水稻和拟南芥生殖发育中RFC基因的调控机制

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AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31370348
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    82.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0207.植物生殖与发育
  • 结题年份:
    2017
  • 批准年份:
    2013
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2014-01-01 至2017-12-31

项目摘要

Replication factor C (replication factor complex, RFC) plays an important role in the DNA replication processes of human and yeast. Our previous study found that RFC1 has an important function in DNA repair in Arabidopsis female and male gametophyte development, but no other subunits of RFC function were reported. Therefore, using the model plants Arabidopsis and rice as materials, based on adopt a variety of means and our new research ideas, we will investigate biological function of RFC genes and network control relationship with the related genes in reproductive development of embryos and gametes, and explore the molecular regulation mechanism of RFC genes in DNA replication, chromatin condensation, DNA recombination, DNA repair, sister chromatid separation and other key events, revealing their functions in cell division and cell cycle. The molecular mechanism and regulation difference of RFC genes in the reproductive development of the two modes of plants will be revealed. The results of the study will fill the blank of RFC gene function in plants, and reveal the extremely important roles of RFC genes in DNA replication, recombination and repair. It is expected that the research results can be published influential papers SCI 4-5, and a lot of graduate students can be trained.
复制因子C(replication factor complex,RFC)在人类和酵母DNA复制中扮演着重要作用。本人前期研究发现,RFC1在拟南芥雌、雄配子体发生的DNA修复中具有重要功能,但目前国际上未见RFC其它亚基的相关报道。因此,我们基于前期研究基础和创新性思路,以模式植物水稻和拟南芥为材料,采取多种手段,研究胚胎、配子体等生殖发育中RFCs基因的生物学功能及其相关基因的网络调控关系;探讨RFC基因在DNA复制、染色质凝集、DNA重组、DNA修复、姐妹染色单体分离等关键事件中可能的分子调控机制,揭示其在细胞分裂和细胞周期中的功能;揭示RFC基因在两种模式植物生殖发育中的分子机理和调控差异。该研究成果将填补植物RFC基因功能研究的空白,对揭示RFC基因在DNA复制、重组和修复等重要事件中的作用具有极其重要的意义。预计该研究成果发表有影响力的SCI论文4-5篇,并培养研究生若干名。

结项摘要

复制因子(RFC,Replication factor C)复合体由5个功能非冗余的RFC1/2/3/4/5亚基组成。酵母和人类中的RFC复合体在DNA复制、姐妹染色单体黏连、细胞周期检验点及DNA损伤修复等过程行使重要功能。酵母和人类RFC复合体的结构和功能研究比较清楚。但高等植物中RFC复合体功能的报道寥寥无几。本研究以拟南芥和水稻RFCs基因为研究对象,利用生物信息学、遗传学、细胞生物学及分子生物学等技术,发现AtRFC1在配子体发育、AtRFC2/3/4/5在早期胚胎和胚乳发育中的功能;揭示拟南芥RFC1在减数分裂同源重组和DNA修复、AtRFC4在DNA复制中的生物学功能。利用突变体、水稻胚囊透明、亚细胞定位、荧光定量PCR等方法,对水稻RFC复合体各亚基的功能进行了研究,发现水稻RFC1/2/3/4均参与种子的形成过程。研究了水稻和拟南芥RFC-PCNA复合体各亚基间的互作方式和复合体形成所必需的区域,发现RFC复合体亚基的C端对其形成是必需的。主要结果以下:(1)鉴定和分析拟南芥RFC2/3/4/5基因的5个T-DNA插入突变体,发现RFC2/3/4/5任一基因的功能缺失均导致胚胎停滞在2/4细胞胚体阶段,胚乳游离核的数目较野生型显著减少。(2)发现拟南芥RFC2/3/4/5基因可能参与细胞周期的G1/S转换、DNA复制及DNA损伤修复过程。(3)对拟南芥RFC4基因的功能进行系统地研究,发现它参与DNA复制,影响胚胎、胚乳及幼苗细胞有丝分裂过程。(4)分析水稻RFC复合体的5个亚基的生物信息学、表达模式、作用元件及亚细胞定位,发现RFC复合体在真核生物中高度保守;RFCs基因在分裂旺盛的组织中优势表达;OsRFC1/4/5仅定位于细胞核中,而OsRFC2/3在细胞质和细胞核中均有分布。(5)研究水稻RFC2/3基因的2个T-DNA插入突变体,证实它们可能参与了水稻的种子发育过程。利用RNAi和CRISPR敲除技术,获得OsRFC1/2/4的功能缺失株系,证实RFC1/2/4参与了水稻种子发育过程。(6)通过研究水稻和拟南芥RFC-PCNA复合体各亚基间的互作方式和互作区段,发现它们与酵母和人类的RFC-PCNA复合体组装方式差异显著。该项研究对揭示高等植物RFC复合体的生物学功能将有重要的意义。

项目成果

期刊论文数量(4)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Functional divergence of chloroplast Cpn60α subunits during Arabidopsis embryo development.
拟南芥胚胎发育过程中叶绿体Cpn60 α亚基的功能分化
  • DOI:
    10.1371/journal.pgen.1007036
  • 发表时间:
    2017-09
  • 期刊:
    PLoS genetics
  • 影响因子:
    4.5
  • 作者:
    Ke X;Zou W;Ren Y;Wang Z;Li J;Wu X;Zhao J
  • 通讯作者:
    Zhao J
Arabidopsis replication factor C4 is critical for DNA replication during mitotic cell cycle
拟南芥复制因子 C4 对于有丝分裂细胞周期中的 DNA 复制至关重要
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    Plant Journal
  • 影响因子:
    7.2
  • 作者:
    Jie Qian;Yueyue Chen;Ying Hu;Yingtian Deng;Yang Liu;Gang Li;Wenxuan Zou;Jie Zhao
  • 通讯作者:
    Jie Zhao
Non-SMC elements 1 and 3 are required for early embryo and seedling development in Arabidopsis.
非 SMC 元件 1 和 3 是拟南芥早期胚胎和幼苗发育所必需的
  • DOI:
    10.1093/jxb/erx016
  • 发表时间:
    2017-02-01
  • 期刊:
    Journal of experimental botany
  • 影响因子:
    6.9
  • 作者:
    Li G;Zou W;Jian L;Qian J;Deng Y;Zhao J
  • 通讯作者:
    Zhao J

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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