水稻花穗原基发生和生殖器官发育中AGP基因功能的研究

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AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31170171
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    65.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0207.植物生殖与发育
  • 结题年份:
    2015
  • 批准年份:
    2011
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2012-01-01 至2015-12-31
  • 项目参与者:
    马浩力; 胡天翔; 赵合明; 禹苗; 邓颖天; 刘扬; 马腾飞; 陈洪宇; 李刚;
  • 关键词:

项目摘要

阿拉伯半乳糖蛋白(AGPs)是一类富含羟脯氨酸的糖蛋白。在本人前期研究中预测并鉴定了69个水稻AGP基因,发现了若干可能参与水稻花穗和生殖器官发育的重要AGP基因,但目前国际上未见相关研究报道。因此,我们基于这一思路和前期研究基础,本项研究以重要的粮食作物和遗传背景清楚的模式植物水稻为材料,采取基因克隆与表达、转基因技术、原位杂交、蛋白生化分析、表型分析、细胞组织显微技术、免疫荧光等细胞和分子生物学技术,研究水稻花穗原基发生和分化、子房和花药生殖器官发育中OsAGPx,OsAGPa和OsAGPb基因的表达规律和模式、基因产物定位和分布特点、蛋白质和糖基侧链的生化特性、与相关基因的调控关系等分子机理,揭示和探讨AGP基因在水稻有性生殖发育中的分子机制和生物学功能,这一研究成果将填补水稻AGP基因功能研究的空白,具有极其重要的理论意义。预计该项研究成果发表SCI论文4-5篇,培养研究生若干名。

结项摘要

AGP基因是一类重要的富含羟脯氨酸的糖蛋白,在被子植物中起着重要的作用。我们预测并鉴定了57个新的AGPs;对AGP基因突变体和RNAi植株进行了表型、表达和生物学功能研究,获得的主要结果如下:.(1)对水稻花穗原基发生和生殖器官发育相关的、新的AGP基因的生物信息学分析,从水稻基因组中鉴定了62个植物蓝素类(PCs)AGPs基因家族成员,将它们分为类似uclacyanin的蛋白(OsUCLs),类似stellacyanin的蛋白(OsSCLs)和类似早期结瘤素的蛋白(OsENODLs)三个亚家族,其中38个AGPs基因是新的阿拉伯半乳糖蛋白基因。..(2)对水稻编码类木质形成素(XYLPs)的基因家族进行了鉴定、染色体定位和表达分析;筛选并获得了21个水稻XYLPs,其中19个基因编码的蛋白是新的AGPs,使水稻AGPs数目由98个增至117个。成功鉴定了OsXYLP7和OsXYLP16基因的T-DNA插入突变体,并对突变体进行了初步的表型分析。.对上述鉴定的基因复制分析表明,染色体片段复制和串联复制在该基因家族进化过程中产生了同等重要的作用。..(3)构建了一系列AGP基因沉默(RNAi)、超表达、CRISPR Cas9载体,利用水稻转基因技术获得了转基因植株,正在进行RNA水平鉴定和表型观察,为后续研究打下了坚实的基础。..(4)研究了AtAGP11基因超表达植株的表型特征,发现AtAGP11基因超表达导致角果败育,其原因可能是影响了花丝细胞正常生长,这暗示着AGP11基因在花丝细胞生长中发挥着重要作用。..(5)研究了花穗原基发生和生殖器官发育相关的AGPa基因的时空表达和分布模式。通过qRT-PCR和GUS染色,显示OsAGPa在生殖器官中优势表达。研究显示AGPa基因的沉默导致开花提前和花穗减少,暗示AGPa基因在花穗开花和结实中发挥着重要作用。..(6)发现水稻AGPa基因在细胞壁和维管束发育过程中发挥着重要作用;同时,通过OsAGPa基因RNAi植株的花穗轴和叶片的RNA转录组测序和生物信息学分析,发现了一些重要的基因在其中上调和下调,暗示与OsAGPa基因的调控有关联。.. 该项研究在SCI期刊上发表科学研究论文5篇,核心期刊上发表综述和研究论文2篇;授权专利一项;培养研究生多名;圆满完成了该项目的预期目标,正在进行深入的研究。

项目成果

期刊论文数量(7)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
The phytocyanin gene family in rice (Oryza sativa L.): genome-wide identification, classification and transcriptional analysis.
水稻植物青素基因家族(Oryza sativa L.):全基因组鉴定、分类和转录分析
  • DOI:
    10.1371/journal.pone.0025184
  • 发表时间:
    2011
  • 期刊:
    PloS one
  • 影响因子:
    3.7
  • 作者:
    Ma H;Zhao H;Liu Z;Zhao J
  • 通讯作者:
    Zhao J
Identification, characterization, and transcription analysis of xylogen-like arabinogalactan proteins in rice (Oryza sativa L.).
水稻 (Oryza sativa L.) 中类木质素阿拉伯半乳聚糖蛋白的鉴定、表征和转录​​分析。
  • DOI:
    10.1186/s12870-014-0299-y
  • 发表时间:
    2014-11-18
  • 期刊:
    BMC plant biology
  • 影响因子:
    5.3
  • 作者:
    Ma T;Ma H;Zhao H;Qi H;Zhao J
  • 通讯作者:
    Zhao J
Involvement of arabinogalactan proteins in cell wall formation: changes of tobacco zygotes and proembryo cells induced by beta;-glucosyl Yariv reagent
阿拉伯半乳聚糖蛋白参与细胞壁形成:烟草受精卵和原胚细胞的变化
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2012
  • 期刊:
    BMC Plant Biology
  • 影响因子:
    5.3
  • 作者:
    Yu M;Zhao J
  • 通讯作者:
    Zhao J
Roles of hydroxyproline-rich glycoproteins in pollen tube and style cell growth of tobacco (Nicotiana tabacum L.).
富含羟脯氨酸的糖蛋白在烟草花粉管和花柱细胞生长中的作用(Nicotiana tabacum L.)。
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    Journal of Plant Physiology
  • 影响因子:
    4.3
  • 作者:
    Zhang XL;Ma HL;Qi HD;Zhao J
  • 通讯作者:
    Zhao J
拟南芥AtAGP11基因超表达导致植株败育的研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
    中国科技论文
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    钟静;张雪莲;赵洁
  • 通讯作者:
    赵洁

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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