华癸中生根瘤菌7653R共生固氮新基因dmtH的鉴定和功能研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    30970074
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    30.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0104.微生物遗传与生物合成
  • 结题年份:
    2012
  • 批准年份:
    2009
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2010-01-01 至2012-12-31

项目摘要

本研究基于前期工作基础,以华癸中生根瘤菌7653R共生固氮相关新基因dmtH为研究对象。拟根据同源基因设计适当引物,通过PCR 方法克隆目标基因的完整序列。并构建dmtH基因插入失活的华癸中生根瘤菌7653R稳定突变体,结合功能互补研究该基因在共生固氮过程中的功能。进一步完成dmtH基因的超表达、蛋白纯化和转甲基酶活性体外测定。最后采用实时荧光定量PCR技术,比较研究该基因在共生(类菌体)和自生(根瘤菌)条件下的时空表达特征。从而获得直接有力的实验证据阐明该新基因参与类菌体和共生体分化、固氮及根瘤早衰的功能机制。..本申请项目的预期完成可为持续、深入地研究类菌体能量代谢和探究其电子传递新途径打下良好的工作基础。也将为类菌体(共生)和根瘤菌(自生)生理代谢和固氮基因表达的差异研究领域提供一些新进展。

结项摘要

根瘤菌具有复杂的分支电子传递网络以适应不同生活环境。一般认为根瘤菌以泛醌(UQ),而不是甲基萘醌(MK),作为电子传递载体。基于前期工作中已构建的华癸根瘤菌7653R基因组 Tn5转座子突变体库,本项目克隆与鉴定出共生固氮相关新基因dmtH,分析预测其编码去甲基甲基萘醌(DMK)甲基转移酶,催化MK的生物合成。为研究dmtH的共生固氮功能,本项目构建了dmtH插入失活突变株HK116,结果表明突变株HK116与宿主植物紫云英共生时形成无效根瘤;竞争结瘤能力降低;类菌体数量及形态结构发育异常;PHB积累。互补菌株能够恢复HK116的共生表型。上述结果确证了dmtH为7653R共生固氮所必需。dmtH突变对7653R生长代时、形态和碳源利用等自生培养时的生理特性无影响,但显著影响微氧条件下的聚-β-羟基丁酸(PHB)代谢。荧光定量PCR检测表明dmtH在类菌体中呈共生诱导、特异性表达特征。对7653R和突变株HK116中的醌组分进行了提取,高压液相色谱与质谱鉴定分析发现:好氧培养时7653R仅积累UQ-10;微氧培养时则合成MK,但HK116中却无甲基萘醌产生。结果表明7653R类菌体在共生固氮条件下以甲基萘醌MK作为特异的呼吸电子传递载体。利用大肠杆菌ubiE突变株细胞抽提物作为反应底物进行了体外酶活测定,发现在酶促反应产物的醌提取物中确实具有MK-8产物的形成。结果表明DmtH蛋白能够催化SAM转移甲基至DMK,从而合成MK,具有转甲基酶活性。本项目首次阐明7653R在共生固氮时可以MK作为电子传递载体;揭示了dmtH突变导致类菌体呼吸产能受阻、发育异常,从而无法行使共生固氮功能的作用机制。本项目研究结果为类菌体生理代谢及固氮基因的差异表达研究领域提供了创新进展;为深入探究类菌体电子传递新途径奠定了良好的工作基础。

项目成果

期刊论文数量(2)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(2)
专利数量(0)
Identification of a novel gene for biosynthesis of a bacteroid-specific electron carrier menaquinone.
类杆菌特异性电子载体甲萘醌生物合成新基因的鉴定
  • DOI:
    10.1371/journal.pone.0028995
  • 发表时间:
    2011
  • 期刊:
    PloS one
  • 影响因子:
    3.7
  • 作者:
    Xie F;Cheng G;Xu H;Wang Z;Lei L;Li Y
  • 通讯作者:
    Li Y
与紫云英结瘤受体激酶相互作用靶蛋白的筛选鉴定
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    华中农业大学学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    王宁;李一星;刘燕;陈大松;李友国
  • 通讯作者:
    李友国

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其他文献

华癸根瘤菌7653R中一个RND型药物外排泵的功能表型及调控鉴定
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  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
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  • 作者:
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  • 通讯作者:
    李友国
紫云英根瘤中特异表达CCPs基因的同源分析及表达定位
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  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    华中农业大学学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
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  • 通讯作者:
    李友国
基于根瘤菌来源的ACC脱氨酶基因提高大豆和紫云英根瘤菌的竞争结瘤能力
  • DOI:
    10.19675/j.cnki.1006-687x.2019.04035
  • 发表时间:
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  • 期刊:
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  • 影响因子:
    --
  • 作者:
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  • 通讯作者:
    李友国
华癸中慢生根瘤菌7653R 3个脂质转运蛋白基因的克隆、突变及共生表型
  • DOI:
    10.13343/j.cnki.wsxb.20160134
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
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  • 影响因子:
    --
  • 作者:
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  • 通讯作者:
    李友国
根瘤菌固氮系统调控的分子机理
  • DOI:
    10.3772/j.issn.1009-5659.2015.21.014
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    中国科技成果
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    张忠明;李友国;朱辉;朱军;钟增涛
  • 通讯作者:
    钟增涛

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李友国的其他基金

紫云英NCR基因新家族发掘及调控类菌体分化固氮的功能机制研究
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AI项目解读示例

课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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