高脂血症处方规律研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    中国实验方剂学杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    黄允瑜;陈慕芝;郑光;郭洪涛;姜淼;赵宏艳
  • 通讯作者:
    赵宏艳

其他文献

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姜淼的其他基金

基于靶向胆汁酸代谢组学探索实热证胆结石病发病预警信号
  • 批准号:
    81873181
  • 批准年份:
    2018
  • 资助金额:
    56.0 万元
  • 项目类别:
    面上项目
基于生物网络构建技术探索中药寒热属性的科学基础
  • 批准号:
    30902003
  • 批准年份:
    2009
  • 资助金额:
    20.0 万元
  • 项目类别:
    青年科学基金项目

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  • 批准号:
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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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