基于HRMS/MSn数据集挖掘技术的斑马鱼体内ADME分析策略的建立及其在中药降糖药效物质群快速筛选中的应用
项目介绍
AI项目解读
基本信息
- 批准号:81773688
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:61.5万
- 负责人:
- 依托单位:
- 学科分类:H3410.药物分析
- 结题年份:2021
- 批准年份:2017
- 项目状态:已结题
- 起止时间:2018-01-01 至2021-12-31
- 项目参与者:朱明社; 吴云龙; 徐阳; 刘杰; 丁蓉; 尧捷; 王培钰; 廖祖健; 张帅帅;
- 关键词:
项目摘要
ADME studies, an essential part of drug discovery, play a fundamental constructive role in the exploration of in vivo effective and toxic substances in drugs. How to study ADME process of complex systems such as Traditional Chinese Medicine (TCM) in a high-throughput manner remains a challenge in biopharmaceutical analysis. Funded previously by National Scientific Fund for Young Scientists, the applicant has formulated a preliminary integrated approach for studying Absorption, Distribution, Metabolism and Excretion, (ADME) based on multiple HRMS/MSn dataset mining techniques. In this work a high-throughput screening platform for drug discovery in zebra fish will be developed for the study of classic compound prescriptions and Chinese patent medicines used in the treatment of Diabetes. MS dataset mining techniques, multi-information statistical treatment and other methods will be integrated to construct a brand new, high performance rapid screening system for the screening of antidiabetic substances (group) from TCM. Computer aided target fishing combined with metabonomics, proteomics, systematic biology and other related techniques will be applied to study the molecular mechanism of active substances (group). The success of this project will provide an analysis technical support and research pattern reference for the study of pharmacodynamic material basis of TCM and the discovery of active lead compounds from TCM.
药物ADME研究是新药研发的重要内容,对揭示药物体内的药效物质和毒性物质具有很好的指导意义。中药由于其成分复杂多样,如何高效的开展中药的ADME研究,是体内药物分析学家一直关注的热点和难点。申请人前期在国家自然科学基金青年科学基金的资助下,初步构建了一种基于多种HRMS/MSn数据集挖掘技术研究中药入体成分ADME全过程的策略。本项目拟在此基础上,利用可作为药物高通量筛选的斑马鱼为模式动物,以中药治疗糖尿病(消渴病)的经典复方和中成药为研究对象,综合运用质谱数据集挖掘技术、多元信息统计处理等研究方法,构建全新、高效的中药降糖药效物质(群)快速筛选体系。采用计算机辅助找靶结合代谢组学、蛋白质组学以及系统生物学等相关技术,研究药效物质(群)作用的分子机制。项目的成功实施,将为研究中药药效物质基础和寻找中药来源的活性先导化合物提供分析技术支撑和研究模式的参考。
结项摘要
中药(Traditional Chinese medicine, TCM)是中华民族的文化瑰宝。由于中药成分复杂,其原型成分可能受环境或制剂因素影响而发生改变,且入体后经过复杂的生物转化后会产生更多代谢物,加上生物基质的复杂性,目前已开发的药物体内吸收、分布、代谢、排泄(Absorption, Distribution, Metabolism, Excretion, ADME)研究策略局限性大,分析效率低。因此,中药药效物质基础研究一直是中药现代化研究中的热点和难点问题。本项目中,我们整合高分辨智能数据采集(HRMS/MS)、数据挖掘、网络药理学和计算机辅助找靶等技术,建立了一套新型的非靶向中药体内药效成分筛选体系,并成功运用于快速筛选消渴丸体内药效物质基础的研究。.首先,我们运用新型BE-DDA数据采集技术和非靶向PATBS数据挖掘技术建立快速识别和鉴定复杂生物基质中未知中药组分的分析流程。成功从斑马鱼体内快速筛选到53个(斑马鱼体内34个,饲养液中19个)消渴丸相关物质。通过质谱成像技术研究体内分布情况,我们发现消渴丸代谢物芒柄花黄素葡萄糖醛酸结合物主要分布于斑马鱼的胃肠道和头部。接着采用计算机辅助搜索作用靶点,计算机模拟蛋白-分子反向对接等技术对体内暴露量较大的5个成分(葛根素,大豆苷元,芒柄花黄素,五味子甲素和格列本脲)快速进行活性预测。发现这5个化合物能够靶向与糖尿病综合征相关的PI3K-Akt信号通路,II型糖尿病,TNF信号通路,胰岛素抵抗等信号通路,改善糖尿病症状。最后用转基因斑马鱼建立糖尿病模型,再次验证预测结果,发现这5个化合物确实有降糖活性。同时,还用新建的ADME分析策略对消渴丸大鼠体内的代谢物进行了全面分析,共检测到192个(仅存在血浆中的化合物84个,尿液中77个)化合物。对比发现两种动物模型体内消渴丸主要暴露成分十分相似。本项目首次利用BE-DDA和PATBS化合物识别技术和网络药理学活性筛选技术进行体内消渴丸功效成分的快速筛选研究,为快速开展中药体内ADME研究提供了新的视角,为揭示中药体内复杂代谢机制提供了参考模板。
项目成果
期刊论文数量(9)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Identifying potential anti-COVID-19 pharmacological components of traditional Chinese medicine Lianhuaqingwen capsule based on human exposure and ACE2 biochromatography screening.
