南海北部沉积环境海洋放线菌生物多样性研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号：
    40906075
  • 项目类别：
    青年科学基金项目
  • 资助金额：
    22.0万
  • 负责人：
    田新朋
  • 依托单位：
    中国科学院南海海洋研究所
  • 学科分类：
    D0604.生物海洋学与海洋生物资源
  • 结题年份：
    2012
  • 批准年份：
    2009
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2010-01-01 至2012-12-31

项目摘要

放线菌是微生物活性次生代谢产物的主要产生菌，由于陆生放线菌50多年的研究，其活性天然产物发现重复几率已达95％。海洋占地球面积70％，研究发现海洋来源的放线菌多数产生抗菌、抗肿瘤等活性代谢产物，且很多为新颖先导化合物，表现出活性强、毒性小或无毒等良好药源特性。本项目拟以多年采集的南海北部沉积物样品为基础，对南海北部结核区，冷泉区等多种沉积环境放线菌进行分离方法、生物学特性和系统分类学研究，并结合克隆文库和DGGE等现代分子生物学手段对沉积环境放线菌资源和多样性进行探索性研究。通过本项目的实施，可以从纯培养和免培养两个方面探明南海北部沉积环境放线菌资源储备情况及其开发潜力；进一步完善海洋放线菌的纯培养和免培养研究技术，发现新物种并进行分类鉴定，为今后深入研究我国海洋放线菌生态分布、资源评价和开发利用等提供可靠的技术保障和充分的菌种资源。

结项摘要

项目实施3年时间共采集南海北部沉积物样品60多份，通过大量的分离实践，基本建立无需抗生素等抑制剂的沉积样品热处理选择性分离放线菌的预处理方法，密度梯度离心方法和5种选择性分离培养基；重点普查了我国南海北部沉积环境放线菌的多样性、分布及其抗生活性的情况。发现了48个属219个种海洋放线菌菌株1520株，其中新物种27个，且不同深度放线菌分布有明显差异。酶活结果显示出87%的微生物具有酶活，76%的测试菌株具有卤虫致死毒性，10多株菌在课题组进行了深入的次生代谢产物分析，其中4株菌进行了全基因组测序，进行了深入代谢途径分析。项目实施期间共发表SCI文章10篇，申请专利5项，获得广东省科学技术一等奖1项，完成既定目标。

项目成果

期刊论文数量（11）
专著数量（0）
科研奖励数量（1）
会议论文数量（0）
专利数量（4）
Streptomyces oceani sp nov., a new obligate marine actinomycete isolated from a deep-sea sample of seep authigenic carbonate nodule in South China Sea
Streptomyces oceani sp nov.，从南海渗流自生碳酸盐结核深海样本中分离出的一种新的专性海洋放线菌
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    Antonie Van Leeuwenhoek International Journal of General and Molecular Microbiology
  • 影响因子：
    2.6
  • 作者：
    Tian; Xin-Peng;Xu; Ying;Zhang; Jing;Li; Jie;Chen; Zhong;Kim; Chang-Jin;Li; Wen-Jun;Zhang; Chang-Sheng;Zhang; Si
  • 通讯作者：
    Si
Streptomyces nanhaiensis sp nov., a marine streptomycete isolated from a deep-sea sediment
南海链霉菌 (Streptomyces nanhaiensis sp nov.)，一种从深海沉积物中分离出来的海洋链霉菌
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology
  • 影响因子：
    2.8
  • 作者：
    Tian; Xin-Peng;Long; Li-Juan;Wang; Fa-Zuo;Xu; Ying;Li; Jie;Zhang; Jing;Zhang; Chang-Sheng;Zhang; Si;Li; Wen-Jun
  • 通讯作者：
    Wen-Jun
Streptomyces glycovorans sp nov., Streptomyces xishensis sp nov and Streptomyces abyssalis sp nov., isolated from marine sediments
从海洋沉积物中分离出的食糖链霉菌、西山链霉菌和深渊链霉菌
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    Int J Syst Evol Microbiol
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    Ying Xu;Jie He;Xin Peng Tian;Jie Li;Si Zhang;Wen Jun Li
  • 通讯作者：
    Wen Jun Li
Pseudonocardia antitumoralis sp. nov., a new deoxynyboquinone-producing actinomycete isolated from a deep-sea sedimental sample in South China Sea
抗肿瘤假诺卡氏菌
  • DOI：
    10.1111/pbi.12635
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    Int J Syst Evol Microbiol
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    Xin Peng Tian;Li Juan Long;Su Mei Li;Jing Zhang;Ying Xu;Si Zhang
  • 通讯作者：
    Si Zhang
Pseudonocardians A-C, New Diazaanthraquinone Derivatives from a Deap-Sea Actinomycete Pseudonocardia sp SCSIO 01299
假诺卡氏菌 A-C，来自深海放线菌的新二氮杂蒽醌衍生物 假诺卡氏菌 sp SCSIO 01299
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    Marine Drugs
  • 影响因子：
    5.4
  • 作者：
    Li; Sumei;Zhang; Si;Ju; Jianhua;Zhang; Changsheng;Tian; Xinpeng;Niu; Siwen;Zhang; Wenjun;Chen; Yuchan;Zhang; Haibo;Yang; Xianwen;Zhang; Weimin;Li; Wenjun
  • 通讯作者：
    Wenjun

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其他文献

海洋源放线菌Streptomyces sp. SCSIO 01681次级代谢产物的研究
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2015
  • 期刊：
    中国海洋药物
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    张幸;桂春;田新朋;黄洪波;鞠建华
  • 通讯作者：
    鞠建华
深海放线菌Actinomadura sp.01119的代谢产物研究
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2014
  • 期刊：
    天然产物研究与开发
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    田新朋;周雪峰;徐石海;刘永宏
  • 通讯作者：
    刘永宏
一份南海深海沉积物样品中可培养细菌的多样性
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2018
  • 期刊：
    生物资源
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    陈柔雯;王可欣;何媛秋;田新朋;龙丽娟
  • 通讯作者：
    龙丽娟
中国南海沉积环境可培养细菌多样性研究
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2014
  • 期刊：
    微生物学通报
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    刘玉娟;田新朋;黄小芳;龙丽娟;张偲
  • 通讯作者：
    张偲
海洋放线菌Marinactinospora thermotolerans的研究进展
  • DOI：
    10.13344/j.microbiol.china.160959
  • 发表时间：
    2017
  • 期刊：
    微生物学通报
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    陈柔雯;谢运昌;田新朋
  • 通讯作者：
    田新朋

其他文献

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海洋放线菌来源PET高效降解酶ScCut效能和产量提升研究
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课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
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