基于人体暴露和ACE2生物色谱筛选鉴定中药连花清瘟胶囊潜在抗COVID-19药理成分
- DOI:10.1016/j.apsb.2020.10.002
- 发表时间:2021-01
- 期刊:Acta pharmaceutica Sinica. B
- 影响因子:--
- 作者:Chen X;Wu Y;Chen C;Gu Y;Zhu C;Wang S;Chen J;Zhang L;Lv L;Zhang G;Yuan Y;Chai Y;Zhu M;Wu C
- 通讯作者:Wu C
Artificial intelligence and network pharmacology based investigation of pharmacological mechanism and substance basis of Xiaokewan in treating diabetes
基于人工智能和网络药理学研究消渴丸治疗糖尿病的药理机制和物质基础
- DOI:10.1016/j.phrs.2020.104935
- 发表时间:2020-09-01
- 期刊:PHARMACOLOGICAL RESEARCH
- 影响因子:9.3
- 作者:Zhu, Chunyan;Cai, Tingting;Zhu, Mingshe
- 通讯作者:Zhu, Mingshe
HRPIF data mining based on data-dependent/independent acquisition for Rhei Radix et Rhizoma metabolite screening in rats.
基于数据依赖/独立采集的 HRPIF 数据挖掘,用于大鼠大黄代谢物筛选。
- DOI:10.1016/j.jchromb.2021.123095
- 发表时间:2022
- 期刊:J Chromatogr B Analyt Technol Biomed Life Sci
- 影响因子:--
- 作者:Chen Jiayun;Ding Rong;Jin Ying;Zhu Chunyan;Jiang Xiaojuan;Wang Suping;Li Zhen;Li Weihua;Wu Caisheng
- 通讯作者:Wu Caisheng
Improved Pharmacokinetics of Icariin (ICA) within Formulation of PEG-PLLA/PDLA-PNIPAM Polymeric Micelles
PEG-PLLA/PDLA-PNIPAM 聚合物胶束配方中淫羊藿苷 (ICA) 的药代动力学得到改善
- DOI:10.3390/pharmaceutics11020051
- 发表时间:2019-02-01
- 期刊:PHARMACEUTICS
- 影响因子:5.4
- 作者:Han, Lu-Ying;Wu, Yun-Long;Yang, Chun-Rong
- 通讯作者:Yang, Chun-Rong
Cationic polymeric nanoformulation: Recent advances in material design for CRISPR/Cas9 gene therapy
阳离子聚合物纳米制剂:CRISPR/Cas9 基因治疗材料设计的最新进展
- DOI:10.1016/j.pnsc.2019.10.003
- 发表时间:2019-12-01
- 期刊:PROGRESS IN NATURAL SCIENCE-MATERIALS INTERNATIONAL
- 影响因子:4.7
- 作者:Chen, Kaifeng;Jiang, Shan;Wu, Caisheng
- 通讯作者:Wu, Caisheng
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